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11 第十章 微生物的分类与鉴定.ppt

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本课件讲授微生物的分类与鉴定,先介绍分类学的分类、鉴定、命名三大任务与通用分类单元,梳理界门纲目科属种七级单元和种以下的亚种、变种、型、类群、菌株、小种、相、态八类单元;随后讲解俗名与学名的区别、双名法的书写规则和模式概念;最后概述细菌的分类依据、伯杰氏两部手册的分卷与地位,以及酵母菌的 Lodder 分类系统及其三个亚门的划分。

第十章微生物的分类和鉴定封面,标示本章主题为微生物的分类与鉴定
生物种类数量图,说明生物150余万种中微生物占15万到20万种
分类学任务图,列出分类、鉴定与命名三项任务
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第1页:第十章微生物的分类和鉴定封面

第十章 微生物的分类和鉴定封面,标示本章主题与篇章起始。

第2页:生物种类与微生物数量

生物种类:生物种类 150 余万种,其中微生物为 15 万~20 万种。

第3页:分类学的任务

分类学的任务

  • 分类
  • 鉴定
  • 命名

第4页:分类的概念

分类
指在对大量的微生物进行逐一的观察、分析与描述的基础上,按照它们的个体形态、培养特征、生理生化特性和细胞化学组份等一系列性状的异同和主次,并根据它们的亲缘关系和应用的方便,加以分门别类。

第5页:鉴定的概念

鉴定
对某一具体的微生物的性状进行细致的观察和测试,参照一定的分类标准,用对比的方法来确定该微生物的分类地位。

第6页:第一节通用分类单元

第一节 通用分类单元章节标题页,本节讲授通用的分类等级、种的概念以及种以下的各类细分单元。

第7页:一、分类单元

一、分类单元:界、门、纲、目、科、属、种。

第8页:二、种species

微生物的种(species,又译物种)
是一个基本分类单元,它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内的其他物种有着明显差异的一大群菌株的总称。

第9页:三、种以下的分类单元

三、种以下的分类单元

  • 亚种(subspecies,subsp.,ssp.)
  • 变种(variety,var.)
  • 型(form)
  • 类群(group)
  • 菌株(strain)
  • 小种(race)
  • 相(phase)
  • 态(state)

第10页:(一)亚种subspecies

亚种(subspecies,subsp.,ssp.)
是种的进一步细分单元,一般指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种。

第11页:(二)变种variety

变种(variety,var.)
变种是亚种的同义词,因易引起混乱,故《国际细菌命名法规》(1975)已规定它在命名法中没有地位,且不主张使用。

第12页:(三)型form

(三)型(form):在亚种以下的「型」曾用于表示细菌菌株,但目前已废除;目前尚在使用的是以「型」作后缀使用,例如生物变异型(biovar)、化学型(chemoform)等。

第13页:(四)类群group

(四)类群(group):是一个在分类上没有地位的普通名词,它可非正式地指定一组具有某些共同性状的生物。

第14页:(五)菌株strain

菌株(strain,又称品系,在病毒中则称毒株或株)
表示任何由一个独立分离的单细胞(或单个病毒粒子)繁殖而成的纯种群体及其一切后代。

第15页:(六)小种race

(六)小种(race):又称品种、宗或生产小系等,它的涵义很乱;在真菌学中常相当于生理型,在动物学中常指生态型,而在发酵工业中,则常指自生产中选育出来的自发突变菌株。

第16页:(七)相phase

(七)相(phase):一般指自然存在的微生物交互变异中的一定阶段。

第17页:(八)态state

(八)态(state):通常指微生物的菌落变异状态,如粗糙、光滑或粘液状等。

第18页:第二节微生物的命名

第二节 微生物的命名章节标题页,本节讲授俗名与学名的区别、双名法的书写规则和模式概念。

第19页:微生物的名字

每一种微生物都有一个自己的名字,名字有俗名(common name)和学名(scientific name)两种。

第20页:俗名common name

俗名(common name)
指普通的、通俗的、地区性的名字,具有简明和大众化的优点,但往往涵义不够确切,易于重复,使用范围局限。

第21页:学名scientific name

学名(scientific name)
指一个菌种的科学名称,它是按照《国际细菌命名法规》命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。

第22页:俗名与学名对照表

俗名与学名对照

常见微生物俗名与学名对照
俗名学名
结核杆菌结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)
绿脓杆菌铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)
金葡菌金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)
红色面包霉粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)
白念菌白色假丝酵母(Candida albicans)

说明:原页拉丁名连写为「Candidaalbicans」,按双名法更正为 Candida albicans。

第23页:双名法

双名法(binominal nomenclature)
指一个物种的学名由前面一个属名(generic name)和后面一个种名加词(specific epithet)两部分组成。

第24页:双名法的书写规则

双名法的书写规则

  • 属名的词首须大写
  • 种名加词的字首须小写(包括由人名或地名等专用名词衍生的)
  • 若所分离的菌株只鉴定到属,而未鉴定到种,可用 sp. 表示,例如 Bacillus sp.

说明:原页写作「Bacillussp」,按规范补空格与缩写点,更正为 Bacillus sp.。

第25页:双名法命名举例

双名法命名举例

  • 例 1:大肠埃希氏菌(简称大肠杆菌)Escherichia coli(Migula)Castellani et Chalmers 1919
  • 例 2:枯草芽孢杆菌(简称枯草杆菌)Bacillus subtilis(Ehrenberg)Cohn 1872

第26页:亚种与变种的学名写法

亚种与变种的学名写法

  • 例 1:苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种 Bacillus thuringiensis(subsp.)galleria
  • 例 2:椭圆酿酒酵母(或酿酒酵母椭圆变种)Saccharomyces cerevisiae(var.)ellipsoideus

第27页:模式概念

模式概念
由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准,为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱,细菌系统分类也像其他生物分类一样采用「模式概念」。
  • 种和亚种指定模式菌株(type strain)
  • 亚属和属指定模式种(type species)
  • 属以上至目级分类单元指定模式属(type genus)
  • 模式菌株应送交菌种保藏机构保藏,以便备查考和索取

第28页:第三节各大类微生物的分类系统纲要

第三节 各大类微生物的分类系统纲要章节标题页,本节讲授细菌和酵母菌的主要分类系统与分类依据。

第29页:微生物的分类范围

微生物横跨整个生物界的四个界,有十几万个种。

第30页:一、细菌的分类:1、形态特征

一、细菌的分类——1、细菌分类的依据

(1)形态特征
在显微镜下观察的个体形态特征;在各种培养基上表现的群体形态特征。

第31页:细菌分类的其他依据

细菌分类的依据(续)

  • (2)生理生化特性
  • (3)生态特征
  • (4)血清学反应

第32页:伯杰D.Bergey与鉴定细菌学手册

美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰(D. Bergey,1860—1937)。

《伯杰氏鉴定细菌学手册》(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology):以伯杰姓氏命名的细菌鉴定手册,是进行细菌鉴定的重要工具书。

第33页:鉴定细菌学手册的国际权威地位

《伯杰氏鉴定细菌学手册》的国际权威地位:1957 年第七版后,由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写(如 1974 年第八版,撰稿人多达 130 多位,涉及 15 个国家;现行版本撰稿人多达 300 多人,涉及近 20 个国家),所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果,因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。

第34页:伯杰氏系统细菌学手册

《伯杰氏系统细菌学手册》(Bergey's Manual of Systematic Bacteriology)
伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据,其特点是描述非常详细,包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法(20 世纪 80 年代末期)。

第35页:新版手册的四卷划分

新版手册分 4 卷

  1. 第一卷:一般医学和工业方面重要的革兰氏阴性细菌
  2. 第二卷:放线菌以外的革兰氏阳性细菌
  3. 第三卷:古细菌、蓝细菌及其他革兰氏阴性细菌
  4. 第四卷:放线菌

说明:原页第一项写作「故细菌」,按手册实际分卷内容更正为「古细菌」。

第36页:手册第八版中文版的分部

《伯杰氏系统细菌学手册》第八版有中文版,把细菌分十九个部分。

第37页:二、酵母菌的分类

二、酵母菌的分类:酵母菌的分类普遍采用荷兰的 Lodder 在 1970 年提出的分类系统。

说明:原页写作「Loddov」,按酵母菌分类学标准人名更正为 Lodder。

第38页:酵母菌分类的依据

酵母菌分类的依据:在这个分类系统中,以是否形成各类有性孢子作为分类的起点,属以上的分类主要依据形态;种的划分主要依据生理特性。

第39页:酵母菌的三个亚门

在这个系统中有三个亚门:属以上的分类主要依据形态;种的划分主要依据生理特性。

第40页:各亚门的酵母类群

酵母菌三个亚门的主要类群

酵母菌各亚门的归属与类群数量
亚门归属与类群数量
子囊菌亚门能形成子囊孢子的酵母,共有 4 个科 22 个属 139 种酵母
担子菌亚门能产生冬孢子和担孢子的酵母菌,属冬孢菌纲、黑粉菌目、黑粉菌科;能产生掷孢子的酵母菌属冬孢子纲、掷孢酵母科,科内有 3 个属
半知菌亚门不能产生有性孢子、尚未发现有性过程的酵母,共 12 个属 170 个种;许多有经济意义的重要酵母菌都在这一亚门中

说明:原页「能产生冬孢子和担孢子的酵母菌……共9个科」与前后文的属种计数体例不一致,本表保留原课件文字表述,使用时建议核对伯杰氏手册或 Lodder 系统原文。

第41页:

本页源文件未提取到文字内容,仅有图片,位于本章末尾,通常为酵母菌或霉菌分类系统图示。建议对照原课件图片补充本页要点说明。

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