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06 第五章 微生物的代谢.ppt

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本课件讲授微生物生命活动中的能量流与物质流,先厘清新陈代谢、合成代谢与分解代谢的概念及相互关系,再展开生物氧化的形式与功能,详细讲解EMP、HMP、ED与TCA四条脱氢途径的过程、意义与产能效率;随后比较有氧呼吸、无氧呼吸与发酵三种生物氧化类型及由丙酮酸出发的六条发酵途径,最后介绍生物固氮、自养微生物CO2固定、肽聚糖合成与次生代谢产物等独特代谢途径。

第五章微生物的新陈代谢封面,标示本章主题为微生物生命活动中的能量流与物质流
本章内容导览页,列出能量代谢与物质代谢、分解与合成代谢的联系及独特合成途径三节
新陈代谢概念图,区分分解代谢与合成代谢并说明酶系、能量与还原力的作用
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第1页:第五章微生物的新陈代谢封面

第五章 微生物的新陈代谢——微生物生命活动过程中的能量流和物质流,封面标示本章主题与篇章起始。

第2页:本章内容

Contents(3学时)

  1. 第一节:微生物的能量代谢与物质代谢
  2. 第二节:分解代谢和合成代谢的联系
  3. 第三节:微生物独特合成途径举例

第3页:新陈代谢的几个概念

关于新陈代谢的几个概念

新陈代谢(Metabolism)
发生在活细胞中的各种分解代谢和合成代谢的总和。
合成代谢(Anabolism,同化作用)
在合成酶系催化作用下,由简单小分子、ATP 形式的能量和 [H] 形式的还原力一起合成复杂大分子的过程。
分解代谢(Catabolism,异化作用)
复杂的有机物分子通过分解代谢酶系的催化,产生简单小分子、ATP 形式的能量和还原力的过程。

第4页:分解代谢与合成代谢的关系

分解代谢与合成代谢的关系

  • 分解代谢为合成代谢提供能量、原料
  • 合成代谢是分解代谢的基础

第5页:第一节微生物的能量代谢

第一节 微生物的能量代谢章节标题页,本节讲授微生物生命活动中能量的产生方式。

第6页:能量代谢的目的

能量代谢的目的
生物体把外界环境中多种形式的最初能源转换成对一切生命活动都能使用的通用能源。

最初能源包括有机物(化能异养微生物)、还原态无机物(化能自养微生物)与日光(光能营养微生物),最终统一转换为 ATP。

第7页:生物氧化

生物氧化

生物氧化的形式
加氧、脱氢、失去电子。
生物氧化的功能
产能(ATP)、产还原力 [H]、产小分子中间代谢产物。
生物氧化过程
脱氢、递氢、受氢。

第8页:化能异养微生物的生物氧化和产能

化能异养微生物的生物氧化和产能

底物脱氢
EMP 途径、HMP 途径、ED 途径、TCA 途径
递氢与受氢
呼吸、无氧呼吸、发酵

第9页:EMP途径

EMP 途径(Embden-Meyerhof-Parnas Pathway),即糖酵解途径,是葡萄糖分解为丙酮酸的主要代谢路线。

第10页:EMP途径总式

EMP 途径总式:

葡萄糖 + 2NAD + 2Pi + 2ADP → 2 丙酮酸 + 2NADH + 2H+ + 2ATP + 2H2O

过程可表示为 C6 → 2C3 → 丙酮酸,分为耗能阶段(消耗 2ATP)与产能阶段(生成 4ATP,净产 2ATP,并生成 2NADH + H+)。

第11页:EMP途径的意义

EMP 途径的意义

EMP 途径的生理学功能:

  1. 为合成代谢供应 ATP 形式的能量和 NADH2 形式的还原力
  2. 为合成代谢提供多种中间代谢产物
  3. 连接三羧酸循环(TCA)、HMP 途径和 ED 途径的桥梁
  4. 通过逆向反应可进行多糖合成

EMP 途径与人类的关系:乙醇、乳酸、甘油、丙酮和丁醇的发酵。

第12页:PP途径

PP 途径(Pentose phosphate pathway),旧称 HMP 途径(Hexose monophosphate pathway),此途径存在于大多数生物体内。本页图示 C3、C4、C5、C6、C7 各类糖之间的碳架转换关系。

第13页:PP途径总反应式

PP 途径总反应式:

6 葡萄糖-6-磷酸 + 12NADP+ + 6H2O → 5 葡萄糖-6-磷酸 + 12NADPH + 12H+ + 6CO2 + Pi

即 6C6 → 6C5,经一系列复杂反应后重新合成 5C6,同时产生 12NADPH 与 6CO2;经呼吸链生成约 35ATP(1ATP 用于葡萄糖-6-磷酸生成)。

第14页:PP途径的意义

PP 途径的意义

  • 供应合成原料:戊糖磷酸用于核酸、NADP、FAD、CoA 等;赤藓糖-4-磷酸用于芳香族氨基酸
  • 产还原力:NADPH2
  • 作为固定 CO2 的中介:核酮糖-5-磷酸
  • 扩大碳源利用范围:C3—C7
  • 连接 EMP 途径:果糖-1,6-二磷酸、甘油醛-3-磷酸

第15页:PP途径与发酵产物

生产实践——重要发酵产物

  • 核苷酸
  • 氨基酸
  • 辅酶
  • 乳酸

第16页:ED途径

ED 途径:即 2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖酸(KDPG)裂解途径,与 EMP 途径相连;有 O2 时与 TCA 相连,无 O2 时进行酒精发酵。

第17页:ED途径的特点

ED 途径的特点

  • 特征性反应:2-酮-3-脱氧-6-磷酸葡萄糖酸裂解
  • 特征性酶:KDPG 酶
  • 终产物 2 分子丙酮酸的来历不同
  • 产能效率低:1mol ATP / 1mol 葡萄糖

反应式:葡萄糖 + NAD+ + NADP + Pi + ADP → 2 丙酮酸 + NADH + H+ + NADPH + H+ + ATP

第18页:具有ED途径的微生物

具有 ED 途径的微生物

  • Pseudomonas saccharophila(嗜糖假单胞杆菌)
  • Ps. aeruginosa(铜绿假单胞杆菌)
  • Ps. fluorescens(荧光假单胞杆菌)
  • Ps. lindneri(林氏假单胞菌)
  • Z. mobilis(运动发酵单胞菌)
  • Alcaligenes eutrophus(真氧产碱菌)

第19页:丙酮酸代谢的多样性

丙酮酸的代谢的多样性:EMP 途径、不完全的 HMP 途径、ED 途径都可以产生丙酮酸,生成的丙酮酸:

  1. 进入 TCA 循环:进一步氧化分解,产生还原力 NADPH2、ATP 和合成代谢所需要的小分子 C 架
  2. 发酵作用(Fermentation)

第20页:TCA循环

TCA 循环:丙酮酸在进入三羧酸循环之先要脱羧生成乙酰 CoA,乙酰 CoA 和草酰乙酸缩合成柠檬酸再进入三羧酸循环。

循环的结果是乙酰 CoA 被彻底氧化成 CO2 和 H2O,每氧化 1 分子的乙酰 CoA 可产生 12 分子的 ATP,草酰乙酸参与反应而本身并不消耗。

第21页:TCA循环的反应式

从丙酮酸进入循环:

丙酮酸 + 4NAD+ + FAD + GDP + Pi + 3H2O → 3CO2 + 4(NADH + H+)+ FADH2 + GTP

从乙酰-CoA 进入循环:

乙酰-CoA + 3NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2H2O → 2CO2 + 3(NADH + H+)+ FADH2 + CoA + GTP

其中经呼吸链生成 12ATP,FADH2 经呼吸链生成 2ATP,另由底物水平磷酸化生成 1ATP。

第22页:TCA循环的重要特点

TCA 循环的重要特点

  1. 循环一次的结果是乙酰 CoA 的乙酰基被氧化为 2 分子 CO2,并重新生成 1 分子草酰乙酸
  2. 整个循环有四步氧化还原反应,其中三步将 NAD+ 还原为 NADH + H+,另一步为 FAD 还原
  3. 为糖、脂、蛋白质三大物质转化中心枢纽
  4. 循环中的某些中间产物是一些重要物质生物合成的前体
  5. 是生物体提供能量的主要形式
  6. 为人类利用生物发酵生产所需产品提供主要的代谢途径,如柠檬酸发酵

第23页:葡萄糖经不同途径的产能效率

葡萄糖经不同途径后的产能效率:下表比较 EMP、HMP、ED 与 EMP+TCA 四条途径的产能形式与净产 ATP 数。

葡萄糖经不同途径后的产能效率
产能形式EMPHMPEDEMP+TCA
ATP(GTP)2122(2ATP)
NADH + H+2(=6ATP)—1(=3ATP)2+8(=30ATP)
NADPH + H+—12(=36ATP)1(=3ATP)—
FADH2———2(=4ATP)
净产 ATP835736—38

说明:原页数字密集粘连,表中数值按课件原文的逆向顺序推定归属,其中 HMP 净产 35ATP 已包含葡萄糖转变为葡糖-6-磷酸所消耗的 1ATP,EMP+TCA 的 36—38ATP 为考虑真核生物 NADH 进入线粒体消耗 2ATP 的范围值,建议对照原课件图片复核。

第24页:递氢和受氢

递氢和受氢:经上述脱氢途径生成的 NADH、NADPH、FADH 等还原型辅酶通过呼吸链等方式进行递氢,最终与受氢体(氧、无机或有机氧化物)结合,以释放其化学潜能并生成 ATP。

第25页:生物氧化的三种类型

生物氧化的三种类型:根据受氢体性质的不同,生物氧化可分为三种类型。

  • 有氧呼吸
  • 无氧呼吸
  • 发酵

第26页:

本页源文件未提取到文字内容,仅有图片,通常为生物氧化类型总览图。建议对照原课件图片补充本页要点说明。

第27页:有氧呼吸

呼吸(有氧呼吸,Aerobic Respiration)
以分子氧为最终电子(和氢)受体的作用,即有机物脱氢后,经完整呼吸链(电子传递链)递氢,最终以分子氧作为氢受体产生水,释放 ATP 形式的能量,最终产物为 CO2 和 H2O。

这是生物最重要和最普遍的氧化形式。

第28页:呼吸链

呼吸链(Respiratory chain)/电子传递链(ETC):位于原核生物细胞膜上或真核生物线粒体膜上,由一系列氧化还原电势呈梯度差、链状排列的氢传递体(或电子传递体)组成,最终将氢交给 O2。

第29页:无氧呼吸

无氧呼吸
进行无氧呼吸的微生物生活在缺氧的环境中,这些微生物在产能的生物氧化过程中以无机化合物(NO3-、SO42-、CO2)中的氧为最终电子受体,称为无氧呼吸。

特点:无氧条件、产能效率低;有机物脱氢后经部分呼吸链递氢,最终由氧化态的无机物或有机物受氢,完成氧化磷酸化反应。

无氧呼吸的类型(根据呼吸链末端的氢受体):无机盐呼吸、有机物呼吸。

第30页:无氧呼吸的主要类型

无氧呼吸的主要类型:本页按呼吸链末端氢受体的不同列出无氧呼吸的各类代表,包括硝酸盐呼吸、硫酸盐呼吸、碳酸盐呼吸以及延胡索酸呼吸等,建议对照原课件图片查阅各类的代表菌与产物。

第31页:硝酸盐呼吸与延胡索酸呼吸

硝酸盐呼吸(Nitrate respiration)
即反硝化作用(Denitrification),以无机盐为最终电子受体的无氧呼吸类型;如硝酸盐还原细菌 E. coli 将 NO3- 还原为 NO2-:C6H12O6 + 12NO3- → 6CO2 + 6H2O + 12NO2-
延胡索酸呼吸(Fumarate Respiration)
以有机物延胡索酸为最终电子受体,将其还原成琥珀酸的生物氧化。

第32页:发酵

发酵(Fermentation)

广义发酵
任何利用微生物来生产大量菌体或有用代谢产物或食品饮料的一类生产方式。
狭义发酵
在无氧等外源受氢体(外源最终电子受体)条件下,底物脱氢以后产生的还原力 [H] 未经过呼吸链传递而直接交给某一内源中间代谢产物接受,以实现底物水平磷酸化产能的生物氧化反应,如 C6H12O6 → 2CO2 + 2C2H5OH。

第33页:发酵的特点

发酵的特点

  • 微生物部分氧化有机物获得发酵产物,释放少量能量
  • 氢供体与氢受体(内源性中间代谢产物)均为有机物
  • 还原力 [H] 不经过呼吸链传递
  • 产能方式:底物水平磷酸化反应

第34页:四类发酵

四类发酵

  1. 由 EMP 途径中丙酮酸出发的发酵
  2. 通过 HMP 途径的发酵
  3. 通过 ED 途径进行的发酵
  4. Stickland 反应

第35页:由丙酮酸出发的发酵

由 EMP 途径中丙酮酸出发的发酵:由葡萄糖经 EMP 途径形成丙酮酸,进一步降解形成各种发酵产物。

  • 酒精发酵(酿酒酵母)
  • 同型乳酸发酵(德氏乳杆菌)
  • 丙酸发酵(丙酸杆菌)
  • 混合酸发酵(大肠杆菌)
  • 2,3-丁二醇发酵(产气肠杆菌)
  • 丁酸发酵(丁酸梭菌)

第36页:由丙酮酸出发的6条发酵途径

由丙酮酸出发的 6 条发酵途径:①酵母型酒精发酵;②同型乳酸发酵;③丙酸发酵;④混合酸发酵;⑤2,3-丁二醇发酵;⑥丁酸发酵。图中方框内为发酵产物。

第37页:发酵途径的意义与VP实验

由 EMP 途径中丙酮酸出发的发酵的意义

  • 工业发酵
  • 菌种鉴定:VP 实验(Voges-Proskauer test)——产气肠杆菌(E. aerogenes)产生乙酰甲基甲醇,碱性条件下氧化成双乙酰,与含有胍基的精氨酸反应,产生特征性的红色反应

第38页:通过HMP途径的发酵

异型乳酸发酵(Heterolactic fermentation)
凡是葡萄糖经过发酵后除主要产生乳酸,还产生乙醇、乙酸和二氧化碳等多种产物的发酵。

进行异型乳酸发酵的微生物:

  • 异型乳酸发酵的经典途径:L. mesenteroides(肠膜明串珠菌)、L. cremoris(乳脂明串珠菌)、L. brevis(短乳杆菌)、L. fermentum(发酵乳杆菌)等
  • 异型乳酸发酵的双歧途径:Bifidobacterium bifidum(双歧杆菌)

第39页:异型乳酸发酵的经典途径

异型乳酸发酵的经典途径:本页图示葡萄糖经磷酸戊糖酮解途径生成乳酸、乙醇和 CO2 的代谢流程,建议对照原课件图片查看各步中间产物。

第40页:异型乳酸发酵的双歧途径

异型乳酸发酵的双歧途径:2 分子葡萄糖产生 2 分子乳酸、3 分子乙酸和 5 分子 ATP,是双歧杆菌特有的产能效率更高的发酵路线。

第41页:通过ED途径进行的发酵

通过 ED 途径进行的发酵——细菌酒精发酵:运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis,微好氧菌)经 ED 途径从丙酮酸到乙醇完成酒精发酵。

第42页:Stickland反应

Stickland 反应
以一种氨基酸作底物脱氢(氢供体),以另一种氨基酸作氢受体实现生物氧化产能的独特发酵类型,产能效率低。
  • 氢供体氨基酸:丙氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、组氨酸、色氨酸、丝氨酸等
  • 氢受体氨基酸:甘氨酸、脯氨酸、精氨酸、鸟氨酸

第43页:Stickland反应的实例

以丙氨酸和甘氨酸为例:

丙氨酸 + 甘氨酸 + ADP + Pi → 3 乙酸 + 3NH3 + CO2

进行 Stickland 反应的微生物:C. sporogenes(生孢梭菌)、C. botulinum(肉毒梭菌)、C. sticklandii(斯氏梭菌)。

第44页:有氧呼吸、无氧呼吸与发酵的比较

有氧呼吸、无氧呼吸与发酵的比较:下表按氧化基质、最终电子受体、产物、产能与电子传递链五项逐项对比。

有氧呼吸、无氧呼吸与发酵的比较
呼吸类型氧化基质最终电子受体产物产能电子传递链
有氧呼吸有机物O2CO2、H2O多完整
无氧呼吸有机物无机氧化物、延胡索酸CO2、H2O、NO2-、N2次之不完整
发酵有机物氧化型中间代谢产物(醛、酮等)还原型中间代谢产物(醇、酸)少无,底物水平磷酸化

第45页:自养微生物产ATP和产还原力

自养微生物产 ATP 和产还原力

  • 化能无机自养:能对无机物进行氧化而获得能量的微生物
  • 光能自养:能利用日光辐射能的微生物

第46页:化能自养微生物

化能自养微生物——化能自养的机理:通过氧化 NH3、H2S、Fe2+ 等无机物获得 ATP 与还原力,用于同化 CO2 合成细胞物质。

第47页:光能营养微生物

光能营养微生物

  • 循环光合磷酸化
  • 非循环光合磷酸化
  • 嗜盐菌紫膜的光介导 ATP 合成

第48页:

本页源文件未提取到文字内容,仅有图片,通常为光合磷酸化示意图。建议对照原课件图片补充本页要点说明。

第49页:

本页源文件未提取到文字内容,仅有图片,通常为光合磷酸化或非循环式光合磷酸化示意图。建议对照原课件图片补充本页要点说明。

第50页:第二节分解代谢和合成代谢的联系

第二节 分解代谢和合成代谢的联系章节标题页,本节讲授两类代谢之间的中间产物联接与回补途径。

第51页:分解代谢和合成代谢的关系

分解代谢和合成代谢的关系:本页图示分解代谢与合成代谢通过中间代谢产物彼此连接、相互提供原料与能量的整体关系,建议对照原课件图片阅读。

第52页:联接分解代谢和合成代谢的重要中间代谢产物

联接分解代谢和合成代谢的重要中间代谢产物:本页图示连接分解代谢与合成代谢的关键中间代谢物,如丙酮酸、乙酰 CoA、草酰乙酸、α-酮戊二酸等,建议对照原课件图片查看各节点去向。

第53页:两用代谢途径

两用代谢途径
凡在分解代谢和合成代谢中均具有功能的代谢途径。

重要的两用代谢途径:EMP、HMP、TCA。

  • 葡萄糖异生作用:2 个丙酮酸通过逆转 EMP 合成 1 个葡萄糖
  • 合成代谢途径并非分解途径的完全逆转:代谢产物完全不同;分解与合成代谢通常在不同的分隔区内进行

第54页:代谢物回补顺序

代谢物回补顺序
又称代谢物补偿途径、添补途径,指能补充两用代谢途径中因合成代谢而消耗的中间代谢产物的反应;不同的微生物有不同的代谢物回补程序。

第55页:以EMP和TCA循环为中心的回补顺序

以 EMP 和 TCA 循环为中心的中间代谢物回补顺序:本页图示围绕 EMP 与 TCA 循环的各条回补反应及其补充的中间代谢产物,建议对照原课件图片查看具体反应。

第56页:

本页源文件未提取到文字内容,仅有图片,通常为代谢物回补顺序示意图。建议对照原课件图片补充本页要点说明。

第57页:第三节微生物独特代谢途径举例

第三节 微生物独特代谢途径举例

  • 生物固氮
  • 自养微生物 CO2 的固定
  • 肽聚糖的合成
  • 微生物次生代谢产物的合成

说明:原课件本页标题写作「第二节」,与本章目录的第三节顺序不符,此处按章节顺序更正为第三节,内容未作改动。

第58页:生物固氮

一、生物固氮

什么是生物固氮
指分子氮(N2)通过固氮微生物固氮酶系的催化而形成氨(NH3)的过程。

第59页:固氮微生物的种类

(一)固氮微生物的种类:至今固氮微生物约 80 多属,均为原核微生物。

  • 自生固氮菌:独立进行固氮,种类繁多
  • 共生固氮菌:与它种生物生活在一起才固氮,如根瘤菌属、弗兰克氏菌属、白蚁肠道及满江红、地衣
  • 联合固氮菌:必须生活在植物根系、叶面、动物肠道等处才能固氮

第60页:

本页源文件未提取到文字内容,仅有图片,通常为固氮微生物或根瘤形态图。建议对照原课件图片补充本页要点说明。

第61页:固氮反应的必要条件

固氮反应必要条件(6 要素)

  1. ATP 供应:由呼吸、无氧呼吸、发酵和光合作用提供
  2. 还原力 [H] 和载体:NAD(P)H + H+、H2、丙酮酸等作为氢供体
  3. 固氮酶
  4. 镁离子
  5. 严格的厌氧环境(NH3 存在会抑制固氮作用)
  6. 还原底物 N2

有 N2 时固氮酶将 75% 还原力形成 NH3,其余用于形成 H2;缺 N2 时,固氮酶将 H+ 全部还原成 H2。产物走向:N2 → NH3 → NH4+ + 酮酸 → 相应氨基酸 → 蛋白质等。

第62页:自养微生物CO2的固定

二、自养微生物 CO2 的固定

  • Calvin 循环
  • 厌氧乙酰-CoA 途径
  • 逆向 TCA 循环
  • 羟基丙酸途径

第63页:肽聚糖的生物合成

三、肽聚糖的生物合成:本页图示肽聚糖合成的 stages,包括在细胞质中合成 UDP-N-乙酰胞壁酸五肽、经载体脂转运以及在外膜完成交联的过程,建议对照原课件图片查看各步中间物。

第64页:微生物次生代谢产物的合成

什么是次生代谢产物(Secondary Metabolite)
某些微生物生长到稳定期前后,以结构简单、代谢途径明确、产量较大的初生代谢物做前体,通过复杂的次生代谢途径所合成的各种复杂的化合物。

次生代谢产物的特点:

  • 分子结构复杂
  • 代谢途径独特
  • 生长后期合成
  • 产量低
  • 生理功能不明确
  • 合成受质粒控制

第65页:次生代谢产物的种类

次生代谢产物的种类

  • 抗生素
  • 色素
  • 毒素
  • 生物碱
  • 信息素
  • 动植物生长促进剂
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