页数:79页文件大小:1.20 MB来源: 生物化学ppt课件
本课件讲述核酸的生物合成,先说明中心法则与复制、转录、翻译的概念,展开DNA的半保留复制、半不连续复制、原核与真核复制过程及所需的酶与蛋白因子,介绍逆转录、DNA突变与损伤修复,随后讲解RNA转录的机理、RNA聚合酶与转录后加工,并简介基因工程。
第九章 核酸的生物合成 目录:第九章核酸的生物合成第一节DNA的生物合成第二节RNA的生物合成第三节基因工程简介
遗传信息的贮存与传递:第九章核酸的生物合成生物的遗传信息以密码的形式贮存在DNA分子上,表现为特定的核苷酸排列顺序。在细胞分裂过程中,通过DNA复制把亲代细胞的遗传信息传递给两个子代细胞。在子代细胞的生长发育过程中,这些遗传信息通过转录传递给RNA,再由RNA通过翻译转变为相应的蛋白质多肽链上的氨基酸顺序,由蛋白质执行各种各样的生物学功能,使后代表现出与亲代极为相似的遗传特征。
中心法则:1958年,F·Crick提出的“中心法则”( 复制DNA转录逆转录RNA翻译蛋白质复制
复制的概念:复制( :以DNA双链为模板,按照碱基配对原则,合成出与亲代DNA分子相同的两个双链DNA分子的过程。转录( :以DNA为模板,按照碱基配对原则,合成出一条与模板DNA链互补的RNA分子的过程。逆转录( :以mRNA为模板,在逆转录酶的作用下合成DNA的过程。
转录与翻译的概念:翻译( :以mRNA为模板,合成出具有特定AA顺序的Pr肽链的过程。中心法则( :说明DNA、RNA和蛋白质之间信息传递关系的法则。即:DNARNAPr遗传信息:决定生物结构、性状和代谢类型的特殊的生物指令。
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半保留复制:(二)DNA复制的基本规律1、半保留复制 半保留复制:DNA复制过程中,新形成的DNA分子的一条链来自亲代DNA,另一条链是新合成的,这种复制方式叫做半保留复制。生物学意义:使生物的遗传特性保持了相对稳定性。1958年,M·Meselson和F·W·Stahl利用同位素N15标记大肠杆菌DNA,证明了半保留复制。
复制的多模式:2、复制的多模式在特定的部位开始,双向或单向进行原核生物(细菌、病毒):一个起点;双向为主,也有单向(某些质粒、病毒)真核生物:多个起点;双向为主,也有单向(细胞器DNA)
复制起点与复制叉:单起点、单方向多起点、单方向单起点、双方向多起点、双方向复制叉(
复制需RNA引物与延伸方向:3、复制需RNA为引物4、子链DNA延伸方向:5’3’进行核糖的3’-OH能与其它核苷酸的磷酸以3’,5’-磷酸二酯键相连
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半不连续复制与冈崎片段:3’3’5’前导链冈崎片段5’滞后链冈崎片段原核生物:1000-2000核苷酸真核生物:100-200核苷酸5、半不连续复制 ’3’
前导链与滞后链:前导链( ):以3’5’的亲代链为模板,子代链能连续合成,称~。滞后链( ):以5’3’的亲代链为模板,子代链不能连续合成,称~
冈崎片段的发现:冈崎片段( :1968年日本人冈崎发现以5’3’的亲代链为模板合成新链时,先形成一些1000核苷酸左右的DNA短片段,然后由连接E连接成完整的子链。这些在复制过程中形成的DNA片段称为冈崎片段。半不连续复制:新生的DNA双链,一条链按5’则按5’3’的方向连续合成,另一条3’的方向不连续合成。
引物酶:(三)DNA复制中所需的酶和辅因子1、引物酶(Primase)功能:以DNA为模板,以NTP为原料,合成一小段RNA,作为合成DNA的引物(Primer)。所有的DNA聚合酶都只有按模板链的指令,在引物3’-OH端延伸新链的功能,没有从头合成的活性。引物E与有关蛋白质结合成引发体(primosome)
大肠杆菌的DNA聚合酶:2、DNA聚合酶大肠杆菌DNA聚合酶有三种:(1)DNA聚合酶Ⅰ主要功能:是负责DNA的损伤修复及在DNA复制中,切除引物,填补空隙的作用。若用枯草菌蛋白酶处理此酶,可得两个片段:
Klenow片段:A、分子量为76kD,有5’—3’聚合酶和3’—5’外切酶活性,称Klenow片段。5’—3’聚合酶活性催化DNA链沿5’-3’方向延长,单个核苷酸加到3’-未端上形成3’,5’磷酸二酯键。3’—5’外切E活性能及时切除错配核苷酸(发生错配时,此酶活性提高),与5’—3’聚合酶活性共同保证DNA复制过程中的高保真度。
DNA聚合酶Ⅰ的小片段:B、分子量34KD,5’—3’外切酶活性作用于双链DNA的碱基配对部分,从5’端切下单核苷酸或寡聚核苷酸。在DNA损伤修复和切除RNA引物中发挥作用。
DNA聚合酶Ⅱ和Ⅲ:(2)DNA聚合酶Ⅱ和ⅢDNA聚合酶Ⅱ:主要负责DNA的损伤修复具有5’—3’聚合活力3’—5’外切活力DNA聚合酶Ⅲ:是催化大肠杆菌DNA复制的主要酶。具有5’—3’聚合活力3’—5’外切活力5’—3’外切活力
三种DNA聚合酶的比较:下表列出相关内容。
| 比较项目 | DNA聚合酶Ⅰ | DNA聚合酶Ⅱ | DNA聚合酶Ⅲ |
|---|---|---|---|
| 分子结构 | 单链分子 | 单链分子 | 复合物 |
| 相对活性 | 1 | 0.05 | 50 |
| 5′—3′聚合作用 | + | + | + |
| 3′—5′核酸外切酶 | + | + | + |
| 5′—3′核酸外切酶 | + | — | + |
源文件表格中相对活性写作「500·051」,上表按课件顺序读作Ⅲ=50、Ⅱ=0.05、Ⅰ=1;5′—3′核酸外切酶一行源文本写作「+—+」,建议对照原图核对。
真核细胞的DNA聚合酶:真核细胞的DNA聚合E在真核细胞内已发现四种DNA聚合E:αβγδ。聚合酶α和δ:复制染色体DNA。聚合酶α催化滞后链的合成;而聚合酶δ催化领头链的合成,它还具有3’-5’外切酶活性。聚合酶β:主要是修复作用聚合酶γ:从线粒体中分离得到,可能与线粒体DNA的复制有关。
DNA连接酶
单链结合蛋白
拓扑异构酶Ⅰ型:Ⅰ型E:使双链DNA分子中的一条链发生断裂和再连接,减少负超螺旋,反应不需供能,主要集中在活性转录区,同转录有关。Ⅱ型E(也称旋转E,grase):兼有内切E和连接E的活力,能使DNA双链同时发生断裂和再连接。可连续引入负超螺旋(需ATP供能),同复制有关。
拓扑异构酶Ⅱ型:5’3’5’3’3’3’DNA旋转E(拓扑异构EⅡ)解螺旋E(如rep蛋白)引发体SSBDNA聚合EⅢDNA连接EDNA聚合EⅠ
复制体系中各组分示意:(四)原核生物DNA的复制过程(以大肠杆菌为例)1、DNA复制的起始起始位点的识别RNA引物合成DNA解链
DNA复制的起始:3’5’5’3’单起点,双方向等速进行大肠杆菌染色体的复制从一个特定位点(oriC)开始,在另一特定位点(ter)终止。能独立进行复制的单位称复制子(replicon)。原核生物是一个复制子,真核生物是多个复制子。
复制子与终止位点:dnaB蛋白识别起始位点,ATP供能、组装引发体,与模板起始部位结合。解链酶rep蛋白与旋转酶共同作用,使双链局部解开,暴露出起始位点,单链结合蛋白(SSB)与DNA结合防止H键的形成,此时在电镜下观察犹如”眼睛”称为”复制眼”,继续解链形成复制叉。在引物酶(DnaG)催化下合成一小段RNA,5’-3P,3’-OH。
引发体的组装:2、DNA链的合成与延长①先导链的延伸:DNA聚合酶Ⅲ按照3’-5’模板链上的碱基顺序,在引物3’-OH末端按5’-3’方向催化互补的dNTP发生聚合作用,连续合成。
先导链的延伸:②DNA不连续链的合成冈崎片段的形成切除RNA引物填补缺口连接相邻的DNA片段随后链(滞后链),以DNA5’→3’链为模板,分段合成冈崎片段,后由DNA聚合酶I从5’→3’切除引物,填补空缺,由连接酶连接相邻的DNA片段,合成随后链。
滞后链与冈崎片段的合成:3、链的终止新链与各自的模板链组成双螺旋。DNA链合成的终止不需要特定的信号(进入ter位点终止复制)。随后链合成以后,新链与各自的DNA模板组成两个双股螺旋分子。综上所述,大肠杆菌的DNA复制是包括DNA聚合酶在内的几十种酶和蛋白质因子的精确配合下完成的,定点起始,两个复制叉双向等速前进,进行半保留、半不连续的复制。
DNA复制的终止与真核原核比较:下表列出相关内容。
| 比较项目 | 真核细胞 | 原核细胞 |
|---|---|---|
| 复制子数 | 大于1000个 | 1个 |
| 复制模式 | 多起点、双方向 | 单起点、双方向 |
| DNA聚合酶 | α、β、γ、δ | Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ |
| 冈崎片段长度 | 100~200核苷酸 | 1000~2000核苷酸 |
真核生物的DNA复制:二、逆转录( 以RNA为模板合成DNA的过程称逆转录,由RNA指导的DNA聚合酶(逆转录E)催化。逆转录E广泛存在于致癌RNA病毒中,也存在于正常动物的胚胎细胞中。
逆转录:1、机理tRNA为引物病毒RNA为模板逆转录EdNTP(4种)cDNAcDNA:在逆转录过程中由逆转录E合成的一条与mRNA模板互补的单链DNA。
逆转录的机理:2、逆转录E(多功能E)1依赖RNA的DNA聚合E活性(E1)以RNA为模板,合成DNA,形成RNA-DNA杂交分子。2具有核糖核酸EH活性(E2)专门水解RNA-DNA杂交分子中RNA3依赖DNA的DNA聚合E活性(E3)以新合成的DNA链为模板,合成互补的DNA链,形成DNA双螺旋。
逆转录酶的多功能活性:3、逆转录过程双链DNA(前病毒)病毒mRNAE1RNA- 连接E整合到宿主染色体
逆转录的过程:三、DNA突变DNA突变(基因突变):指DNA的碱基顺序发生稳定而突然的变化,导致DNA的复制及以后的转录和翻译随之发生变化,表现出异常的遗传特性。DNA突变分自发突变和诱发突变。DNA复制的保真度很高,但仍有10-9-10-10的误差率。电离辐射、紫外线照射、烷化剂、脱氨剂等诱发DNA的突变。
DNA突变:突变的形式:(1)置换:一个or几个碱基的置换(可逆)a、转换:G与A,C与T互变;b、颠换:嘌呤与嘧啶互变。(2)插入:插入一个or几个碱基(可逆)导致遗传密码解读框架的改变,从突变点以后的密码都可能发生错误,称移码突变 。如:溴化乙锭(3)缺失:缺失一个or几个碱基对(不可逆)
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缺失与插入:四、DNA的损伤修复DNA的损伤往往造成死亡。生物体有一套修复机制,能够修复一定程度的DNA损伤,但仍有可能发生突变。紫外线照射,常常引起相邻的两个碱基之间形成共价键生成二聚体,如:T·T、T·C等。二聚体的形成阻碍了DNA聚合酶的作用,因而复制不能继续进行。
DNA的损伤修复:(一)光复活( 细菌在受紫外照射损伤后,如果用强的可见光(最有效是400nm)照射,则大部分损伤的细胞可以修复,这个过程称为光复活作用。机制:光激活了光裂合酶,切除二聚体之间的C-C键而恢复原来状态。这是一种高度专一的修复形式,对单细胞生物较重要。
光复活:(二)切除修复(暗修复, 涉及各类生物5’3’3’5’切开核酸内切E切除核酸外切E修复DNA聚合EⅠ连接DNA连接E复制前修复
切除修复:(三)重组修复( 复制修复合成DNA聚合EDNA连接E重组交换核酸E重组蛋白复制后修复
重组修复:(四)SOS修复(又称紧急修复)( 当细胞DNA受到损伤或复制系统受到抑制的紧急情况下,诱导产生和增加切除修复和重组修复的某些关键E和蛋白质,从而加强其修复能力;同时还诱导产生缺乏校对功能的DNA聚合E,随机聚合核苷酸,从而避免死亡,但却带来高突变率的修复过程。
SOS修复:第二节RNA的生物合成一、转录(一)合成机理在DNA指导下的RNA合成称为转录。转录从DNA模板的一个特定位点开始,到另一位点终止。此转录区域称为转录单位,一个转录单位可以是一个基因,也可以是多个基因。DNA的启动子控制转录的起始,而终止子控制转录的终止。
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转录的反应式:不对称转录:在转录过程中,DNA双链中只有一条链作为模板指导RNA的合成,这种转录方式称~在转录过程中指导RNA合成的DNA链,称模板链,又称无意义链、负链。在转录过程中与模板链对应的DNA链,称编码链,又称有意义链、正链。
不对称转录:正链的核苷酸序列与转录出的RNA序列一致,通常用正链DNA的碱基顺序表示基因的一级结构,转录起点(与RNA产物的第一个残基相对应)标为+1,其上游(5’)残基标为-1。
转录起点与正链序列:(二)RNA聚合E1、原核生物RNA聚合E(α2ββ’σ)α2ββ’б=α2ββ’+σ+2Zn全酶核心酶起始因子α:参与全酶滑动,决定哪些基因转录β:参与转录全过程,催化核苷酸形成3’,5’-磷酸二酯键,使RNA延长β’:与模板DNA结合б:识别转录起始位点
原核生物的RNA聚合酶:原核生物只有一种RNA聚合E,其转录产物包括mRNA、rRNA前体和tRNA前体。2、真核生物RNA聚合E由多个亚基(8-14)组成的含Zn2+寡聚E,分别转录不同RNA。
真核生物的RNA聚合酶:对α-鹅膏蕈碱的敏感性合成的RNA分布酶不敏感rRNA前体核仁RNApolⅠ低浓度敏感mRNA前体核质RNApolⅡ高浓度敏感tRNA和5SrRNA前体核质RNApolⅢ
真核RNA聚合酶的种类:下表列出相关内容。
| 酶 | 合成的RNA | 分布 | 对α-鹅膏蕈碱的敏感性 |
|---|---|---|---|
| RNA聚合酶Ⅰ | rRNA前体 | 核仁 | 不敏感 |
| RNA聚合酶Ⅱ | mRNA前体 | 核质 | 低浓度敏感 |
| RNA聚合酶Ⅲ | tRNA和5S rRNA前体 | 核质 | 高浓度敏感 |
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原核生物的启动子:2、原核生物转录终止有两种类型:1不依赖ρ因子的终止:终止子中有一段富含GC的反向重复,以及紧密相连的ATbp,导致转录生成的RNA形成发夹样结构,使转录终止。2依赖ρ因子的终止:模板终止信号区域中GC及随后的AT碱基较少,当RNApol滑行至此处时,ρ因子进入终止区域,使RNA链延伸终止。
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ρ因子:(四)RNA的转录过程(以大肠杆菌为例)1、转录的起始:RNA聚合E的б因子识别启动子全酶与模板结合,使DNA局部解链引入第一个NTP(ATP或GTP),启动RNA的合成。б因子脱落,核心酶滑动。2、转录的延伸:核心酶沿模板3’–5’滑动,根据模板指令选择相应的NTP加入,使RNA链沿5’–3’方向延伸。
转录的起始:3、转录的终止:核心酶沿模板3’–5’滑行至终止信号区域,转录便终止。
转录的终止:一个基因3’5’5’3’启动子终止子б因子识别启动子E、DNA、RNA复合物释放ρ因子、E、DNA、RNAб因子与核心E结合开始转录ATP或GTP释放出б因子ρ因子与DNA或E结合5’pppmRNA3’RNA链延长NTP
转录过程示意:(五)DNA复制与RNA转录的异同点RNA转录DNA复制NTPdNTP底物DNA的模板链DNA的两条链模板RNA聚合E包括DNA聚合E的十几种E酶5’-3’5’-3’延伸方向不对称转录半保留半不连续复制合成方式单链RNA双链DNA产物不需引物需RNA为引物引物
DNA复制与RNA转录的异同:下表列出相关内容。
| 比较项目 | RNA转录 | DNA复制 |
|---|---|---|
| 底物 | NTP | dNTP |
| 模板 | DNA的模板链 | DNA的两条链 |
| 酶 | RNA聚合酶 | DNA聚合酶等十几种酶 |
| 延伸方向 | 5′—3′ | 5′—3′ |
| 转录方式 | 不对称转录 | 半保留、半不连续复制 |
真核生物mRNA的转录后加工:成熟mRNAhnRNA(核不均一RNA)1)5’端接帽子m7G5’ppp5’Nmp2)3’端接polyA约200Nt3剪去内含子,拼接外显子4对链内特定核苷酸进行甲基化
mRNA前体的加工:hnRNA:真核生物转录的mRNA前体既有外显子也有内含子,其分子量大而不均一,称核不均一RNA。内含子:真核基因内部间隔外显子,并从mRNA上消失的DNA序列。外显子:真核基因中那些在mRNA上出现,能编码蛋白质的DNA序列。
hnRNA与内含子、外显子:数十种tRNA加工不同,大致如下:1)切除5’末端和3’末端部分核苷酸2在3’末端加上CCA-OH序列3核苷的修饰:甲基化2、tRNA前体的加工还原碱基转位DHUΨUUA脱氨次黄核苷酸
本页为tRNA与rRNA前体的加工的化学反应式或分子结构式图示,源文件仅提取到结构符号与少量文字,建议对照原课件图片查看本页的反应过程与结构变化。
基因工程简介:第三节基因工程简介
基因工程的思考题:1、名词解释基因工程PCR基因文库2、基因工程的基本步骤、理论意义及应用价值?
基因工程的概念:第三节基因工程简介一、基因工程的概念基因工程:即DNA重组技术,是指将不同的DNA片段按人们的设计方案定向地连接起来,并在特定的受体细胞中,与载体一起得到复制与表达,使受体细胞获得新的遗传特性。
基因工程的操作技术:二、基因工程的操作技术基因工程是分子水平上的操作,细胞水平上的表达,它的基本过程包括:(一)体外基因重组1、目的基因的制备插入到载体内的基因称为外源基因。用来改造,扩增或表达的基因称为目的基因。
目的基因的制备:分离我们所需要的基因常用的方法:1直接从细胞中分离出染色体,再用工具E切下所需的DNA片段。2mRNA逆转录法:利用逆转录E从所需蛋白质的mRNA合成互补DNA(cDNA)3化学合成法:按照设定的碱基序列用化学方法人工合成所需的基因。
聚合酶链式反应:聚合E链式反应(PCR, ):在适当寡核苷酸引物存在下,利用耐热DNA聚合E对目的DNA进行扩增的方法。
基因载体的性质:2、基因载体作为载体都必须具有下列性质:(1)自我复制;(2)分子量要小易于引入易于从宿主细胞中分离和纯化;(3)具有适当的限制性内切酶位点;(4)具有可供选择的遗传标志
目的基因与载体重组:3、目的基因与载体重组目的基因和载体DNA的重组是经限制性内切酶和DNA连接酶作用下,于体外连接成一个重组的DNA环状分子,然后再转入宿主细胞,提高了转化的效率。用限制性内切酶对载体和目的基因对两者进行切割,产生相同的粘性末端;在连接E的作用下连接成一个重组的DNA环状分子。
重组体的转化:(二)重组体DNA的转化、增殖和表达1、重组体的转化:重组体必须转入活细胞才能进行复制、转录和翻译。活细胞称受体细胞。一般CaCl2处理大肠肝菌,增大它的细胞膜透性,使重组体透入宿主细胞,随着宿主细胞的繁殖而复制,因而导致宿主细胞某些特性的改变。外源DNA进入受体细胞并使它获得新遗传特性的过程称转化;重组体如果是噬菌体DNA,它导入受体细胞引起的转化称转染。
重组体的筛选和鉴定:2、重组体的筛选和鉴定由于细胞转化频率很低,必须从大量的缩主细胞中筛选出带有目的基因的细胞,常用重组载体对抗生素的抗药性进行筛选。
基因工程的理论意义
基因工程的应用价值:2、应用价值农业上.A.抗虫; B.抗除草剂;C.棉医药上.A.治疗侏儒症(50具尸体脑下垂体提取生长激素)1-2ml培养液;B.不能制造血红蛋白,把基因”注入”骨髓细胞工业上。
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