页数:83页文件大小:8.92 MB来源: 生物化学ppt课件
本课件从核酸的化学组成与一级结构入手,系统梳理DNA双螺旋结构要点与核小体组装,比较mRNA、tRNA、rRNA的结构与功能,并说明核酸的紫外吸收、变性复性与解链温度等理化性质。
核酸的结构与功能
Chapter2核酸的结构与功能StructureandFunctionofNucleicAcid
携带和传递遗传信息
核酸(nucleicacid,NA)是以核苷酸为基本组成单位的生物大分子,携带和传递遗传信息。
核酸的发现和研究工作进展
一、核酸的发现和研究工作进展 1868年FridrichMiescher从脓细胞中提取到‘核素’ 1944年Avery等人证实DNA是遗传物质 1953年Watson和Crick发现DNA的双螺旋结构 1968年Nirenberg发现遗传密码 1975年Temin和Baltimore发现逆转录酶 1981年Gilbert和Sanger建立DNA测序方法 1985年Mullis发明PCR技术 1990年美国启动人类基因组计划(HGP) 1994年中国人类基因组计划启动
其余分布于核外
二、核酸的分类及分布90%以上分布于细胞核,其余分布于核外。携带遗传信息,决定细胞和个体的基因型(genotype)分布于胞核、胞液参与细胞内DNA遗传信息的表达。某些病毒RNA也可作为遗传信息的载体脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid,DNA)核糖核酸(ribonucleicacid,RNA)
第一节核酸的化学组成及其一级结构TheChemicalComponentandPrimaryStructureofNucleicAcid
都是含氮化合物
)碱基有五种,都是含氮化合物:嘌呤:腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)尿嘧啶(U)嘧啶:胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T)-DNA-RNA共有
氨基嘌呤
嘌呤(purine)N123N546N789NH10NNNHNNH2腺嘌呤Adenine(6-氨基嘌呤)NNHNHNNH2O鸟嘌呤Guanine(2-氨基,6-氧嘌呤)
令球如衬
\N/H\'-NH;N,-i令朕袒 HN._.N令球如衬HN
胸腺嘧啶
NH3N2546嘧啶(pyrimidine)NNH2NHCytosineNHONHH3CNHOUracil尿嘧啶ONHOThymine胸腺嘧啶O胞嘧啶
紫外吸收性质碱基含有共轭双键,因此对260nm波长的紫外光有较强吸收作用
脱氧核糖
核糖(ribose)(构成RNA)4H3COHHCOH1CHOH2CH5CH2OH2)戊糖4H3COHHCOH1CHOH2COH5CH2OH2’-脱氧核糖(deoxyribose)(构成DNA)
磷酸
)磷酸
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嘌呤的N-9或嘧啶的N-1与戊糖
二、核酸的组成方式1.核苷(ribonucleoside)的形成碱基和核糖或脱氧核糖通过糖苷键连接形成核苷或脱氧核苷 嘌呤的N-9或嘧啶的N-1与戊糖的C-1’脱水形成糖苷键
CR脱氧核苷AdRGdR
OHOCH2NH2NO1N1´胞苷CROHOH核苷:AR,GR,UR,CR脱氧核苷:AdR,GdR,TdR,CdR
CMP脱氧核苷酸
OHHOOPHOOOOCCHH22OOHHOOHHNNNNNNHH22OO核苷酸:AMP,GMP,UMP,CMP脱氧核苷酸:dAMP,dGMP,dTMP,dCMP2.核苷酸(ribonucleotide)的形成核苷(脱氧核苷)和磷酸以磷酸酯键连接形成核苷酸(脱氧核苷酸)
多磷酸核苷酸
体内重要的游离核苷酸及其衍生物 多磷酸核苷酸:NMP,NDP,NTP 环化核苷酸:cAMP,cGMP 含核苷酸的生物活性物质:OOCH2NNNOCH22OOOCHOOOHHHOOOHHHNNNNNNNNNNNNHHH222OOOPPPOOOHHHOOOHOPHOOPPHOOOOHOOHHAADTPPAMPNOCH2ONNNAD+、NADP+、CoA-SH、FAD等都含N有AMPNH2OPOOHOHcAMP
即核酸DNA的组成单位
OHONN2OONNNNNNNNHH22NNONNNNNHH22OOOOHHNNHNNOOHOOOHHOPOO33 OHHOOPPOOOO55 CCHH255 HH22CC3`5`H2C3`AGNH2C5′端HHOOPPOOOO3′端3.核酸的形成核苷酸之间以3’,5’-磷酸二酯键连接形成多核苷酸链,即核酸DNA的组成单位:dAMP、dGMP、dCMP、dTMPRNA的组成单位:AMP、GMP、CMP、UMP
表示方法
PAGTGCTPPPPPOH3 表示方法:5 pApCpTpGpCpT-OH3 5 ACTGCT3
糖苷键磷酸酯键核酸
核糖核酸(RNA)脱氧核糖核酸(DNA)(dNMP)核苷(NR)(NdR)磷酸戊糖(RdR)碱基(AGCTU)核酸的组成24C-N糖苷键磷酸酯键核酸(NA)磷酸二酯键核苷酸(NMP)
两类核酸的基本化学组成比较DNARNA嘌呤碱嘧啶碱腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T)腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(C)尿嘧啶(U)戊糖D-2-脱氧核糖D-核糖 酸dAMP、dGMPdCMP、dTMPAMP、GMPCMP、UMP组成单位碱基
第二节DNA的空间结构与功能DimensionalStructureandFunctionofDNA
碱基组成分析
一.DNA的二级结构 发现的基础:碱基组成分析:Chargaff规则:[A] = [T]、[G]=[C]碱基的理化数据分析:A-T、G-C以氢键配对较合理DNA纤维的X-线衍射图谱分析P3
腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等
Chargaff碱基组成规律(1)腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩尔数相等.A=T鸟嘌呤与胞嘧啶的摩尔数相等.G=C嘌呤总数=嘧啶总数A+G=C+T(2)DNA的组成具有种属特异性(3)DNA的碱基组成没有组织的特异性
围绕一中心轴(设想轴)构成右手双螺旋结构
DNA双螺旋结构要点(Watson、Crick,1953)(1)DNA由两条反向平行的脱氧多核苷酸链组成(两条链的走向为5’→3’和3’→5’),围绕一中心轴(设想轴)构成右手双螺旋结构。
构成DNA的骨架
’5’C3’5’C(2)磷酸基与脱氧核糖在外侧,构成DNA的骨架。碱基在双螺旋内侧,双链中相对的碱基按A=T和G≡C通过氢键配对连接,形成互补.碱基平面与长轴垂直
碱基互补配对:TAGC
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螺旋外侧有大沟小沟相间排列
(3)维持DNA双螺旋稳定的作用力:横向-氢键纵向-碱基堆积力(4)双螺旋的直径为2nm螺距为3.4nm每圈螺旋含有10对碱基,每个碱基平面间距离为0.34nm螺旋外侧有大沟小沟相间排列(B-DNA)
DNA结构的多样性:
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二、DNA的超螺旋结构及其在染色质中的组装(一)DNA的 (superhelix或supercoil)DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。正超螺旋(positivesupercoil)盘绕方向与DNA双螺旋方同相同负超螺旋(negativesupercoil)盘绕方向与DNA双螺旋方向相反
共价闭合的环状双 化超螺旋结构35(二)原核生物DNA的高级结构
被认为是真核生物DNA的三级结构
真核生物染色体由DNA和组蛋白(Histine)构成,其基本单位是核小体(nucleosome),被认为是真核生物DNA的三级结构。36(三)DNA在真核生物细胞核内的组装
核小体的组成: DNA:约200bp组蛋白:H1H2A,H2BH3H4连接区DNA:约60bp
染色体染色质纤维核小体组蛋白DNA
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第三节RNA的结构与功能StructureandFunctionofRNA
修饰蛋白质内质网定位合成的信号识别体
RNA的种类、分布、功能核糖体RNA信使RNA转运RNA小胞浆RNA不均一核RNA小核RNA小核仁RNA细胞核和胞液线粒体功能rRNAmRNAtRNAmtrRNAmtmRNAmttRNAHnRNASnRNASnoRNAscRNA/7SL-RNA核糖体组分蛋白质合成模板转运氨基酸成熟mRNA的前体参与hnRNA的剪接、转运rRNA的加工、修饰蛋白质内质网定位合成的信号识别体的组分
一.信使RNA的结构与功能
外显子hnRNA内含子mRNA*mRNA成熟过程(真核生物):一.信使RNA的结构与功能
形成帽子结构
帽子结构:
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的稳定性维系翻译起始的调控
mRNA核内向胞质的转位mRNA的稳定性维系翻译起始的调控*帽子结构和多聚A尾的功能
抄录并传送至核糖体
*mRNA的功能把DNA所携带的遗传信息,按碱基互补配对原则,抄录并传送至核糖体,用以决定其合成蛋白质的氨基酸排列顺序。
的一级结构特点
*tRNA的一级结构特点 含10~20%稀有碱基,如DHU 3´末端为—CCA-OH 5´末端大多数为G 具有TC二、转运RNA的结构与功能
N二甲基鸟嘌呤
稀有碱基NNHNHNNOCH3CH3N,N二甲基鸟嘌呤NHONHOHHHHNNNHNHNCH2CHCCH3CH3NH双氢尿嘧啶SN6-异戊烯腺嘌呤NHO4-巯尿嘧啶
二级结构: 三叶草形–氨基酸臂–DHU环–TΨC环–反密码环–额外环
活化搬运氨基酸到核糖体
tRNA的三级结构 倒L形tRNA的功能:活化搬运氨基酸到核糖体,参与蛋白质的翻译。
作为蛋白质生物合成的场所
三、核蛋白体RNA的结构与功能*rRNA的结构*rRNA的功能参与组成核蛋白体,作为蛋白质生物合成的场所。
根据沉降系数
*rRNA的种类(根据沉降系数)真核生物:5srRNA28srRNA5.8srRNA18srRNA原核生物:5srRNA23srRNA16srRNA
核蛋白体的组成:真核生物与原核生物比较:下表列出相关数据。
| 组成 | 真核生物(以小鼠肝为例) | 原核生物(以大肠杆菌为例) |
|---|---|---|
| 小亚基沉降系数 | 40S | 30S |
| 小亚基 rRNA | 18S(1874个核苷酸) | 16S(1542个核苷酸) |
| 小亚基蛋白质 | 33种,占总重量的50% | 21种,占总重量的40% |
| 大亚基沉降系数 | 60S | 50S |
| 大亚基 rRNA | 28S(4718个核苷酸)、5.8S(160个核苷酸)、5S(120个核苷酸) | 23S(2940个核苷酸)、5S(120个核苷酸) |
| 大亚基蛋白质 | 49种,占总重量的35% | 31种,占总重量的30% |
原文各项数值与名称交错排列,表格按教材标准结构还原,建议对照原课件图片核对。
的种类核内小
snmRNAs的种类核内小RNA核仁小RNA胞质小RNA催化性小RNA小片段干涉RNAsnmRNAs的功能参与hnRNA和rRNA的加工和转运。
RNA组学研究细胞中snmRNAs的种类、结构和功能。同一生物体内不同种类的细胞、同一细胞在不同时间、不同状态下snmRNAs的表达具有时间和空间特异性。RNA组学
种氨基酸组成单位的种类磷酸二酯键肽键连接
核酸和蛋白质的比较核酸蛋白质核苷酸氨基酸组成单位ACGTACGU20种氨基酸组成单位的种类磷酸二酯键肽键连接方式碱基序列氨基酸排列顺序一级结构双螺旋、超螺旋、蛋白质二、三、四级结构空间结构-核酸的非共价结合等遗传信息的储存、传代、生命活动中各种功能的功能表达、决定蛋白质的结构直接执行者
糖苷键磷酸酯键核酸
核糖核酸(RNA)脱氧核糖核酸(DNA)(dNMP)核苷(NR)(NdR)磷酸戊糖(RdR)碱基(AGCTU)核酸的组成60C-N糖苷键磷酸酯键核酸(NA)3’,5’磷酸二酯键核苷酸(NMP)
两类核酸的基本化学组成比较DNARNA嘌呤碱嘧啶碱腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(C)胸腺嘧啶(T)腺嘌呤(A)鸟嘌呤(G)胞嘧啶(C)尿嘧啶(U)戊糖D-2-脱氧核糖D-核糖 酸dAMP、dGMPdCMP、dTMPAMP、GMPCMP、UMP组成单位碱基
DNA的空间结构:二级结构-双螺旋模式三级结构-超螺旋、核小体RNA的结构:mRNA–5’帽子结构,3’polyA尾(真核)tRNA–稀有碱基;三叶草形;倒L形rRNA–按照分子量大小分cf:原核生物and真核生物
核酸的理化性质ThePhysicalandChemicalCharactersofNucleicAcid第四节
为两性大分子
DNA的酸碱及溶解度性质–DNA有磷酸基及碱基,为两性大分子,但偏于酸性。–可与金属离子成盐,不溶于乙醇或异丙醇 DNA的高分子性质–粘度:DNA>RNA DNA的紫外吸收dsDNA>ssDNAOD260nm单核苷酸>ssDNA>dsDNA一、一般理化性质
度法检测核酸的纯度方法
紫外分 度法检测核酸的纯度方法:通过测定波长在260nm和280nm处吸光度的比值(A260/A280)来估计核酸样品的纯度DNA溶液:A260/A280=1.8RNA溶液:A260/A280=2.
那么原液中DNA的浓度是
紫外分 度法估计核酸的浓度在波长260nm紫外线下,吸光度为1时,相当于50μg/ml的双链DNA,40μg/ml的单链DNA或RNA,20μg/ml的单链寡核苷酸取5μl双链DNA样品,加水稀释至1ml。以1ml纯水作参照测定波长在260nm处的吸光度值(A260),假如测得稀释样品的A260值为0.500,那么原液中DNA的浓度是?μg/ml
在某些理化因素作用下
DNA变性的本质是双链间氢键的断裂
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当核苷酸摩尔数相同时
DNA的紫外吸收光谱例:变性引起紫外吸收值的改变3.增色效应:当核苷酸摩尔数相同时,OD260nm值有如下关系:单核苷酸>单链DNA>双链DNA。DNA变性时,双链解成单链,对紫外光的吸收增强,使溶液OD260nm增高的现象。
低Tm值低变性温度范围较宽
5.影响Tm值因素1)DNA中G≡C对的含量G≡C碱基对的比例越高,Tm值越高Tm=69.3+0.41(G≡C)%2)介质中的 低Tm值低变性温度范围较宽
这一现象称为复性
复性过程中的碱基配对
*复性过程中的碱基配对:
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不完全同源核酸单链分子杂交突环
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待测核酸可以是克隆的基因片段
2.核酸杂交的应用: 研究DNA分子中某一种基因的位置 确定两种核酸分子间的序列相似性 检测某些专一序列在待检样品中存在与否 是基因芯片技术的基础探针可以是DNA、cDNA、mRNA及RNA等。待测核酸可以是克隆的基因片段,聚合酶链反应(PCR)产物,也可以是基因组DNA或细胞总RNA等。
"'畸.一夕加热
双链DNA1 形成杂化双铸甘煤日员闷字关母`恤皂日Sg:“G5i1i-i襟心印汕“ww.w“lnJvest`lntech.com勤a双链DNA2DNA变性形成单链- l.,"' 畸.一夕加热 多态心三_-~`~了_ _~一~_—上一- 咕-~缓慢样温 双链DNADNA变性形成单镜形成带有标记物的杂化双链b-"',丁'—- _盯 —_谝一-加热.-_ .-=-夕辜、一王-r-l-子' 缓慢伴温加入标记单链DNA-—一~ DNA变性、复性与分子杂交
第五节核酸酶Nuclease
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核酸内切酶核酸外切酶
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负责清除多余的、结构和功能异常的核酸
生物体内的核酸酶负责细胞内外催化核酸的降解 参与DNA的合成与修复及RNA合成后的剪接等重要基因复制和基因表达过程 负责清除多余的、结构和功能异常的核酸,同时也可以清除侵入细胞的外源性核酸 在消化液中降解食物中的核酸以利吸收 体外重组DNA技术中的重要工具酶核酸酶的功能
包括一般性质、变性、复性和分子杂交
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