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本课件介绍植物分类学的基本概念与三项任务，对比人为分类系统与自然分类系统的差异，说明界门纲目科属种的分类等级与双名法命名规则，并延伸介绍细胞分类学、化学分类学、数量分类学与分子系统学等新方法。
植物分类概述
一、植物分类学的概念和任务植物分类学是植物学中主要研究整个植物界不同类群的起源、亲缘关系以及进化发展规律的一门科学，也就是把极其繁杂的各种各样植物进行鉴定、分群归类、命名并按系统排列起来，以便于认识、研究和利用的科学。
植物分类学的任务1.将植物分门别类，鉴别物种，确定其学名并加以记述；2.研究种间的亲缘关系；3.建立能反映客观实际的植物分类系统。
二、植物的分门别类请对以下植物进行分类：白兰、含笑、菠萝蜜、苹果、玫瑰、榕、无花果、葡萄、牵牛、黄瓜
人为分类系统（Artificial system）仅就植物形态、习性、用途上的不同进行分类，往往用一个或少数几个性状作为分类依据，而不考虑植物彼此间在演化上的亲疏关系。
李时珍所编《本草纲目》将所收集的一千多种植物分成草、谷、菜、果和木等五部,包括山草、芳草等三十类；
自然分类系统（Natural system）利用现代自然科学的先进手段，从比较形态学、比较解剖学、古生物学、植物生态学、植物化学、细胞学和分子生物学等不同的角度进行研究，所建立的能够反映出植物界自然演化过程和彼此间亲缘关系的分类系统。
木兰科：白兰、含笑
植物分类的单位（等级）界（Kingdom）门（Division）纲（Class）目（Order）科（Family）属（Genus）种（Species）
种是生物分类的基本单位。它是具有一定的自然分布区和一定的生理、形态特征的生物类群。同一种中的各个体具有相同的遗传性状，彼此杂交可以产生后代，但与另一个种的个体杂交，一般不能产生后代。种是生物进化与自然选择的产物。
蓝藻门裸藻门绿藻门轮藻门金藻门甲藻门红藻门褐藻门细菌门粘菌门真菌门地衣门苔藓植物门蕨类植物门裸子植物门被子植物门植物界的分门蓝藻门裸藻门绿藻门轮藻门金藻门甲藻门红藻门褐藻门细菌门粘菌门真菌门地衣门苔藓植物门蕨类植物门裸子植物门被子植物门藻类植物菌类植物维管植物低等植物（无胚植物）高等植物（有胚植物）颈卵器植物孢子植物（隐花植物）种子植物（显花植物）蓝藻门裸藻门绿藻门轮藻门金藻门甲藻门红藻门褐藻门细菌门粘菌门真菌门地衣门苔藓植物门蕨类植物门裸子植物门被子植物门蓝藻门裸藻门绿藻门轮藻门金藻门甲藻门红藻门褐藻门细菌门粘菌门真菌门地衣门苔藓植物门蕨类植物门裸子植物门被子植物门蓝藻门裸藻门绿藻门轮藻门金藻门甲藻门红藻门褐藻门细菌门粘菌门真菌门地衣门苔藓植物门蕨类植物门裸子植物门被子植物门
三、植物的命名
植物的科学名称——学名
林奈(1707~1778)
每一种植物的种名，都由2个拉丁字或拉丁化形式的字构成；前面1个字为属名，代表该植物所从属的分类单位，词首字母大写；第2个字为种加词（specificepithet），词首字母小写；均用斜体。例：人参Panaxginseng
一个完整的学名，除属名和种加词之外，在最后还应加上命名人姓名的缩写。例：人参PanaxginsengC.A.Mey杏PrunusarmenicaL.
种以下单位
归并益母草LeonurusjaponicusHoutt.L.artemisia(Lour.)S.Y.HuL.heterophyllusSweet.
四、植物分类学进展
细胞分类学通过研究染色体各个方面的资料来研究生物的变异规律，以探讨各种生物之间的关系和起源。细胞学资料包括染色体的数目、染色体的形态和组型分析。应用范例：芍药属系统地位的确定
化学分类学利用化学的特征，研究植物体变异的规律，提示物种在分子水平止所反映出来的特有现象，从而探索各种植物之间的关系和起源。在分类学中的应用的植物化学特征有：l.直接可见到的物质，包括淀粉粒和针晶体(raphides)。2．植物本身的产物，即植物碱、黄酮类和萜烯类等。3．蛋白质的血清鉴定和电泳。应用范例：人参属的化学分类
数量分类学数量分类学用数量的方法来评价有机体类群间的相似性，并根据相似性值把某些类群归成更高阶层的分类群(Taxa)。它以表型特征为基础，利用有机体大量性状(包括形态学的、细胞学的和生物化学等的各种性状)、数据，按一定的数学模型(Model)，应用电子计算机运算得出的结果，从而作出有机体的定量比较。它不仅运用的性状数量多，运算速度快，而且没有偏见，比较客观，这是以往分类学家难以做到的。经过这种处理所得到的分类群之间的关系，不是凭经验的判断，而是凭大量的性状并可验证的，因为这个关系是用一定的精确标准计算得来的。由其派生出分支分类学等。
分子系统学随着分子生物学的发展，分子证据，主要是一些基因序列，逐渐应用于分类学研究。在属、种级水平，常用的序列是核核糖体DNA(nrDNA)的转录间隔区（InternalTranscribedSpacer,ITS）。它可示意为18srDNA–ITS1–5.8srDNA–ITS2–28srDNA。此结构在植物核基因组中是高度重复的，千万个拷贝以串联重复方式出现在一个或多个染色体基因位点上，有利于发现、扩增、克隆和测序。这些重复单位经历一致进化，可对nrDNAPCR产物直接测序，不同居群样本的序列也基本一致。ITS区序列短，具有长度保守性（ITS1:187~298bp，ITS2:187~252bp）和核苷酸序列的高度变异性（每个区成对序列趋异百分率在4~10%），而且在两个间隔区的两侧都有高度保守的序列存在，使得这一区段即使是对标本材料也易被扩增并测序。由于ITS有利的特性，使得它被植物学家广泛应用于属及以下分类阶元的系统发育研究，结果显示同属不同种间的ITS序列有显著差异。另外，matK、trnL等基因也有应用。
五、学习植物分类学的目的六、学习植物分类学的方法
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