页数:95页文件大小:13.20 MB来源: 生物化学ppt课件
本课件系统讲解蛋白质的生物学意义与元素组成,展开氨基酸的结构、分类与两性解离、等电点等理化性质,介绍氨基酸的分离纯化与重要化学反应。
蛋白质化学是本课件的开篇章,以下按页展开本章的主要内容。
第一章蛋白质化学蛋白质(protein)是由许多不同的α-氨基酸按一定的序列通过酰胺键(蛋白质化学中专称为肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象并具有一定生物功能的生物大分子Protein
蛋白质的生物学意义 催化最重要的功能是作为生物体新陈代谢的催化剂——酶萤火虫的荧光素酶消耗ATP催化底物发光
蛋白质的元素组成:下表列出主要元素在蛋白质中的含量范围。
| 元素 | 含量(占蛋白质干重 %) |
|---|---|
| C | 50~55 |
| H | 6~8 |
| O | 20~23 |
| N | 15~18 |
| S | 0~4 |
说明:部分蛋白质还含微量的 P、Fe、Zn、Cu、Mo、I 等元素;氮含量在各种蛋白质中比较接近,平均为 16%,1 g 氮相当于 6.25 g 蛋白质(蛋白质系数)。
蛋白质平均含N量为16%,这是凯氏定氮法测定蛋白质含量的理论依据:蛋白质含量=蛋白质含N量×6.25
蛋白质的氨基酸组成 蛋白质的水解完全水解得到各种氨基酸的混合物,部分水解通常得到多肽片段。
1.酸水解方法:常用6 mol/L HCl或4 mol/L H2SO4,回流煮沸约20 h。
优点:不引起消旋作用,得到的是L-氨基酸。
缺点:色氨酸被沸酸完全破坏;含有羟基的氨基酸(丝氨酸、苏氨酸)有一小部分被分解;天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基被水解成羧基。
3.酶水解方法:用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶(或称蛋白酶, proteinase)已有十多种,常用的有胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶(或称糜蛋白酶)及胃蛋白酶等。
优点:不产生消旋作用,也不破坏氨基酸。
缺点:使用一种酶往往水解不彻底,需几种酶协同作用才能使蛋白质完全水解。该法主要用于部分水解。
二、氨基酸(amino acid)的结构通式除脯氨酸(亚氨基酸)外,其他19种均具有如下结构通式:不变部分侧链,可变部分——蛋白质是由20种基本氨基酸组成的
除脯氨酸外,均为α-氨基酸除甘氨酸外,均为手性氨基酸
氨基酸的旋光性
2. 氨基酸的构型-都有D-型和L-型2 种立体异构体L-丙氨酸D-丙氨酸L-(-)甘油醛D-(+)甘油醛
L-丙氨酸D-丙氨酸
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三、氨基酸的分类
(本页以图示为主,源文件提取到的文字较少,建议对照原图说明)
按R基的化学结构分类可分为三类:脂肪族、芳香族和杂环族
酸性氨基酸(一氨基二羧基)及其酰胺天冬氨酸(Asp, D)谷氨酸(Glu, E)天冬酰胺(Asn, N)谷氨酰胺(Gln, Q)
碱性氨基酸(二氨基一羧基)赖氨酸(Lys, K)精氨酸(Arg, R)组氨酸(His, H)杂环
2、芳香族氨基酸苯丙氨酸(Phe,F)酪氨酸(Tyr,Y)色氨酸(Trp,W)
3、杂环氨基酸组氨酸(His, H)脯氨酸(Pro, P)
说明:关于杂环氨基酸和杂环亚氨基酸色氨酸(Trg,W)组氨酸(His, H)脯氨酸(Pro, P)芳香族氨基酸杂环亚氨基酸杂环氨基酸
按R基的极性性质分类20种基本氨基酸可分成以下4组:
3个有个性的氨基酸
半胱氨酸(Cys) 它的个性不仅表现在其侧链有一定的大小和具有高度的化学反应活性,还在于两个Cys 能形成稳定的带有二硫(桥)键的胱氨酸。
二硫键不仅可以在肽链内,也可以在肽链间存在。
更有甚者,同样的一对二硫键能具有不同的空间取向。
二十种常见蛋白质氨基酸的分类、结构及三字符号据营养学分类必需AA非必需AA据R基团化学结构分类脂肪族AA芳香族AA(Phe、Tyr、Trp)杂环AA(His、Pro、Trp)据R基团极性分类极性R基团AA非极性R基团AA(8种)不带电荷(7种)带电荷带正电荷(3种)带负电荷(2种)据氨基、羧基数分类一氨基一羧基AA一氨基二羧基AA(Glu、Asp)二氨基一羧基AA(Lys、His、Arg)人体必需氨基酸LysTrpPheValMetLeuIleThr
N-甲基赖氨酸存在于肌球蛋白中。
γ-羧基谷氨酸存在于凝血酶原中;
羟脯氨酸存在于胶原蛋白中;
β -丙氨酸是遍多酸(泛酸,一种维生素)的前体成分γ –氨基丁酸是传递神经冲动的化学介质
L-鸟氨酸、L-瓜氨酸是尿素循环的中间体鸟氨酸胍氨酸
氨基酸的重要理化性质和功能 氨基酸的性质(一)一般物理性质α-氨基酸为无色晶体,熔点极高(一般在200℃以上)。
有的无味、有的味甜、有的味苦、谷氨酸的单钠盐有鲜味(味精的主要成分)。
氨基酸在水中的溶解度差别很大, 除胱氨酸、半胱氨酸和酪氨酸外, 一般都能溶于水, 并能溶解于稀酸或稀碱中, 但不能溶解于有机溶剂( 通常酒精能把氨基酸从其溶液中沉淀析出)。
脯氨酸和羟脯氨酸能溶于乙醇或乙醚中, 且二者极易溶于水而潮解。
(二)氨基酸的手性20种标准氨基酸中,除Gly以外的19种氨基酸都有手性。
(三)氨基酸的光吸收性质20种标准氨基酸在可见光区都无光吸收,但在红外区和远紫外区( <220nm )均有光吸收。
在近紫外区(220~300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力,因为它们含有苯环共轭π键系统。
芳香族氨基酸的紫外吸收:下表列出三种芳香族氨基酸的最大吸收波长与摩尔消光系数。
| 氨基酸 | λmax(nm) | ε(mol-1·L·cm-1) |
|---|---|---|
| Phe(苯丙氨酸) | 257 | 2.0×102 |
| Tyr(酪氨酸) | 275 | 1.4×103 |
| Trp(色氨酸) | 280 | 5.6×103 |
说明:蛋白质因含 Tyr、Phe、Trp 也具有紫外吸收能力,一般最大吸收在 280 nm 波长处。
分光光度计定量分析依据Lambert-Beer定律:A=Log 1/T=Log Io/I =εC L入射光强度Io透射光强度I样品池(溶液浓度mol / L)检测器单色器光源
( 氨基酸等电点的计算可见,氨基酸的pI值等于该氨基酸的两性离子两侧的基团pK′值之和的二分之一。
pI =2pK´1 + pK´2一氨基一羧基AA的等电点计算:pI =2pK´2 + pK´3二氨基一羧基AA的等电点计算:pI =2pK´1 + pK´2一氨基二羧基AA的等电点计算:
一氨基一羧基AA的等电点计算,以丙氨酸为例:
一氨基二羧基氨基酸等电点的计算, 以Asp为例:
二氨基一羧氨基酸的等电点的计算,以Lys为例:
氨基酸侧链的疏水度:下表列出 20 种氨基酸侧链的疏水度数值。
| 氨基酸 | 侧链疏水度 | 氨基酸 | 侧链疏水度 |
|---|---|---|---|
| Ile | 4.5 | Ser | -0.8 |
| Val | 4.2 | Trp | -0.9 |
| Leu | 3.8 | Tyr | -1.3 |
| Phe | 2.8 | His | -3.2 |
| Cys | 2.5 | Glu | -3.5 |
| Met | 1.9 | Gln | -3.5 |
| Ala | 1.8 | Asp | -3.5 |
| Pro | 1.6 | Asn | -3.5 |
| Gly | -0.4 | Lys | -3.9 |
| Thr | -0.7 | Arg | -4.5 |
说明:侧链疏水度直接影响蛋白质折叠,是水溶液中驱动蛋白质分子折叠的动力之一。
②与甲醛的反应用NaOH滴定★氨基酸甲醛滴定法(概念) 判断蛋白质水解或合成的进度
③与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应——烃基化反应2,4-二硝基苯氨基酸,黄色(DNP-氨基酸,可用乙酸乙酯或乙醚抽提)
多肽或蛋白质N端氨基酸的α-氨基也能与DNFB反应,生成DNP-多肽或DNP-蛋白质。
后者用酸水解时,所有肽键被打开,可得到黄色的DNP-氨基酸。
该反应由F. Sanger(英)首先发现,并用于鉴定多肽或蛋白质的N-端氨基酸,阐明了胰岛素的一级结构。(故DNFB亦称作Sanger试剂)——蛋白质N端氨基酸测定的方法之一
5-二甲氨基萘磺酰氯( 简称丹磺酰氯或DNS-Cl)代替DNFB试剂5-二甲氨基萘磺酰氨基酸有强烈的荧光,可用荧光光度计快速检出,灵敏度高。
酰化试剂
苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-氨基酸,无色)苯硫乙内酰脲氨基酸(PTH-氨基酸,无色,可用乙酸乙酯抽提)④与异硫氰酸苯酯( PITC) 的反应-烃基化反应
( α-羧基参加的反应①成盐和成酯反应该反应使氨基酸的氨基被活化氨基酸与碱作用即生成盐。
氨基酸的羧基被醇酯化,形成相应的酯。
②脱羧基反应③蛋白质合成的氨基酸活化反应
( α-氨基和α-羧基参加的反应①与茚三酮的反应茚三酮水合茚三酮
+3H20水合茚三酮(无色)NH3CO2RCHO+还原型茚三酮(弱酸)加热水合茚三酮+ NH3 +还原型茚三酮蓝紫色化合物λmax= 570nm
脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应产生黄色物质,其余所有的α-氨基酸与茚三酮反应均产生蓝紫色物质。
加热黄色,λmax= 440nm
②成肽反应——缩合反应——这是多肽和蛋白质生物合成的基本反应
( 侧链R基参加的主要反应①Cys巯基(-SH)参加的反应——性质很活泼A.很容易被氧化形成二硫键(-S-S-)作用:氧化还原反应可使蛋白质分子中二硫键形成或断裂。
B.与过甲酸、碘代乙酸的反应
②Pauly反应——可用于检测TyrTyr的酚基可以与重氮化合物,如重氮苯磺酸,结合生成橘黄色化合物——Pauly反应橘黄色
③His的咪唑基与重氮盐(重氮苯磺酸)的反应棕红色附:咪唑基的性质组氨酸含有咪唑基,其pK2值为6.0,在生理条件下具有缓冲作用。
组氨酸中的咪唑基能够发生多种化学反应。
可以与ATP发生磷酰化反应,形成磷酸组氨酸,从而使酶活化。组氨酸的咪唑基也能发生烷基化反应。生成烷基咪唑衍生物,并引起酶活性的降低或丧失。
R基团对蛋白质功能的贡献(
氨基酸的功能
氨基酸的分离与纯化技术 电泳举例:Glu、Leu 、His 、Lys 4种氨基酸的混合样品,在pH6.0时,泳动方向及相对速度。
Glu Leu His LyspI 3.22 5.98 7.59 9.74
二、层析层析即色层分析又称色谱(chromatograph)固定相(stationary phase)流动相(mobile phase)1891年Nerst提出分配定律,即:当一种溶质在两种互不相溶的溶剂中分配时,在一定温度下达到平衡后,溶质在两相中的浓度比为一常数称为分配系数(Kd)。
根据层析的分离原理分类:吸附层析法分配层析法离子交换层析法凝胶层析法(排阻层析法)亲和层析法疏水层析法
根据层析的操作方式分类:柱层析法薄层层析法纸层析法薄膜层析法高效液相层析法(HPLC)
1、柱层析——分配层析可以同检测器、记录仪、馏分收集器、输液泵构成层析系统。
2、薄层层析——吸附层析分辨率高、所需样品量微、层析速度快薄层层析介质——纤维素粉、硅胶和氧化铝粉盖子层析缸层析板溶剂
3、纸层析——分配层析Rf主要与R基的极性有关,溶剂的pH可影响R基的极性,氨基酸与滤纸的吸附作用也影响Rf。
纸层析中的Rf值Rf=XY溶剂前沿氨基酸显色点滤纸原点
4、离子交换层析——一种用离子交换树脂作支持剂的层析方法
氨基酸的离子交换分离原理若pI>pH ,两性离子带净正电荷,若pI< pH ,两性离子带净负电荷。
差值越大,所带的净电荷越多。
用氨基酸自动分析仪分析氨基酸混合物的洗脱曲线(阳离子交换剂)。
洗脱的先后顺序取决于氨基酸的所带电荷与离子交换树脂的静电吸引和疏水相互作用两者的综合作用的结果。
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