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04 第四章 发酵菌种选育.ppt

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本课件系统讲解生产中常用菌种的分离、选育与保藏,从菌种来源与采样方法讲起,依次介绍细菌、放线菌与真菌的分离技术,诱变育种与营养缺陷型选育,基因育种与原生质体融合,最后给出冷冻、冻干与液氮等菌种保藏方法。

第四章章节封面,标示本章讲解生产中常用菌种的分离、选育与保藏三大部分
带图象分析系统的微生物菌种显微观察装置示意图,用于菌种形态观察与图像分析鉴定
菌种来源说明页,列出向科研单位与菌种保藏部门索取购买、从大自然分离筛选两条途径
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第1页:第四章 菌种的分离、选育和保藏

第四章 生产中常用菌种的分离、选育和保藏。

第2页:菌种显微观察装置

图示带图象分析系统的微生物菌种显微观察装置,用于对微生物菌种进行显微观察与图像分析。

第3页:菌种的来源

  • 根据资料直接向有关科研单位、高等院校、工厂或菌种保藏部门索取或购买
  • 从大自然中分离筛选新的微生物菌种

第4页:菌种分离的思路

  • 新菌种的分离是要从混杂的各类微生物中依照生产的要求、菌种的特性,采用各种筛选方法,快速、准确地把所需要的菌种挑选出来
  • 实验室或生产用菌种若不慎污染了杂菌,也必须重新进行分离纯化
  • 有了优良的菌种,还要有合适的工艺条件和合理先进的设备与之配合

第5页:新种分离与筛选的步骤

  • 定方案:首先要查阅资料,了解所需菌种的生长培养特性
  • 采样:有针对性地采集样品
  • 增殖:人为地通过控制养分或培养条件,使所需菌种增殖培养后在数量上占优势
  • 分离:利用分离技术得到纯种
  • 发酵性能测定:测定形态、培养特征、营养要求、生理生化特性、发酵周期、产品品种和产量、耐受最高温度、生长和发酵最适温度、最适 pH 值、提取工艺等

第6页:采样的对象

(一)采样 1、采样对象以采集土壤为主。一般园田土和耕作过的沼泽土中,以细菌和放线菌为主,富含碳水化合物的土壤和沼泽地中,酵母和霉菌较多,如一些野果生长区和果园内。采样的对象也可以是植物、腐败物品、某些水域等。

第7页:从自然界筛选

从自然界筛选:按采样、增殖培养、培养分离、筛选与毒性试验的流程获得生产用菌种。

第8页:采样季节与采土方式

  • 2、采样季节:以温度适中、雨量不多的秋初为好
  • 3、采土方式:选好适当地点后用小铲除去表土,取离地面 5-15cm 处的土约 10g,盛入清洁的牛皮纸袋或塑料袋中,扎好、标记,记录采样时间、地点、环境条件等,以备查考
  • 为了使土样中微生物的数量和类型尽少变化,宜将样品逐步分批寄回,以便及时分离

第9页:增殖培养

  • 为了容易分离到所需的菌种,让无关的微生物至少是在数量上不要增加,可以通过配制选择性培养基、选择一定的培养条件来控制
  • 例如碳源利用的控制,可选定糖、淀粉、纤维素或者石油等,以其中的一种为唯一碳源,那么只有利用这一碳源的微生物才能大量正常生长,而其它微生物就可能死亡或淘汰
  • 这样对下阶段的纯种分离就会顺利得多

第10页:培养分离

  • 尽管通过增殖培养效果显著,但还是处于微生物的混杂生长状态,因此还必须分离、纯化
  • 在这一步,增殖培养的选择性控制条件还应进一步应用,而且控制得细一点、好一点
  • 纯种分离的方法有划线分离法、稀释分离法

第11页:筛选

(四)筛选:这一步是采用与生产相近的培养基和培养条件,通过三角瓶的容量进行小型发酵试验,以求得适合于工业生产用菌种。

第12页:毒性试验

  • 自然界的一些微生物是在一定条件下产毒的,将其作为生产菌种应当十分当心,尤其与食品工业有关的菌种,更应慎重
  • 据有的国家规定,微生物中除啤酒酵母、脆壁酵母、黑曲霉、米曲霉和枯草杆菌作为食用无须作毒性试验外,其他微生物作为食用,均需通过两年以上的毒性试验

第13页:培养分离的意义

  • 从自然界中分离培养微生物是菌种选育的重要和基础的步骤
  • 到目前为止,还没有一种分离培养方法能揭示一个试样中所包含的所有微生物总数和种类
  • 在任一试样中所存在的微生物仅为极少数特定种类的菌株,在工业微生物筛选过程中应及时调整检测方法
  • 因此,建立一更为科学的和针对性不强的分离方法是必要的

第14页:成功的分离培养方法

  • (1) 认真考虑所需产品的特征和生产过程
  • (2) 制订初步的筛选标准
  • (3) 将生态学方法运用到分离和筛选过程

第15页:培养分离要解决的问题

  • 1、分离什么和从哪里分离出
  • 2、必须充分考虑所分离微生物的生产能力、生长速度、生物群体培养和产品生产工艺及其提纯的难易和费用,工业生产发酵罐中稳定性及遗传操作的难易程度等
  • 3、选择适宜的培养分离方法和检测方法

第16页:生态学分离思路(一)

  • 1.罗列出所要分离的微生物类群
  • 2.根据所采集样本的各种生态参数,描述所要分离的微生物之生态系统或栖息地
  • 3.将若干样本分成若干类型,如植物和植物各部、土壤(类型和土层)、岩石、水、昆虫和发酵食品等
  • 4.罗列出所要考察和测量的环境参数,如 pH、盐分、水分、氧化还原电势及温度等

第17页:生态学分离思路(二)

  • 5.列出生物系统中有用的自然底物,如森林土壤中的几丁质、葡萄表皮的果胶
  • 6.根据上述 1-5 项中所获得的数据,设计分离方法,即选择适宜的稀释液、底物、试样、天然浸出汁和培养条件
  • 7.用标准方法作对照来评价生态学分离方法
  • 8.根据待检材料的生态参数需要,修改已知的方法
  • 9.运用特定的富集方法,富集那些可能具有筛选意义的微生物类群

第18页:自然界中细菌的分离

四、自然界中细菌的分离:本节介绍细菌的采样与采集方法,以及分离培养基的组成原则。

第19页:细菌的采样与采集方法

  • 为了从一特定生态系统中分离出具有代表性的细菌菌群,特别是分离那些在唯一微环境区域中出现的菌群时,必须十分重视样本的采集
  • 样本采集时所需的工具通常有无菌刮铲、土样采集器、镊子、解剖刀、手套、无菌小塑料袋和塑料瓶等

第20页:采样的注意事项

  • 1、采样时应尽可能保持相对无菌
  • 2、所采集的样本必须具有某种代表性
  • 3、采好的样必须完整地标上样本的种类及采集日期、地点以及采集地点的地理、生态参数等
  • 4、应充分考虑采样的季节性和时间因素,因为真正的原地菌群的出现可能是短暂的

第21页:采样后的及时处理

5、采好的样应及时处理,暂不能处理的也应贮存于 4℃ 下,但贮存时间不宜过长。这是因为一旦采样结束,试样中的微生物群体就脱离了原来的生态环境,其内部生态环境就会发生变化,微生物群体之间就会出现消长。

第22页:土样采集方法

  • 森林、旱地、草地可先掘洞,由土壤下层向上层顺序采集
  • 水田等浸水土壤在不损土层结构的情况下插入圆筒采集;如果层次要求不严格,可取离地面 5~15cm 处的土,将采集到的土样盛入聚乙烯袋或玻璃瓶中
  • 在采集植物根际土样时,一般方法是自土壤中慢慢拔出植物根,在大量无菌水中浸渍约 20min,洗去粘附在根上的土壤,然后再用无菌水漂洗下根部残留的土,这部分土即为根际土样

第23页:植物体采集方法

  • 在采集叶面时,一般是用灭菌的剪刀、打孔器、安全刀片等,由几片新鲜叶片的同一部位切取一小块,并注意不要损伤周围边缘
  • 选择叶面时应考虑叶位、叶龄、叶片正反面和在一片叶上的取样部位
  • 采集植物根及根系时,方法与根际土样采集方法相似,将洗净的根装入采样袋中,采集根系时一般与根际土样一起保存

第24页:水样采集方法

  • 用于细菌检测的水样应收集于 100ml 干净、灭菌的广口塑料瓶中
  • 由于表层水中含有泥沙,故在采样时应在较深的静水层中采集水样
  • 方法是:握住采样瓶底浸入水中 30-50cm 处,然后瓶口朝下打开瓶盖,让水样进入;如果有急流存在的话,应直接将瓶口反向于急流;采集瓶从水中取出时应迅速并带有较大的弧度,水样不应装满采样瓶
  • 所有水样都应在 24h 之内迅速进行检测,或者 4℃ 下贮存

第25页:培养基的组成原则

  • 1、加入培养基中的天然提取物种类和用量、环境生物物理学参数以及用于平板涂布分离样本的溶剂都会影响实验中所要分离的细菌的数量和种类
  • 2、就分离培养基的组成而言,部分培养基中必须含有 10-50% 的天然提取物;加入培养基中的天然提取物,部分培养基中则应含有多种碳、氮源,如几丁质、纤维素或果胶

第26页:抗真菌剂与培养条件

  • 3、所有分离培养基中都应含有抗真菌剂(如放线菌酮和制霉素),掺加浓度一般为 50μg/ml,以抑制真菌的生长
  • 4、琼脂平板在使用前应置于 37℃ 培养箱中孵育 1、2 天
  • 5、培养基的生物物理学参数,如 pH 及盐分也应调节到与试样的生态系统参数值相近

第27页:土中细菌的富集培养

  • 分离土样中的大部分细菌的分离程序中无需进行富集
  • 但对某些少数细菌则要求特殊的富集或选择技术才能很好地被分离培养

第28页:细菌的富集方法

  • 运用细菌的酶诱导性,在分离培养基中添加若干抗生素、复杂底物及生长因子的前体物质来激活细菌某一特殊基因组,可以建立起若干富集技术
  • 富集可以促进抗性的产生并维持下来

第29页:细菌的分离操作

  • 土样中细菌的富集:适度稀释后,取 0.1ml 涂布已添加及未添加富集底物(如几丁质、纤维素等)的土浸出汁平板
  • 植物体上细菌的分离:无菌富集,加植物浸出液适度培养取样,洗涤,取 1ml 经适度稀释后涂布平板
  • 水中细菌的分离:水样通过 0.22μm 无菌滤膜,取出滤膜用 1ml 无菌稀释液将滤膜上的沉积洗下,用样本稀释液适度稀释,涂布平板倒置培养或滤纸压印分离法

第30页:水中细菌的简易富集技术

  • 在无菌的、用棉团塞好的广口三角烧瓶中连续培养,定期取样涂布适宜分离琼脂平板上
  • 在不同水体的水样中加入一定的底物如蔗糖、多糖及蛋白质等,同样可以促进水中微生物的增殖
  • 培养过程中可加入低浓度的抗真菌剂以抑制真菌的生长
  • 另一富集方法是在培养烧瓶中添加细菌附着材料,如无菌的植物组织或土壤浸出液
  • 通过改变培养温度和培养周期可选择性富集嗜冷性细菌、中温菌和嗜高温菌

第31页:次代培养及纯化步骤

  • 1、涂布的平板经培养后,如生长出菌落,则按涂布不同稀释度的稀释液所得的单菌菌落和多菌菌落对琼脂平板进行分类
  • 2、用无菌牙签将菌落转接到筛选平板上及转接至添加有少量天然浸出液的适宜保藏琼脂斜面上
  • 3、筛选平板经培养后,按生长出菌落的形态学特征如色素、菌落形态等进行最初分组
  • 4、将认为有希望的菌落用牙签转接到另一模拟分离琼脂平板上进行筛选

第32页:放线菌的采样

  • (一) 采样及采集方法:应尽可能实行无菌操作
  • 所采集的样本应具有一定的代表性
  • 样本采集完后,应及时处理或在 4℃ 下贮存,贮存试样处应与划线、筛选平板分开,贮存时间不宜过长

第33页:放线菌的生态学参数

放线菌分离培养过程中所需考虑的生态参数有温度、pH、离子强度、氧化还原电势和底物浓度。

第34页:放线菌培养基的组成原则

  • 大多数放线菌的分离培养是在贫脊或复杂底物的琼脂平板上进行的。除嗜温性放线菌外,其他放线菌一般在培养 4-20 天内在分离平板上缓慢形成菌落
  • 在放线菌分离琼脂中通常都加入抗真菌剂制霉菌素或放线菌酮,以抑制真菌的繁殖
  • 选择性地添加抗生素
  • 分离琼脂平板制备好后,一般皆应在 37℃ 培养箱中存放 3 天

第35页:放线菌的分离方法

  • 土样中放线菌的非选择性分离:土样风干、磨碎,无菌海绵压印土样后压印平板后培养
  • 植物体上放线菌的分离:无菌取植物组织,干燥以减少细菌数量,剪碎植物材料后植入平板表层后培养,也可洗下微生物后振荡培养
  • 水中放线菌的分离:为使所要分离的放线菌的数量种类增多,一般将水样离心或滤纸过滤,取离心沉积或滤纸表面沉积进行系列稀释和涂布

第36页:放线菌的纯化

  • 菌落形成后可根据肉眼可见的菌落形态上的差异,作初步的鉴定和区分
  • 通过高倍放大进行镜检,可了解气生和营养孢子形成情况
  • 成功地分离出各种不同的放线菌属及种的关键是所采集样本的本身及其分离用的琼脂培养基,而肉眼识别不同的生长形态、从而初步地加以鉴定,在分离放线菌时显得尤为重要
  • 将分离平板上所形成的菌落用经火焰灼烧灭菌的钩形针或无菌牙签挑取,点接到琼脂平板上进行影印培养,以进一步筛选和分离

第37页:真菌分离的基本要点

  • 1、利用低碳/氮比的培养基可使真菌生长菌落分散,利于计数、分离和鉴定,这里主要是利用营养成分的减少而使生长减慢,并由此限制真菌的迁涉生长
  • 2、改变培养温度将有利于不同嗜温区真菌的分离
  • 3、有时,真菌子实体形成必须有光线,这在分离培养时应加以考虑

第38页:真菌的选择性富集与抑制

  • 4、选择性富集:是通过一定的方式使样本中一种或一群微生物数量上的增加而利于分离的一种技术。富集可以是种水平的,如通过营养要求的改变来富集分离镰刀菌;也可以是组成群水平的,如以纤维素为唯一碳源的选择性培养基可选择性富集所有能降解纤维素的纤维素裂解微生物
  • 5、选择性抑制培养基可使非目标微生物消除或减少到一定程度,在分离培养基中加入一定的抗生素即可有效地抑制细菌生长及菌落形成

第39页:真菌的分离方法

  • 土中真菌的分离:稀释法、混入法、压贴法、粘附法、浮选法、注射器采集法、土过筛法、蔗糖密度梯度离心法
  • 植物材料中真菌的分离:植入法、压贴法、洗涤法、浸泡法
  • 水中真菌的分离:水样稀释后涂布分离,饵诱技术常用于水中真菌的富集
  • 子实体直接分离培养担子菌:新采集的子实体组织植入平板内,或在放于液体培养基表面放一小块无菌滤纸上培养

第40页:生产选种

七、生产选种:是在长年累月的生产实践中,在培养工艺条件没有任何可见变更情况下,突然发现某些批次生产水平提高较大,这就有可能是个别自然变异朝更好方向变的细胞,在这种条件下很适应于培养条件,并逐渐显示出它的生长优势,这种优势的发展,促使它优良的生产性能表露。进行类似新种筛选分离,达到获得新的优良生产菌种的目的。

第41页:工业菌种的育种方针

工业菌种的育种
是运用遗传学原理和技术对某个用于特定生物技术目的的菌株进行的多方位的改造
改造目的
通过改造,可使现存的优良性状强化,或去除不良性质或增加新的性状

第42页:工业菌种育种的方法

  • 工业菌种育种的方法:诱变
  • 基因转移
  • 基因重组

第43页:育种的三个步骤

  • 育种过程包括下列 3 个步骤
  • (1) 在不影响菌种活力的前提下,有益基因型的引入
  • (2) 希望基因型的选出
  • (3) 改良菌种的评价(包括实验规模和工业生产规模)

第44页:选择育种方法的考虑因素

  • (1) 待改良性状的本质及与发酵工艺的关系(如批式或连续发酵试验)
  • (2) 对这一特定菌种的遗传和生物化学方面认识的明了程度
  • (3) 经济费用
  • 如果对特定菌种的基本性状及其工艺知晓甚少,则多半采用随机诱变、筛选及选育等技术
  • 如果对其遗传及生物化学方面的性状已有较深的认识,则可选择基因重组等手段进行定向育种

第45页:工业菌种改良方法(一)

  • (1) 解除或绕过代谢途径中的限速步骤:通过增加特定基因的拷贝数或增加相应基因的表达能力来提高限速酶的含量;在代谢途径中引伸出新的代谢步骤,由此提供一个旁路代谢途径
  • (2) 增加前体物的浓度
  • (3) 改变代谢途径,减少无用副产品的生成以及提高菌种对高浓度的有潜在毒性的底物、前体或产品的耐受力

第46页:工业菌种改良方法(二)

  • (4) 抑制或消除产品分解酶
  • (5) 改进菌种外泌产品的能力
  • (6) 消除代谢产品的反馈抑制,如诱导代谢产品的结构类似物抗性

第47页:提高基因的表达水平

  • (1) 引入强转录及翻译信号,可通过在一高效表达载体上克隆靶基因;在靶基因的上游引入强启动子;修改现有表达信号,提高基因效力等
  • (2) 诱导解除基因表达抑制的突变

第48页:改进菌种的生长效率

  • 提高菌株对底物的利用率方法:a. 通过确定并改变代谢中的耗能部分
  • b. 由另一菌株的高效低能代谢途径代谢来实现
  • c. 赋予菌种对多种底物,特别是价廉而丰富的底物的利用能力,由此可降低操作费用

第49页:诱变育种

  • 以微生物的自然变异作为基础的生产选种的机率并不很高,一个基因的自然突变频率仅 10⁻⁶~10⁻¹⁰ 左右
  • 诱变育种:以诱发突变为基础的育种,是迄今为止国内外提高菌种产量、性能的主要手段

第50页:诱变方法的分类

诱变方法分为物理诱变、化学诱变或生物诱变方法三大类。

第51页:物理诱变剂

  • 物理诱变剂:射线如紫外线、X 射线、γ 射线、快中子
  • 物理因素中目前使用得最方便而且十分有效的是紫外线,许多高产菌株的选育都用过紫外线,对于一般实验室、中小型工厂都适用,也很安全
  • 其他的几种射线都是电离性质的,有一定的穿透力,一般都由专业人员在专门的设备中使用,否则有一定危险性

第52页:化学诱变剂

  • 化学诱变剂:化学因子如碱基类似物、5-氟尿嘧啶、烷化剂等,其中使用最多、最有效的是烷化剂
  • 使用化学诱变剂的优缺点:1、大多数情况下,就突变数量而言,要比电离辐射更有效

第53页:化学诱变剂的优缺点

  • 2、化学诱变剂是很经济的,因为只需要少量的合适的诱变剂,设备是实验室的一般玻璃器皿、一个蒸气罩;而用电离辐射进行工作时,设备费用大,并要注意安全性
  • 3、大部分诱变剂是致癌剂,所以在使用中必须非常谨慎,要避免化学诱变剂与皮肤接触,且切勿吸入其蒸气;有人对某些诱变剂极其敏感,甚至未直接接触就会过敏

第54页:诱变剂的选择(一)

  • 1.碱基类似物和羟胺具有很高的特异性,但很少使用,回复突变率高,效果不大
  • 2.亚硝酸和烷化剂应用的范围较广,造成的遗传损伤较多,其中亚硝基胍和甲基磺酸乙酯常被称为超诱变剂,甲基磺酸乙酯是毒性最小的诱变剂之一

第55页:诱变剂的选择(二)

  • 3.吖啶类诱变剂可以造成生化代谢途径的完全中断
  • 4.紫外线仍十分有效;电离辐射是造成染色体巨大损伤的最好诱变剂,它能造成不可回复的缺失突变,但它可能影响邻近基因的性能

第56页:诱变育种的五个步骤

  • 二、诱变育种步骤:出发菌株的选择
  • 处理菌悬液的制备
  • 诱变处理
  • 中间培养
  • 分离和筛选

第57页:出发菌株的选择(一)

  • 1.自然界新分离的野生型菌株,对诱变处理较敏感,容易达到好的效果
  • 2.在生产中经生产选种得到的菌株与野生型较相像,也是良好的出发菌株
  • 3.每次诱变处理都有一定提高的菌株,往往多次诱变能积累较多的提高
  • 4.出发菌株开始时可以同时选 2~3 株,在处理比较后,将更适合的出发菌株留作继续诱变

第58页:出发菌株的选择(二)

  • 5.要尽量选择单倍体细胞、单核或核少的多细胞体来作出发诱变细胞,这是由于变异性状大部分是隐性的,特别是高产基因
  • 6.根据采用的诱变剂或根据细胞生理状态或诱变谱选择诱变剂,因为同一诱变剂的重复处理会使细胞产生抗性,使诱变效果下降;有的诱变剂是作用于营养细胞,就要选对数期的细胞;有的作用于休止期,就可选用孢子

第59页:处理菌悬液的制备

(二)处理菌悬液的制备:这一步骤的关键是制备单细胞和单孢子状态的、活力类似的菌悬液,为此要进行合适培养基的培养,并要离心、洗涤、过滤。

第60页:诱变处理

(三)诱变处理:根据前面有关诱变剂及诱变处理的介绍,结合诱变对象的实际,设计诱变处理方案。

第61页:中间培养的作用

(四)中间培养:由于在发生了突变尚未表现出来之前,有一个表现延迟的过程,即细胞内原有酶量的稀释过程(生理延迟),需 3 代以上的繁殖才能将突变性状表现出来。这个过程对今后的筛选和获得稳定菌株都是极为重要的。

第62页:中间培养的方法

方法:让变异处理后细胞在液体培养基中培养几小时,以让细胞的遗传物质复制,让细胞繁殖几代,以得到纯的变异细胞。这样,隐性的变异就会显现出来;若不经液体培养基的中间培养,直接在平皿上分离就会出现变异和不变异细胞同时存在于一个菌落内的可能,形成混杂菌落,以致造成筛选结果的不稳定和将来的菌株退化。

第63页:分离和筛选

  • 筛选分初筛和复筛
  • 初筛以迅速筛出大量的达到初步要求的分离菌落为目的,以量为主
  • 复筛则是精选,以质为主,也就是以精确度为主
  • 例如初筛可以在平皿上直接以菌落的代谢产物与某些染料或基质的作用形成的变色圈或透明圈的大小来挑取参加复筛者,而将 90% 的菌落淘汰;在数量减少后就要仔细比较参加复筛和再复筛的菌株,最后才能选得优秀菌株
  • 在以后的复筛阶段,还应不断结合自然分离,纯化菌株

第64页:紫外线诱变育种

紫外线诱变一般采用 15W 紫外线杀菌灯,波长为 2537Å,灯与处理物的距离为 15~30cm,照射时间依菌种而异,一般为几秒至几十分钟。一般我们常以细胞的死亡率表示,希望照射的剂量死亡率控制在 70~80% 为宜。

第65页:紫外线照射的操作要点

  • 被照射的菌悬液细胞数,细菌为 10⁶ 个/ml 左右,霉菌孢子和酵母细胞为 10⁶~10⁷ 个/ml
  • 由于紫外线穿透力不强,要求照射液不要太深,约 0.5~1.0cm 厚,同时要用电磁搅拌器或手工进行搅拌,使照射均匀
  • 由于紫外线照射后有光复活效应,所以照射时和照射后的处理应在红灯下进行

第66页:紫外线诱变操作步骤(一)

  • 1.将细菌培养液以 3000r/min 离心 5min,倾去上清液,将菌体打散加入无菌生理盐水再离心洗涤
  • 2.将菌悬液放入一已灭菌的、装有玻璃珠的三角瓶内用手摇动,以打散菌体;将菌液倒入有定性滤纸的漏斗内过滤,单细胞滤液装入试管内,一般处于浑浊态的细胞液含细胞数可达 10⁸ 个/ml 左右,作为待处理菌悬液

第67页:紫外线诱变操作步骤(二)

3.取 2~4ml 制备的菌液加到直径 9cm 培养皿内,放入一无菌磁力搅拌子,然后置磁力搅拌器上、15W 紫外线下 30cm 处。在正式照射前,应先开紫外线 10min,让紫外灯预热,然后开启皿盖正式在搅拌下照射 10~50s。操作均应在红灯下进行,或用黑纸包住,避免白炽光。

第68页:紫外线诱变操作步骤(三)

  • 4.取未照射的制备菌液和照射菌液各 0.5ml 进行稀释分离,计数活菌细胞数
  • 5.取照射菌液 2ml 于液体培养基中(300ml 三角瓶内装 30ml 培养液),120r/min 振荡培养 4~6h
  • 6.取中间培养液稀释分离、培养
  • 7.挑取菌落进行筛选

第69页:亚硝基胍诱变曲霉菌

N-甲基-N'-硝基-N-亚硝基胍(NGN、MNNG 或 TG)对真核或原核微生物都有强烈的诱变作用。其精确的作用机制尚不很清楚,据认为是伴随着重氮甲烷的生成及在酸性条件下生成亚硝酸,直接作用于细胞内的 DNA 复制系统,从而诱发了变异。MNNG 的诱变作用随 pH 的升高而增强。

第70页:MNNG诱变操作步骤(一)

  • 1.单孢子悬液制备:取斜面,加入 6ml 0.1mol/L pH6.0 的磷酸缓冲液,用接种环刮下孢子,振荡试管,立即通过带滤纸漏斗过滤,由此制得单孢子悬液;若孢子液浑浊状,其孢子浓度可达 10⁶ 个/ml,此为待处理孢子悬液
  • 2.MNNG 溶液的制备:用分析天平称取 2mg,加入 2ml 0.1mol/L pH6.0 磷酸缓冲液,于暗处振荡溶解

第71页:MNNG诱变操作步骤(二)

  • 3.诱变处理:吸取 MNNG 溶液 1ml,加入到 1ml 孢子悬液中,30℃ 振荡 30min,立即稀释 1000 倍停止作用,然后以 10⁻²、10⁻⁴ 两个稀释度分离培养,30℃ 3 天后计数
  • 4.死亡率计算:将未处理的孢子液 1ml 加入 1ml 磷酸缓冲液中,同上逐级稀释分离,30℃ 下培养 3 天,根据处理前后的活孢子数可计算出死亡率
  • 5.挑取菌落进行糖化酶及蛋白酶产量筛选

第72页:营养缺陷型

营养缺陷型
通过诱变而产生的缺乏合成某些营养物质如氨基酸、维生素和碱基等能力的变异株,必须在其基本培养基中加入相应的营养成分才能正常生长
野生型
与营养缺陷型对应、能在基本培养基上正常生长的菌株

第73页:三类培养基

基本培养基(MM)
能满足野生型菌株正常生长的培养基
补充培养基(SM)
在基本培养基中加入相应的营养成分的培养基
完全培养基(CM)
能满足各种营养缺陷型生长的培养基,如牛肉膏蛋白胨培养基、麦芽汁培养基等

第74页:营养缺陷型的用途

营养缺陷型在生产上和科学研究上用途很大。目前生产氨基酸、核苷酸的菌种都是各种类型的缺陷型。要研究代谢途径、育种技术都必须有营养缺陷型的菌株为材料。

第75页:筛选营养缺陷型的步骤

  • 筛选营养缺陷型的步骤:诱变
  • 淘汰野生型
  • 检出缺陷型
  • 确定生长谱

第76页:营养缺陷型的诱变方法

  • 一、诱变方法:物理诱变
  • 化学诱变

第77页:淘汰野生型

抗生素法
野生型能在 MM 中生长而缺陷型不能,将诱变处理液在 MM 中培养短时让野生型生长处于活化阶段,缺陷型无法生长仍处于休眠状态;由于细菌或酵母对一些抗生素敏感,加入一定量的抗生素即可杀死活化状态的野生型而保存缺陷型,一般细菌可以采用青霉素,酵母可采用制霉菌素
菌丝过滤法
对于霉菌,因孢子生长后会长出菌丝体,就可用滤纸过滤法将菌丝滤去,而缺陷型孢子却因未发芽而不能滤过

第78页:检出缺陷型的原理

原理
在固体基本培养基和完全培养基上,生长情况完全不同,缺陷型在 CM 上生长良好,而在 MM 上则不生长,野生型都能生长
具体方法
影印法、点种法、夹层法

第79页:影印法操作步骤(一)

  • 1.将一较平皿直径小 1cm 的金属圆筒蒙上一层灭菌的丝绒,用金属夹夹住,灭菌
  • 2.将完全培养基上长出的全部菌落在丝绒上轻轻一压,使之成为印模,标记方位
  • 3.将基本培养基平皿和完全培养基平皿在标记的同一方位上先后轻轻一压,此菌印模即复印于上

第80页:影印法操作步骤(二)

  • 4.将 CM 和 MM 在恒温箱中培养
  • 5.二平皿相同方位进行比较,即可发现在 MM 平皿上长出的菌落少于 CM 平板上的;MM 上未长而相应于 CM 上长出的那几个菌落就可能是缺陷型
  • 此法要求平皿上菌落不能太多,菌落之间应有一定间隔

第81页:点种法

点种法
也就是任意法,用接种针或牙签将 CM 上长出的菌落在 MM 和 CM 两副平板上接种,依次在相应位置点种,然后一起培养,观察其生长情况
特点
此法结果明确,但工作量大

第82页:夹层法

操作
先在培养皿上倒一层基本琼脂培养基,凝固后涂上一层含菌的 MM,凝固后再倒一薄层 MM 琼脂培养基,培养 24h,将出现的菌落标记,然后倒上一层 CM 琼脂培养基再培养,这时第二批长出的菌落就可能是缺陷型
缺点
结果有时不明确,而且将缺陷型菌落从夹层中挑出并不很容易

第83页:生长谱的确定

四、营养缺陷型生长谱的确定:验证确定是缺陷型后,就需确定其缺陷的因子,即生长谱测定。

第84页:生长谱测定的方法(一)

生长谱测定的方法:将缺陷型菌株培养后,收集菌体,制备成细胞悬液,与 MM 培养基(融化并凉至 50℃)混合并倾注平皿。待凝固后,分别在平皿的 5~6 个区间放上不同的营养组合的混合物或吸饱此组合营养物的滤纸圆片。培养后会在某组合区长出,就可测得所需营养。一个平皿测一个菌。

第85页:生长谱测定的方法(二)

以不同组合的营养混合物与融化凉至 50℃ 的 MM 培养基混合铺成平皿,然后在这些平皿上划线接种各个缺陷型菌株于各相应位置,培养后根据在这些组合长出可推知其营养因子。在 5~6 个平皿上可测 20 株菌以上。

第86页:基因重组育种

第六节 基因育种:基因重组育种是运用体外 DNA 各种操作或修改手法获得目的基因,再借助于病毒、细菌质粒或其他载体,将目的基因转移至新的宿主细胞并使其在新的宿主细胞系统内进行复制和表达,或者通过细胞间的相互作用,使一个细胞的优秀性状经其间遗传物质的交换而转移给另一个细胞的方法。

第87页:基因克隆的五个步骤

  • 一个完整的基因克隆过程包括以下步骤
  • 1、获得待克隆的 DNA 片段(基因)
  • 2、目的基因与载体在体外连接
  • 3、重组 DNA 分子导入宿主细胞
  • 4、筛选、鉴定阳性重组子
  • 5、重组子的扩增与/或表达

第88页:基因重组

2.2 基因重组:本节介绍质粒的特点、质粒载体、转化以及重组 DNA 的操作。

第89页:质粒的特点

  • 1、质粒的存在并非微生物生命活动必需
  • 2、每个细胞中存在的质粒数称为该质粒的拷贝数,不同类型的质粒其拷贝数各异,同一质粒在不同条件下,拷贝数也可能差异很大,有严紧型和松弛型两种
  • 3、质粒 DNA 分子常呈现三种形态:常见的一种是共价、闭环状 DNA(CCC DNA);其次是由于一条链有缺口而产生的开环 DNA(oc DNA);第三种是由双环分子两段均断裂而产生的线性 DNA

第90页:质粒载体

质粒载体:质粒经改造后用作携带外源 DNA 进入宿主细胞进行扩增和表达的载体。

第91页:质粒赋予宿主的表现型

  • 各类质粒所赋予宿主细胞的不同表现型:抗生素抗性
  • 抗生素的产生
  • 大肠杆菌素的产生
  • 肠毒素的产生
  • 复杂有机化合物的降解
  • 限制性核酸内切酶和修饰酶的产生
  • 杀伤性能
  • 在自然条件下,许多质粒可经细菌接合或相似方式在宿主间相互转移;在实验室条件下,质粒也可经人工手段将其转化入宿主细胞内

第92页:质粒DNA的提取方法

  • 三、质粒 DNA 的提取方法:细菌培养和质粒扩增
  • 细菌的收获和裂解
  • 质粒 DNA 的提取

第93页:遗传转化的概念

四、遗传转化:转化是指受体细胞直接摄取供体细胞游离的 DNA 片段,将其同源部分进行碱基配对,组合到自己的基因中,从而获得供体细胞的某些遗传性状。

第94页:转化操作步骤(一)

  • (二) 操作步骤:质粒 DNA 转化感受态大肠杆菌
  • 1.从琼脂平板上挑取新鲜菌落接入 10ml 肉汤培养基中,37℃ 培养过夜
  • 2.取 0.5ml 培养物接入 50ml 肉汤中,无菌添加 0.4ml 2.5mol/L MgCl₂,于 37℃ 振荡培养
  • 3.将 0.1mol/L CaCl₂ 溶液、试管及吸管在冰浴中冷却

第95页:转化操作步骤(二)

  • 4.当培养物 OD600 在 0.5~0.8 左右时,开始收获细胞(大约需 2~2.5h)
  • 5.将培养物置冰浴中冷却 10min
  • 6.取 10ml 培养物置 2 个冷离心管中弃去上清液

第96页:转化操作步骤(三)

  • 7.加入 1ml 0.1mol/L CaCl₂,再加 0.9ml CaCl₂,置冰浴中放置 20min
  • 8.3000r/min 离心 10min,弃去上清液
  • 9.加入 1ml 0.1mol/L CaCl₂,重新悬浮细胞,置冰浴中保存
  • 10.加入 1~20μl 待转化质粒 DNA 溶液

第97页:转化操作步骤(四)

  • 11.在冰上放置 20min,在 37℃ 处理 2min,再插入冰中;加入 0.9ml 肉汤 37℃ 静置培养 90min
  • 12.以不同的量涂布选择培养基平板
  • 13.于 37℃ 培养过夜,鉴定转化菌落

第98页:常用的遗传转化系统

  • 常用的遗传转化系统:1、自然系统
  • 2、人工诱导(完整细胞):(1)二价阳离子系统:Ca²⁺,Ca²⁺+Mg²⁺,Mg²⁺,Ca²⁺+辅助噬菌体,Tris+Ca²⁺;(2)单价阳离子系统:PEG+Li⁺/Cs⁺/Rb⁺;(3)冻融系统;(4)Triton 处理:人工诱导(PEG/原生质体)

第99页:重组DNA的工具酶

重组 DNA 中常用的工具酶包括限制性核酸内切酶、DNA 连接酶、DNA 聚合酶、逆转录酶等。

第100页:限制性内切酶

  • 限制性内切酶:切开 DNA 分子所需的酶,每一种酶都有其各自的作用位点
  • 常用限制性内切酶的种类及特性(W. Arber, H. O. Smith)

第101页:限制性内切酶的剪切方式

限制性内切酶的剪切方式:本节介绍酶切后产生的粘性末端与平末端两种形式。

第102页:粘性末端

粘性末端:切开后的两段 DNA 各留下一个尾,这 2 个尾的核苷酸顺序完全一样,但方向相反。它们之间是互补的,在适当条件下可以再连接一起。

第103页:其它工具酶

  • 其它工具酶:连接酶 T4 DNA
  • 修补工具酶 DNA 聚合酶 I
  • 末端加工酶 S1 核酸酶、碱性磷酸单酯酶
  • 末端转移酶人工加 polyA 或 polyT 尾
  • 反转录酶

第104页:载体与宿主系统

载体(vector)
携带外源 DNA 进入宿主细胞进行扩增和表达的 DNA
构建来源
一般是通过改造质粒、噬菌体或病毒等构建的

第105页:载体应具备的条件

  • 载体应具备以下条件
  • 1、能在适当的宿主细胞中复制
  • 2、具有多种限制酶的单一切点(即所谓多克隆位点)以便外源 DNA 插入
  • 3、具有筛选标志以区别阳性与阴性重组分子
  • 4、载体分子较小,以便体外基因操作,同时载体 DNA 与宿主 DNA 便于分离
  • 5、对于表达型载体还应具有与宿主细胞相适应的启动子、增强子、加尾信号等基因表达元件

第106页:宿主细胞的条件

  • 宿主细胞必须符合以下条件
  • 1、对载体的复制和扩增没有严格的限制
  • 2、不存在特异的内切酶体系降解外源 DNA
  • 3、在重组 DNA 增殖过程中,不会对它进行修饰
  • 4、重组缺陷型,不会产生体内重组
  • 5、容易导入重组 DNA 分子
  • 6、符合重组 DNA 操作的安全标准

第107页:目的基因的获取

通过建立基因文库分离靶基因
基因文库包括两类:基因组文库,利用限制性内切酶;cDNA,用 mRNA 反转录成单链 DNA,再经 DNA 聚合酶的作用产生双链 DNA,可去除真核生物基因中不表达的内含子

第108页:基因的制备与扩增

  • 二、化学合成法制备 DNA 片段:从蛋白质肽链的氨基酸顺序可以知道它的遗传密码,再依照密码合成基因
  • 三、聚合酶链反应法扩增基因片段:对于已知全部或部分核苷酸序列的基因,可以通过聚合酶链反应(PCR),以基因组 DNA 或 cDNA 为模板扩增得到目的基因片段

第109页:PCR技术

  • PCR 技术:根据需扩增片段的两端设计引物
  • 使 DNA 解链(高温),引物结合于基因的两端(低温),在合适温度下开始合成(链延长)反应
  • 特点:需要很少的 DNA 模板,且能直接从基因组中得到目的基因

第110页:

第111页:克隆载体的条件

  • DNA 片断的克隆载体的条件:a 复制起点
  • b 适宜的限制酶切点
  • c 选择标记

第112页:DNA分子的体外连接

DNA 分子的体外连接:DNA 片段的体外连接是重组 DNA 技术的关键,DNA 连接是由 DNA 连接酶催化完成的。

第113页:DNA连接酶

  • 一、DNA 连接酶:DNA 连接酶催化两条双链 DNA 片段相邻的 5'-磷酸和 3'-羟基间形成磷酸二酯键
  • 在分子克隆中最有用的 DNA 连接酶是来自 T4 噬菌体的 DNA 连接酶
  • T4 DNA 连接酶在分子克隆中主要用于:1、连接具有同源互补粘性末端的 DNA 片段;2、连接双链 DNA 分子间的平端;3、在双链平端的 DNA 分子上添加合成的人工接头或适配子

第114页:重组DNA导入宿主菌

重组 DNA 导入宿主菌:体外连接的重组 DNA 分子必须导入适当的受体细胞中才能大量的复制、增殖和表达。根据所采用的载体的性质,将重组 DNA 分子导入受体可有不同的方法。

第115页:转化

一、转化
指以细菌质粒为载体,将外源基因导入受体细胞的过程;转化时,细菌必须经过适当的处理使之处于感受态,即容易接受外源 DNA 的状态,然后利用短暂热休克使 DNA 导入细菌宿主中
电穿孔法
此外还可用电穿孔法转化细菌,它的优点是操作简便、转化效率高、适用于任何菌株

第116页:转染和感染

二、转染和感染
利用噬菌体 DNA 作为载体时可经两种方式导入受体菌
感染
在体外将噬菌体 DNA 包装成病毒颗粒,然后使其感染受体菌
转染
在 DNA 连接酶作用下使噬菌体 DNA 环化,再象重组质粒一样地转化进受体菌;习惯上常把以噬菌体 DNA 为载体构建成的重组子导入细胞的过程统称为转染

第117页:重组克隆的筛选与鉴定

重组克隆的筛选与鉴定:基因克隆的最后一步是从转化细菌菌落中筛选出含有阳性重组子的菌落,并鉴定重组子的正确性。通过细菌培养以及重组子的扩增,获得所需的基因片段的大量拷贝,进一步研究该基因的结构、功能,或表达该基因的产物。

第118页:抗药性标志的筛选

  • 一、抗药性标志的筛选:如果克隆载体带有某种抗药性标志基因如 ampʳ 或 tetʳ,转化后只有含这种抗药基因的转化子细菌才能在含该抗菌素的平板上幸存并形成菌落,这样就可将转化菌与非转化菌区别开来
  • 如果重组 DNA 时将外源基因插入标志基因内,该标志基因失活,通过有无抗菌素培养基对比培养,还可区分单纯载体或重组载体(含外源基因)的转化菌落

第119页:β-半乳糖苷酶系统筛选

  • 二、β-半乳糖苷酶系统筛选:很多载体都携带一段细菌的 lacZ 基因,它编码 β-半乳糖苷酶 N 端的 146 个氨基酸,称为 α-肽
  • 当载体与宿主细胞同时表达两个片段时,宿主细胞才有 β-半乳糖苷酶活性,使特异的底物 X-gal 变为兰色化合物,这就是所谓的 α-互补
  • 而重组子由于基因插入使 α-肽基因失活,不能形成 α-互补,在含 X-gal 的平板上,含阳性重组子的细菌为无色菌落或噬菌斑

第120页:菌落裂解与内切酶鉴定

  • 三、菌落快速裂解鉴定法:从平板上直接挑选菌落裂解后,直接电泳检测载体质粒大小,判断有无插入片段存在,该法适于插入片段较大的重组子初筛
  • 四、内切酶图谱鉴定:经初筛鉴定有重组子的菌落,小量培养后,再分离出重组质粒或重组噬菌体 DNA,用相应的内切酶切割,释放出插入片段;对于可能存在双向插入的重组子,还要用内切酶消化鉴定插入的方向

第121页:重组DNA的鉴定方法

重组 DNA 的鉴定:本节介绍重组 DNA 的遗传学鉴定方法。

第122页:杂交育种

第七节 杂交育种:本节介绍细菌杂交与酵母杂交育种技术。

第123页:细菌杂交

  • (一) 细菌杂交:在细菌中实现杂交的种类尚不多,主要是大肠杆菌,其他还有鼠伤寒沙门氏菌、铜绿假单胞菌、淋病奈氏球菌等
  • 大肠杆菌中存在着致育因子 F,有 F 因子为 F⁺,没有 F 因子称 F⁻
  • F 因子存在于细胞中的形式:游离状态(F⁺ 细胞);整合状态,即 F 因子插入胞核质的一定位置上(Hfr 细胞)
  • F 因子有明显的感染性,大肠杆菌的接合实质上是 F 因子的转移,所以 F⁺ 和 Hfr 称供体菌,而 F⁻ 称受体菌

第124页:酵母的繁殖方式

(二)酵母杂交育种技术 1、酵母繁殖方式:酵母为单细胞型真菌,一般以出芽方式生殖,在通常情况下繁殖体为双倍体,但经过特定条件的诱导,可使其产生单倍体孢子并可出芽产生单倍体繁殖体。

第125页:酵母的交配型

单倍体细胞具 α 及 a 两种交配型。两种交配型细胞经其细胞壁上特定的凝聚因子诱导而进行交配,恢复为双倍体;同一交配型细胞之间,则因细胞壁上凝集因子的存在而不能进行交配。在生活过程中,酵母细胞还可以形成三倍体、四倍体、多倍体或非整倍体细胞。

原文此处写作「α及ε2两种交配型」,据内容应为 α 与 a 两种交配型,已作修正。

第126页:酵母杂交

  • 2、酵母杂交:一般而言,杂交育种运用了酵母的单双倍生活周期,将不同基因型和相对的交配型的单倍体细胞经诱导杂交而形成二倍体细胞,经筛选便可获得新的遗传性状
  • 酵母的杂交方法有孢子杂交法、群体交配法、单倍体细胞杂交法和罕见交配法,就啤酒酵母而言,运用罕见交配法更易获得结果

第127页:原生质体育种

  • 第八节 原生质体育种:原生质体育种技术主要有原生质体融合、原生质体转化技术,此外尚有原生质体诱变育种等
  • 原生质体融合育种是基因重组的一种重要方法
  • 原生质体融合作为一种新的基因重组手段是 1978 年第三届国际工业微生物遗传学讨论会上提出来的

第128页:原生质体融合的特点(一)

  • 一、原生质体融合育种的特点
  • (一) 杂交频率较高:细胞壁去除后在高渗条件下形成类似于球形的原生质体
  • (二) 受接合型或致育型的限制较小:二亲株中任何一株都可能起受体或供体的作用,因此有利于不同种属间微生物的杂交
  • (三) 遗传物质传递更为完整:原生质体融合是二亲株的细胞质和细胞核进行类似的合二为一的过程

第129页:原生质体融合的特点(二)

  • (四) 存在着两株以上亲株同时参与融合形成融合子的可能性
  • (五)有可能采用产量性状较高的菌株作融合亲株
  • (六) 提高菌株产量的潜力较大
  • (七) 有助于建立工业微生物转化体系

第130页:原生质体融合育种步骤

  • 二、原生质体融合育种步骤
  • 1.标记菌株的筛选和稳定性验证
  • 2.原生质体制备
  • 3.等量原生质体加聚乙二醇促进融合
  • 4.涂布于再生培养基,再生出菌落
  • 5.选择性培养基上划线生长,分离验证,挑取融合子进一步试验、保藏
  • 6.生产性能筛选

第131页:标记菌种的选择

三、原生质体融合育种的要点(一)标记菌种的选择:获得标记菌种的方法是采用常规诱变育种,筛选出营养缺陷型或/和抗药性菌株。这里最重要的是标记必须稳定。采用抗药性菌株除可作标记外,在实验室中还可排除杂菌污染的干扰。为的是确证融合的成功,可以采用多标记菌种。

第132页:原生质体的制备

(二) 原生质体的制备:原生质体的制备主要是在高渗压溶液中加入细胞壁分解酶,将细胞壁分离剥离,结果剩下由原生质膜包住的类似球状的细胞,它保持原细胞的一切活性。在放线菌和细菌中,制备原生质体主要采用溶菌酶;酵母和霉菌一般可用蜗牛酶或纤维素酶等。

第133页:影响原生质体制备的因素(一)

  • 影响原生质体制备的因素
  • 1.菌体的前处理:为了使酶作用的效果好一些,可将菌作一些前处理,如细菌加入亚抑制剂量的青霉素
  • 2.菌体的培养时间:为了使细胞易于原生质体化,一般选择增殖期的菌体
  • 3.酶浓度:对于不同种属的微生物,不仅对酶的种类要求不同,就是对酶的浓度也有差异;另外,最佳酶浓度还随不同的生长期的菌体而变化

第134页:影响原生质体制备的因素(二)

  • 4.酶处理温度
  • 5.破壁时的 pH 值
  • 6.渗透压稳定剂:等渗透压在原生质体制备中,不仅起到保护原生质体免于膨裂的作用,而且还有助于酶和底物的结合,渗透压稳定剂多采用甘露醇、山梨醇、蔗糖等有机物和 KCl 和 NaCl 等无机物

第135页:筛选新的代谢产物

第九节 筛选新的代谢产物:本节介绍开发新代谢产物的途径、筛选程序、目标与方法。

第136页:开发新代谢产物的途径

  • 一、开发新的代谢产物的途径
  • (1) 从自然界分离新的微生物菌株,或采用新的检阅方法筛选新的代谢产物
  • (2) 对已知微生物的代谢产物进行化学修饰
  • (3) 利用微生物转化改造代谢产物的结构
  • (4) 通过原生质体融合获得新的代谢产物
  • (5) DNA 重组技术

第137页:筛选新代谢产物的程序

二、筛选微生物新的代谢产物的程序:本节介绍突变型菌株的筛选,首先是产量性状突变株的筛选。

第138页:

第139页:突变型菌株的筛选

突变型菌株的筛选:一、产量性状突变株的筛选。

第140页:筛选代谢产物的目标

  • 三、筛选微生物代谢产物的目标
  • 筛选克服抗生素抗性菌株的活性物质
  • 筛选抗肿瘤、抗病毒的活性物质
  • 研究有药理活性的酶抑制剂及免疫调节剂
  • 寻找食品工业最好的酵母培养物
  • 筛选降解有害物质的微生物以及治疗上具有低毒、长效的化学药物等

第141页:筛选的直接方法

四、筛选微生物代谢产物的方法(一)直接方法
为了尽快确定微生物代谢产物的利用前途,在体外试验测得活性后,可以将培养液的有效成分直接作用于机体,观察被测样品的疗效
动物体内治疗试验
这种直接确定代谢产物用途的方法亦称动物体内治疗试验

第142页:

第143页:筛选的间接方法

  • (二)间接方法:筛选医用抗生素,可用细菌、真菌、病毒或肿瘤模型,寻找抗细菌、抗真菌、抗病毒、抗肿瘤抗生素、酶抑制剂、免疫制剂等有效物质
  • 在预筛选时,多用琼脂平板扩散抑菌法。通过预筛选,直接测定最初分离物的生物活性,能加速筛选过程

第144页:检测系统

五、检测系统:筛选过程的成功依赖于排除那些已知的或并非需要的代谢产物的检验方法,这样才能识别出人们需要的化合物。

第145页:性能鉴别

性能鉴别
性能鉴别是分离和筛选微生物代谢产物中最基础的工作
鉴别两方面
一是对微生物方面进行形态、培养、生化功能等试验观察,并确定微生物产生菌的类群;二是从化学的早期鉴别来鉴别微生物的代谢产物

第146页:化学的早期鉴别

  • 化学的早期鉴别一般对产生菌所产生的代谢产物进行纸上层析、薄板层析、纸上电泳、抗菌谱、高压电泳、紫外分光光度法、液相和气相色谱等试验,并获得各种图谱,与已知图谱进行比较鉴别

第147页:产物的进一步研究

  • 如果认为是有实用前途的代谢产物,则要进一步大量培养,并进行动物试验、毒性考查、药物代谢等实验,并进行提高发酵水平和改善提取工艺的工作,以备投入生产
  • 如果是新的代谢产物,一般要进一步确定其化学结构,并在此基础上进行合成法的研究或进行化学改造,研究结构与生物活性的相互关系,并对作用机制、生物合成过程作进一步的研究

第148页:菌种筛选方法

菌种筛选方法:诱变处理后,突变细胞只占存活细胞的百分之几,而能使生产状况提高的细胞又只是突变细胞中的少数。为了花费最少的工作量,在最短的时间内取得最大的筛选成效,就要求采用效率较高的科学筛选方案和手段。

第149页:菌种筛选方案

初筛
目的是删去明确不符合要求的大部分菌株,把生产性状类似的菌株尽量保留下来,使优良菌种不致于漏网;初筛工作以量为主,测定的精确性还在其次,初筛的手段应尽可能快速、简单
复筛
复筛的目的是确认符合生产要求的菌株,所以复筛步骤以质为主,应精确测定每个菌株的生产指标

第150页:菌种筛选的手段

  • 菌种筛选的手段
  • 初筛:从菌体形态变异分析
  • 平皿快速检测法:具体的有纸片培养显色法、变色圈法、透明圈法、生长圈法和抑制圈法等
  • 摇瓶培养法也可用于初筛:初筛的摇瓶培养一般是一个菌株只做一次发酵测定,从大量菌株中选出 10-20% 较好的菌株,淘汰 80-90% 的菌株;而复筛中摇瓶培养一般是一个菌株培养 3 瓶,选出 3-5 个较好的菌株,再做进一步比较,选出最佳的菌株

第151页:营养缺陷型突变株的筛选

特殊变异菌的筛选方法之营养缺陷型突变株的筛选:经诱变处理后的菌悬液在筛选前一般应先进行诱变后培养,以促使变异细胞发生分离,防止出现表型延迟现象,筛选出不纯的菌株。营养缺陷型的筛选一般包括浓缩、进一步检出和鉴别营养缺陷型等步骤。

第152页:抗性突变菌株的筛选

  • 抗性突变菌株的筛选:抗性突变株的筛选相对比较容易,只要有 10⁻⁶ 频率的突变体存在,就容易筛选出来
  • 抗性突变株的筛选常用的有一次性筛选法和阶梯性筛选法两种手段

第153页:一次性与阶梯性筛选法

一次性筛选法
适用于噬菌体抗性菌株、耐高温菌株的筛选
阶梯性筛选法
适用于药物抗性突变株的筛选

第154页:组成酶变异株的筛选

  • 组成酶变异株的筛选:许多水解酶是诱导酶,只有在含有底物或底物类似物的培养环境中,微生物才会合成这些酶类,所以诱导酶的生产不仅需要诱导物,而且受到诱导物的种类、数量以及分解产物的影响
  • 具体的筛选方法有恒化器法、循环培养法和诱导抑制物法

第155页:恒化器法

1) 恒化器法:常被用于微生物的驯化。在培养基中添加不能起诱导作用的低浓度底物,菌生长速率极慢,而群体中少数组成型变异株则可合成有关的酶,分解利用该底物,生长速率较快。为了提高组成酶变异株的优势,即它在群体中的比例,可以应用恒化器培养技术。随着恒化器培养中不断加入新鲜基质而逐渐增大组成酶变异株的优势,这样就能够比较容易地做进一步的纯化分离。

第156页:循环培养法

  • 2) 循环培养法:利用不含诱导物的培养环境和含有诱导物的培养环境进行交替循环培养待分离的菌悬液,从而使组成酶变异株得到富集
  • 当接种到不含诱导物而含有其它可利用碳源的培养基中时,两种类型菌株同样能较好地生长,但在此环境中组成型突变株已能合成有关的水解酶,而诱导型菌株就不能合成

第157页:循环培养法的原理

将它们转接入含诱导物的培养基中时,变异株能迅速利用诱导底物进行生长繁殖,而诱导型出发菌株需经历一个诱导合成酶的阶段,两类菌株的生长就不同步,组成酶变异株所占的比例将逐渐增大。

第158页:诱导抑制剂法

3) 诱导抑制剂法:有些化合物能阻止某些诱导酶的合成,当在诱导物和诱导抑制剂同时存在的培养环境中培养待分离菌群时,诱导型菌株不能产生诱导酶,无法正常生长,只有组成型变异株能够利用底物进行生长繁殖。

第159页:工业微生物菌种保藏技术

第十节 工业微生物菌种保藏技术:在生产发酵中,具有高产有重要经济价值的某一期待代谢产物能力的微生物菌种的保存和长期保藏,对于一成功的工业发酵过程极为重要。

第160页:理想保藏方法的条件

  • 一、理想的菌种保藏方法应具备的条件
  • (1) 经长期保藏后菌种存活健在
  • (2) 保证高产突变株不改变表型和基因型,特别是不改变初级代谢产物和次级代谢产物生产的高产能力
  • (3) 菌种保藏的基本措施是低温、干燥、真空

第161页:菌种保藏技术的种类

  • 二、工业微生物菌种保藏技术
  • (1) 冷冻干燥或真空干燥保藏
  • (2) 超低温或在液氮中冷冻保藏
  • (3) 转接培养或斜面传代保藏
  • (4) 土壤或陶瓷珠等载体干燥保藏

第162页:冷冻保藏

  • 2.1 冷冻保藏:冷冻保藏为保藏微生物菌种的最简单而有效的方法
  • 通过冷冻,使微生物代谢活动停止;一般而言,冷冻温度愈低,效果愈好。为了获得满意的冷冻结果,通常应在培养物中加入一定的冷冻保护剂
  • 冷冻保藏时温度要求在 -20℃ 以下,同时应认真掌握好冷冻速度和解冻速度
  • 冷冻保藏的缺点之一是培养物运输较困难

第163页:冷冻保藏的种类

  • 冷冻保藏种类:一、普通冷冻保藏技术(-20℃)
  • 二、超低温冷冻保藏技术(-60~-80℃)
  • 三、液氮冷冻保藏技术

第164页:普通冷冻保藏技术

  • 普通冷冻保藏技术(-20℃):将液体培养物或从琼脂斜面培养物收获的细胞分接到试管或指管内,然后贮藏于冰箱的冷藏室中,或于温度范围在 -5~-20℃ 的普通冰箱中;或者将菌种培养在小的试管或培养瓶斜面上,待生长适度后将试管或瓶口用橡胶塞严格封好,同上置于冰箱中保存
  • 用此方法可以维持若干微生物的活力 1-2 年

第165页:普通冷冻的注意事项

  • 应注意的是经过一次解冻的菌株培养物不宜再用来保藏
  • 保藏过程中应注意控制保藏温度,培养瓶或试管应严格密封
  • 这一方法虽简便易行,但不适宜多数微生物的长期保藏

第166页:超低温冷冻保藏技术

  • 二、超低温冷冻保藏技术(-60~-80℃):要求长期保藏的微生物菌种,一般都要求在 -60℃ 以下进行保藏
  • 在超低温冷藏柜中保藏菌种的一般方法是:1.离心收获对数生长中期至后期的微生物细胞;2.用新鲜培养基重新悬浮所收获的细胞;3.加入等体积的 20% 甘油或 10% 二甲亚砜;4.混匀后分装入冷冻指管或安瓿中,于 -70℃ 超低温冰箱中保藏

第167页:超低温保藏的补充

  • 如果待保藏菌种生长在斜面上,则可用含 10% 甘油的新配制液体培养基洗涤收获
  • 超低温冰箱的冷冻速度一般控制在 1-2℃/min,若干细菌和真菌菌种可通过此保藏方法保藏 5 年而活力不受影响

第168页:液氮冷冻保护剂

  • 三、液氮冷冻保藏技术(一)冷冻保护剂:在液氮冷冻保藏中,最常用的冷冻保护剂是二甲亚砜和甘油,最终使用浓度一般为甘油 10%、二甲亚砜 5%
  • 所使用的甘油一般用高压蒸汽灭菌,而二甲亚砜最好为过滤灭菌

第169页:液氮保藏菌悬液的制备(一)

  • (二) 液氮冷冻保藏微生物菌种的步骤 1.待冷冻保藏菌种悬液的制备
  • (1) 从生长斜面制备菌悬液:每一斜面加入 5ml 含 10% 甘油的营养液体培养液;用巴氏吸管吹吸斜面制成孢子及菌体细胞悬液;0.5~1ml 分装玻璃安瓿或液氮冷藏专用塑料瓶

第170页:液氮保藏菌悬液的制备(二)

  • (2) 从浸没培养物制备菌悬液:在浸没培养液中加入等体积 20% 无菌甘油;轻轻振荡混匀培养液,如果菌体絮凝较紧,则需先用玻璃珠打散;0.5-1ml 分装玻璃安瓿或液氮冷藏专用塑料瓶,玻璃安瓿用酒精喷灯封口;将所有封好的安瓿置于 5℃ 冰箱中 3min,以使细胞和悬浮培养基之间达到平衡

第171页:控速冷冻步骤(一)

  • 2.控速冷冻
  • (1) 将安瓿或液氮瓶置于铝盒或布袋中,然后置于一较大的金属容器中
  • (2) 将此金属容器置于控速冷冻机的冷冻室中
  • (3) 以 1-2℃/min 的致冷速度降温,直到温度达到相变温度之上几度的细胞冻结点(通常为 -30℃)
  • (4) 补加一定量的液氮至系统中,使细胞在冻结点时尽可能快地发生相变

第172页:控速冷冻步骤(二)

  • (5) 细胞冻结后,将致冷速度降为 1℃/min,直到温度达 -50℃
  • (6) 将安瓿迅速移入液氮罐中于液相(-96℃)或气相(-156℃)中保存;如果无控速冷冻机,则一般可将安瓿或液氮瓶置于 -70℃ 冰箱中冷冻 4h,然后迅速移入液氮罐中保存

第173页:液氮保藏菌种的解冻

  • (三) 复苏
  • 1.从液氮罐中取出所需的安瓿,立即置于冰浴中
  • 2.迅速将安瓿置于 37-40℃ 水浴中,并轻轻摇动以加速解冻
  • 3.用巴氏吸管将安瓿中贮存培养物移接入含有 2ml 无菌液体培养基的试管中,用同一支吸管反复抽吸数次,然后取 0.1-0.2ml(约 4、8 滴)转接入琼脂斜面上

第174页:冻干保藏

  • 2.2 冻干保藏:冷冻干燥的基本方法是通过在减压条件下使冻结的细胞悬液中的水分升华,使培养物干燥,此法是微生物菌种长期保藏的最为有效的方法之一
  • 冷冻干燥过程中必须使用冷冻保护剂,目前国内常用脱脂乳和蔗糖,国外尚有运用动物血清等的
  • 大部分微生物菌种可以在冻干状态下保藏 10 年之久而不丧失活力,而且经冻干后的菌株无需进行冷冻保藏,便于运输

第175页:培养物的冻干过程

培养物的冻干过程:本节按操作步骤介绍冷冻干燥的具体过程。

第176页:冻干操作步骤(一)

  • (二) 操作步骤
  • 1.启动冷冻干燥器的致冷单元,当冷凝器的温度达到 -40℃ 时启动真空泵,使真空度达到 2.67~4.00Pa
  • 2.将冷冻槽置于歧管之下方,槽中装入 2/3 体积的异丙醇,然后插入温度计及可调温控仪降温探头,打开降温探头控制醇浴温度在 -40℃,这一过程约需 30min
  • 3.每支斜面加入 2ml 20% 的脱脂乳,然后用巴氏吸管将斜面上的菌苔吹打下制成孢子或菌体均悬液,最终菌株浓度一般要求在 10⁶CFU/ml;用细菌浸没培养物来保藏时,加入 40% 的脱脂乳,混合制成含 10⁶CFU/ml 的均悬液

第177页:冻干操作步骤(二)

  • 4.取下安瓿上的棉塞,然后用 1ml 移液管分装安瓿(0.2ml/瓿),重新塞好棉塞
  • 5.轻轻振荡安瓿,以使细胞重新悬浮;将安瓿与歧管相联后迅速置于醇浴中,然后调节温控装置,使细胞悬液迅速冻结

第178页:冻干操作步骤(三)

  • 6.15min 后,将歧管与真空泵相通
  • 7.维持 -40℃ 的醇浴温度 90-120min,然后调节温控装置,使醇浴温度上升至 -10℃,维持 2h
  • 8.关掉可调温控装置的降温探头,让醇浴温度上升至室温(25℃)
  • 9.在冷冻干燥的最初 4h 内应定期测真空度,在安瓿置于真空下后 1h 内,真空度必须达到 13.33Pa,并于菌悬液接近干燥时逐渐降到 2.67~4.0Pa

第179页:冻干操作步骤(四)

  • 10.在真空状态下,让安瓿保存在冷冻干燥机中至少 16h 以获得完全干燥
  • 11.干燥后,在 2.67~4.00Pa 的真空度下封瓶
  • 12.在所有安瓿都封盖好后,撤去真空
  • 13.关闭真空泵
  • 14.关闭冷凝器

第180页:冻干菌种的保藏与再生

  • (三) 冻干菌种的保藏与再生
  • 1.保藏:冷冻干燥后的培养物在低于 5℃ 下保藏,较低的保藏温度(-20~-70℃)对于培养物的长期稳定更好
  • 2.复苏:(1) 在超净工作台中用 70% 酒精棉球擦洗安瓿,然后用砂轮在安瓿中锉一道沟;(2) 用无菌纱布或无菌毛巾包好安瓿,然后用手掰开安瓿

第181页:冻干菌种的复水

  • (3) 在安瓿中加入 0.5~1ml 营养液体培养基,慢慢旋转安瓿,使冻干菌种复水,然后将此转接到一含有再生培养基的无菌试管中,或直接接种琼脂斜面或涂布平板
  • (4) 在指管中冻干的菌种通常为絮粉状,可以将此直接振落入盛有 1~2ml 液体培养基的试管中,轻轻振荡 5~10min,然后用此悬液接种适宜的再生培养基

第182页:其他保藏方法

  • 2.3 其他保藏方法:一、传代保藏
  • 二、矿物油中浸没保藏

第183页:传代保藏

  • 一、传代保藏:将菌种定期在新鲜琼脂培养基上传代,然后在一定的生长温度下生长和保存的传代保藏方法
  • 可用于实验室中若干菌种的保藏,此法最为简单和经济,且不要求任何特殊的设备
  • 但此方法易发生培养基干枯、菌体自溶、基因突变

第184页:传代保藏的注意点

  • 因此要求在基本培养基上传代为好,目的是能淘汰突变株;同时转接菌量应保持较低水平
  • 斜面培养物应在密闭容器中于 5℃ 保藏,以防止培养基脱水并能降低代谢活性
  • 此方法一般不适宜作工业生产菌种的长期保藏方法

第185页:矿物油中浸没保藏

  • 二、矿物油中浸没保藏:将琼脂斜面或液体培养物浸入矿物油中于室温下保藏,此方法简便有效
  • 可用于丝状真菌、酵母、细菌和放线菌的保藏,特别对难于冷冻干燥的丝状真菌和难以在固体培养基上形成孢子的担子菌等的保藏更为有效

第186页:矿物油保藏的操作要点

  • 浸没保藏的操作要点是首先让待保藏菌种在适宜的培养基上生长,然后注入经 170℃ 下灭菌 1-2h 的矿物油,矿物油的用量以高出培养物 1cm 为宜
  • 以液体石蜡作为保藏方法时,应对需保藏的菌株预先作试验,因为某些菌株在液体石蜡下生长还十分明显,有些菌株如某些假丝酵母还会同化液体石蜡,也有的对液体石蜡保藏敏感,所有这些菌株都不能用液体石蜡保藏
  • 为了预防不测,一般保藏株 2~3 年也应做一次存活试验

第187页:不同保藏方法的比较

不同菌种保藏方法比较:本节比较冷冻保藏、冻干保藏、传代保藏与矿物油浸没保藏等方法的适用对象与保藏期限。

第188页:基因工程菌的保藏

2.4 基因工程菌的保藏:由载体质粒等携带的外源 DNA 片段通常是遗传不稳定的、且很易丢失其外源质粒复制子。质粒基因通常为宿主细胞生长非必需。一般情况下当细胞丢失这些质粒时,生长速度会加快。

第189页:抗生素选择压的作用

  • 当培养基中加入抗生素时,抗生素提供了一有利于携带质粒的细胞群体的极有用的生长选择压;而且在运用基因工程菌进行发酵时,抗生素的加入可帮助维持质粒复制与染色体复制的协调
  • 我们建议基因工程菌应保藏在含低浓度选择剂的培养基中

第190页:菌种活力与稳定性测定

  • 2.5 微生物活力和稳定性测定:所有保藏菌种的方法都必须是长期可靠地保持菌种的优良性状不变
  • 在保藏时定期检测菌种活力,以确定保藏培养物的保藏期限和保藏方法的可靠性,以及确定在实际保藏过程中出现的细胞死亡程度和遗传稳定性

第191页:工业菌种的检测项目

对工业微生物生产菌种来说,建议保藏菌种的形态学和生化特征(如代谢产物的产生、酶活力、遗传特征及生化指标)应在保藏后加以检测和确定。

第192页:加速保藏试验

  • 加速保藏试验可用于预测保藏过程中保藏培养物的稳定性,在一给定温度下通过对高温下短期活力丧失程度检测,可以用来预测嗜酸乳杆菌的稳定性
  • 成功的菌种长期保藏方法之有价值的指标包括在保藏 6 个月、1 年或更长时间后存活百分率(或存活单位)
  • 细胞群体的形态学特征或一些特别的生化特征应在菌种保藏前后保持同一性,以及实验室中、中试车间中和生产发酵中产品滴度的稳定性,后者极为重要
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