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本课件先给出微生物生态学的定义,依次说明土壤、根际、淡水、海水、大气和极端环境中微生物的分布特点,介绍根瘤与菌根等共生关系,随后区分互生、共生、寄生、竞争、拮抗与捕食六类种间关系,最后展开碳、氮、硫、磷循环。
第八章微生物生态生态学则定义为研究生物与其周围生物和非生物环境之间相互关系的一门科学。
微生物生态学则是研究微生物与周围生物和非生物环境之间的相互关系及其在自然环境中的作用和环境因素对微生物的影响。
第一节微生物在自然界的分布第二节微生物与生物环境间的关系第八章微生物生态第三节微生物与自然界物质循环
一、土壤中的微生物第一节微生物在自然界的分布微生物种类繁多。
它们在自然界的分布非常广泛,土壤、水、空气、动植物体中均有它们的踪影,在一些极端环境中也发现有大量微生物生存。
二、水圈中的微生物三、大气中的微生物四、极端环境微生物五、动物体内的微生物六、植物体中的微生物
一、土壤中的微生物第一节微生物在自然界的分布营养物质水分空气酸碱度渗透压温度团粒结构保护作用土壤适合微生物生活的特点:土壤是自然界最丰富的微生物库。
细菌:特点:是土壤微生物中数量最大、种类最多、功能多样的类群。生物量可超过全部土壤微生物总量的1/4。
土壤细菌以异养型为主和无芽孢细菌占优势。土壤中常见的细菌属:不动杆菌(Acinetobacter)、土壤杆菌(Agrobacterium)、产碱杆菌(Alcaligenes)、节杆菌(Arthrobacter)、芽孢杆菌(Bacillus)、短杆菌(Brevibacterium)、梭状芽孢杆菌(Clostridium)、棒杆菌(Corynebacterium)、黄杆菌(Flavobacterium)、微球菌(Micrococcus)、分枝杆菌(Mycobacterium)、假单胞菌(Pseudomonas)、葡萄球菌(Staphylcoccus)黄单胞菌(Xanthomonas),柄杆菌(Caulobacter)、纤维单胞菌(Cellulomonas)等(二)土壤中微生物的群落
放线菌:占土壤细菌群体的10~33%。
真菌:数量约为103~105个/克土,但其生物量却是最大的,尤其是在通气良好的酸性土壤中。
澡类和原生动物:光能自养的蓝细菌主要分布在表土层中,酸性土壤中较少,中性到微碱性土壤中较多。蓝细菌中,有些如念珠藻在自然生境中既能固定氮气,又能通过光合作用合成有机物。
土壤中还生活有大量的藻类。原生动物多存在于有机质和微生物丰富的表层土壤中,它们是土壤细菌和藻类的捕食者,对土壤微生物尤其是细菌的数量和种类起着重要的平衡和调控作用。(二)土壤中微生物的群落
细菌病毒在土壤中分布广泛,但数量不是很多,如果其宿主细菌数目增加,那么相应的病毒数目也增加。
(二)土壤中微生物的群落
(三)根际微生物1、根际和根际微生物在植物根系影响下的独特土壤环境范围称为根际,通常围绕根2mm以内的范围。
在植物根际生活的微生物称根际微生物。
2、根际效应和根土比(R/S)根际内的细菌最多,但种类较少;植物生长后期,真菌数量渐增。
①分泌物、脱落物作为营养和能量来源;
4、根际微生物对植物的影响有益方面:(1)改善植物的营养状况;(2)微生物分泌的生长调节物质和生长因子;(3)产生拮抗物质抑制病原微生物生长;(4)产生铁载体,抑制不产铁载体的有害微生物生长。
(三)根际微生物
有害方面:(1)争夺营养;(2)加富病原菌;(3)分泌有毒物质。
4、根际微生物对植物的影响(三)根际微生物
二、水圈中的微生物清水中微生物:以自养微生物为主,少量异养微生物。
水的清洁度(一)淡水中的微生物腐败水中的微生物:大量腐生、异养微生物及原生动物。
浅水区:光合及好氧微生物居多。深水区:厌氧微生物占多数。
湖底区:只有厌氧微生物。水的深浅二、水圈中的微生物(一)淡水中的微生物
(二)海水中的微生物海洋土著菌:BacillusPseudomonasVibrioPhotobacterium以耐盐或嗜盐菌为主透光区:各种海洋微生物。无光区:一些微生物。
深海区:少量微生物。海底区:极少数耐压厌氧微生物。海洋深度
三、大气中的微生物大气的特点:无营养、干燥、流动性强、光照强,故无固定微生物微生物的存在状态:吸附于尘埃、水滴、脱落物上,但孢子无须吸附空气是微生物传播的重要介质:传播距离与风
空气微生物的种类和数量:下表列出相关数据。
| 地点 | 微生物数量(个/m³空气) |
|---|---|
| 北极(北纬80°) | 0 |
| 海洋上空 | 1~2 |
| 市区公园 | 200 |
| 城市街道 | 5,000 |
| 宿舍 | 20,000 |
| 畜舍 | 1,000,000~2,000,000 |
四、极端环境微生物极端环境高温低温高酸高碱高盐高毒高渗透压高压干旱高辐射强度
五
六、植物体中的微生物玉米穗上的Fusarium玉米上的Aspergillus flavus桔子上的Penicillum(一)植物表面微生物
(二)植物体内的细菌豆科植物(如大豆等)根瘤内的根瘤菌
桤木及根瘤(含Frankia)(二)植物体内的细菌
珊瑚状根瘤(含蓝细菌)(二)植物体内的细菌苏铁
鱼腥蓝细菌红萍蓝细菌与蕨类植物——红萍的共生(二)植物体内的细菌
(三)植物体内的真菌菌根:真菌与植物形成的共生体。真菌的菌丝在根表面交织成鞘套状结构(称菌套),内层菌丝将外皮层细胞包起来形成哈蒂氏网。
外生菌根内生菌根真菌的菌丝体主要存在于根的皮层细胞间和细胞内,共生的植物仍保留有根毛。最常的为丛枝菌根(AM)。
VA菌根
外生菌根与植物的相互作用外生菌根菌→植物:①提供植物营养及生长刺激物质;②防御林木根部病害。
植物→菌根菌:提供良好的生态环境和有机养料。
泡囊丛枝VA菌根(泡囊-丛枝菌根)根毛VA菌根对植物的主要作用:增加根圈的范围,扩大吸收营养的范围;提高植物从低磷土壤中吸收磷等矿质元素的能力。
第二节微生物与生物环境间的关系
一、互生cooperation定义:两种可以单独生活的生物,当它们生活在一起时,通过各自的代谢活动而有利于对方,或偏利于一方的生活方式。
即互利互生和偏利互生。
微生物间的互生关系:好氧性自生固氮菌与纤维分解菌氨化细菌与亚硝化细菌和硝化细菌之间的关系氧化塘中的细菌与藻类人体的肠道正常菌群
二、共生symbiosis定义:两种生物共居在一起,相互协作分工,相依为命,以至达到难分难解、合二为一的一种关系。
微生物间的共生关系:地衣:藻类与真菌产氢产乙酸菌株(S菌株)与产甲烷细菌(MOH菌株)微生物与植物间的共生关系:根瘤菌与豆科植物放线菌与一些非豆科植物之间的根瘤
三、寄生parasitism定义:一般指一种生物生活在另一种生物的体内或体表,从中取得营养和进行生长繁殖,同时使后者蒙受损害甚至被杀死的现象。
微生物间的寄生噬菌体与其宿主之间的关系细菌或真菌寄生于原生动物微生物与植物之间的寄生关系植物病原体微生物与动物之间的寄生关系:
四、竞争competition
五、拮抗antogonism定义:由某种生物所产生的某种代谢产物可抑制他种生物的生长发育甚至杀死它们的关系。
有特异性和非特异性两种。
有时也将因某微生物生长而引起的其它条件改变抑制他种生物的现象称为拮抗,如缺氧、pH值改变等拮抗关系的利用:为筛选抗生素、食品保藏
定义:一种微生物直接捕捉、吞食另一种微生物以满足其营养需要的关系。
微生物间的捕食关系原生动物吞食细菌和藻类的现象。
真菌捕食线虫和其它原生动物的现象捕食现象的利用:——生物防治六、捕食predation
一、碳素循环氮素循环二、硫、磷素的循环三、第三节微生物与自然界物质循环
一、碳素循环(一)碳素循环的途径淀粉纤维素、半纤维素果胶质和几丁质(二)微生物在碳水化合物分解中的作用
(一)碳素循环的途径CO2的同化CO2的再生
微生物在同化CO2中的作用CO2含碳有机物产氧光合作用如藻类、蓝细菌不产氧光合作用如化能自养菌厌氧同化作用如热自养甲烷杆菌①②③
(二)微生物在碳水化合物分解中的作用1.淀粉的水解直链淀粉支链淀粉
液化型淀粉酶:α-淀粉酶糖化型淀粉酶:淀粉-1,4-麦芽糖苷酶淀粉-1,4-葡萄糖苷酶淀粉-1,6-葡萄糖苷酶水解淀粉的酶及产酶微生物:产液化型淀粉酶微生物:枯草芽孢杆菌、黄单胞菌、木霉、根霉等产糖化型淀粉酶微生物:根霉属
2.纤维素、半纤维素的水解
(1)水解纤维素的酶天然纤维素C1酶Cx酶纤维二糖(外切酶)短链纤维素纤维二糖酶葡萄糖(内切酶)纤维二糖纤维二糖酶
(2)水解纤维素的微生物真菌、放线菌、细菌
(3)半纤维素的分解半纤维素的组成中含有:多聚戊糖(木糖和阿拉伯糖)多聚己糖(半乳糖、甘露糖)多聚糖醛酸(葡萄糖醛和半乳糖醛酸)等
半纤维素的分解许多能分解纤维素的微生物大部分也能分解半纤维素;但另一些不能分解纤维素的微生物却能够分解半纤维素。
在分解半纤纤素的微生物中,酸性土壤中以真菌为主;碱性土壤中,以细菌为主。
多聚糖酶
3.果胶质和几丁质的分解(1)果胶质的结构果胶是甲基半乳糖醛酸的聚合体。
不被甲基化的聚合体是果胶酸。
果胶的结构果胶酸的结构甲基半乳糖醛酸
原果胶(非水溶性)可溶性果胶果胶酸半乳糖醛酸原果胶酶多缩戊糖+甲醇+果胶甲酯水解酶果胶酸酶H2OH2OH2O(2)果胶质的分解
(3)分解果胶的微生物好氧细菌如:枯草芽孢杆菌等厌氧细菌如:费地浸麻梭菌等真菌如:黑曲霉、米曲霉等一些放线菌(4)几丁质的分解某些细菌与放线菌产生的几丁质酶可将几丁质分解为N-乙酰葡萄糖胺
二、氮素循环
(一)氮循环的途径
(二)有机氮化合物的分解蛋白质多肽氨基酸蛋白酶肽酶氧化还原直接水解脱水氧化还原氨脱氨基作用
氧化还原脱氨少数厌氧梭菌(如生孢梭菌)能通过部分氨基酸(如丙氨酸等)的氧化与一些氨基酸(如甘氨酸等)的还原相偶联而实现氧化、脱氨基、产生能量的独特反应类型。
每分子氨基酸只产1个ATP。
又称Stickland反应供氢体受氢体L-丙氨酸甘氨酸L-亮氨酸L-脯氨酸L-缬氨酸L-羟脯氨酸L-苯丙氨酸L-鸟氨酸L-半胱氨酸L-精氨酸L-丝氨酸L-色氨酸反应机理如下:(二)有机氮化合物的分解
Stickland反应
NH2C=O+2H2ONH2(NH4)2CO32NH3↑+CO2↑+H2O尿酶尿素的分解(二)有机氮化合物的分解
亚硝酸细菌2NH3+3O22HNO2+2H2O2HNO2+O22HNO3硝酸细菌(三)硝化作用是氨氧化成硝酸盐的过程。
(四)反硝化作用硝酸盐氮气厌氧反硝化细菌还原亚硝酸盐氧化氮氧化二氮
(五)生物固氮作用氮气氨固氮微生物
三、硫、磷的循环
(一)硫素循环
1.有机硫的腐败及矿化:含硫有机物厌氧H2SSO42-(腐败作用)矿化作用有氧
2.无机硫化物的氧化(即硫化作用):好氧、硫杆菌属好氧、发硫菌属H2SSSO42-S厌氧、绿菌属厌氧、着色菌属硫磺细菌硫磺细菌硫化细菌硫化细菌
3. 硫酸盐的还原:(1)同化型的硫酸盐还原:SO42-有机硫化物(2)异化型的硫酸盐还原(反硫化作用):SO42-或有机硫H2S厌氧、脱硫弧菌属
(二)磷素循环微生物的作用土壤中的不溶性磷酸盐进入到土壤中的有机磷PO43-植物体及微生物体中的有机磷动物排泄物中的含磷物质动物体中的有机磷磷肥
1.有机磷的矿化核酸核酸酶核苷酸核苷酸酶核苷碱基核糖磷酸(2)磷脂磷脂酶卵磷脂甘油、磷酸、胆碱(1)核酸
2. 无机磷化物的溶解难溶性磷酸盐矿物微生物产生的有机或无机酸可溶性磷酸化合物
学习要点
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