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14 第十四章 蛋白质的生物合成.ppt

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本课件系统讲解蛋白质的生物合成,先介绍mRNA与遗传密码的特点、核糖体的组成与功能位点、tRNA的结构与转运氨基酸的功能,再详细展开肽链合成的起始、延伸与终止过程及参与的蛋白因子,最后比较真核与原核生物蛋白质合成的差异,并说明合成后的加工修饰与定向转运。

第十四章 蛋白质的生物合成封面,标示生物化学课程名称与本章的内容框架
信使RNA和遗传密码要点页,核糖体、转移RNA的功能、蛋白质生物合成的机制
蛋白质生物合成内容页,合成方向:N→C端
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第1页:第十四章 蛋白质的生物合成

第十四章 蛋白质的生物合成

  • 第十四章蛋白质的生物合成

第2页:信使RNA和遗传密码

信使RNA和遗传密码

  • 主要内容
  • 信使RNA和遗传密码
  • 核糖体
  • 转移RNA的功能
  • 蛋白质生物合成的机制
  • 真核生物与原核生物蛋白质合成的差异
  • 蛋白质合成后加工

第3页:蛋白质生物合成

蛋白质生物合成

DNA将其遗传信息转移到mRNA,再由mRNA将这种遗传信息表达为蛋白质中氨基酸顺序的过程叫做翻译。

蛋白质合成的必要条件:20种氨基酸,mRNA、tRNA、核蛋白体、酶和蛋白因子、无机离子、ATP 、GTP

  • 合成方向:N→C端

第4页:信使RNA和遗传密码

信使RNA和遗传密码

  • mRNA与遗传信息的传递
  • 遗传密码的破译
  • 遗传密码的特性

第5页:mRNA

mRNA

与遗传信息的传递蛋白质合成的信息来自于DNA,合成的模板是mRNA蛋白质的合成是在核糖体上进行的,而遗传信息载体DNA存在于核中,必然有一种中间物来传递DNA上的信息。

推测这种中间物极不稳定,在蛋白质合成时产生,合成结束后又分解,半寿期很短。

后来科学家用实验证明这种中间物就是mRNA。

第6页:mRNA与遗传信息的传递

mRNA与遗传信息的传递

1954年,物理学家Gamouv G首先对遗传密码进行探讨。

他认为核酸分子中只有四种碱基,显然碱基与氨基酸的关系不是一对一的关系。

  • 若两个碱基决定一个氨基酸只能编码16种氨基酸,也是不够的;

而三个碱基对一个氨基酸,四个碱基可产生64个密码,足以编码20种氨基酸,所以编码氨基酸的最低碱基数是3,即密码子可能是三联体。

  • mRNA上的三个核苷酸决定一个氨基酸

第7页:mRNA与遗传信息的传递

mRNA与遗传信息的传递

1961年,Crick F H C等人用遗传学的方法证明了三联密码子的学说是正确的。

  • 遗传学上把由于密码移位而造成的突变称为移码突变

在E.coli的T4DNA上的一个基因缺失(或增加)一个或二个核苷酸会造成缺失(或增加)部位以后的全部氨基酸误译。

若同时缺失(或增加)三个核苷酸,前后核苷酸表达仍和正常一样。

必须假设密码子是三联体才能完满地解释以上这些实验结果。

第8页:mRNA与遗传信息的传递

mRNA与遗传信息的传递

  • 生物化学上的证据

烟草坏死卫星病毒中有一分子RNA可编码外壳蛋白的一个亚基,此RNA由1200个核苷酸组成,而此亚基由400个氨基酸组成,也由此证明三个核苷酸决定一个氨基酸

第9页:遗传密码的破译

遗传密码的破译

遗传密码的破译遗传密码的概念:mRNA 上的核苷酸顺序与蛋白质中的氨基酸之间的对应关系称为遗传密码。

mRNA上每三个连续核苷酸对应一个氨基酸,这三个核苷酸就称为一个密码子,或三联体密码(triplet codons)。

以下是三个不同的证明遗传密码是mRNA上3个连续的核苷酸残基构成的实验。

1961年,Nirenberg 等人用大肠杆菌的无细胞体系在各种RNA的人工模板下合成多肽,从而推断出各氨基酸的密码子,后来他与Khorana以及霍利分享了1968年诺贝尔生理学奖。

第10页:第一个实验的概念

第一个实验的概念

  • 遗传密码破译的三个实验

第一个实验是1961年由美国的M.Nirenberg等人完成的。

他首先利用多核苷酸磷酸化酶合成了一条由相同核苷酸组成的多核苷酸链,用它作模板,利用大肠杆菌蛋白提取液和GTP在体外合成蛋白质。

  • 发现多聚(U)导致多聚Phe的合成,表明多聚(U)编码多聚Phe;
  • 类似的实验表明,多聚(A)编码多聚Lys;

多聚(C)编码多聚Pro (下图A)。

第二个实验(核糖体结合技术)是1964年也是由美国的M.Nirenberg等人完成的。

他们首先合成一个已知序列的核苷酸三聚体,然后与大肠杆菌核糖体和氨酰tRNA一起温育。

由此确定与已知核苷酸三聚体结合的tRNA上连接的是那一种氨基酸。

该实验对于几种密码编码同一个氨基酸提供了直接的、最好的证据(下图B)。

第11页:第三个实验的概念

第三个实验的概念

第三个实验是由Jones,Khorana等人完成的。

他们利用有机化学和酶法制备了已知的核苷酸重复序列,以此多聚核苷酸作模板,在体外进行蛋白质合成,发现可以生成三种重复的多肽链(下图C)。

  • 若从A翻译,则合成出多聚Ile,即AUC对应Ile;
  • 若从U翻译,则合成出多聚Ser,即UCA对应Ser;

若从C翻译,则合成出多聚His,即CAU对应His。

这是因为体外合成是无调控的合成,可以随机地从A、或U、或C翻译,所以有三种重复的多肽链生成。

  • 遗传密码破译的三个实验

第12页:遗传密码破译的三个实验

遗传密码破译的三个实验

  • 遗传密码破译的三个实验

第13页:1966年

1966年

  • Nirenberg和Khorana 全部遗传密码字典64个密码子61个负责20种氨基酸翻译
  • 1个起始密码子(AUG和GUG)
  • 3个终止密码子
  • Nirenberg 和Khorana 1968年诺贝尔奖

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第14页:遗传密码的特点⑴密码子的方向性密码

遗传密码的特点⑴密码子的方向性密码

子(mRNA上由三个相邻的核苷酸组成一个密码子,代表肽链合成中的某种氨基酸或合成的起始与终止信号)的阅读方向及它们在mRNA由起始信号到终止信号的排列方向均为5-3’,与mRNA链合成时延伸方向相同。

⑵密码子的简并性64-3=61个代表20种氨基酸,仅甲硫氨酸、色氨酸只有一个密码子。

一个氨基酸可以有几个不同的密码子,编码同一个氨基酸的一组密码子称为同义密码子。

这种现象称为密码子的简并性。

第15页:⑶密码子的连续性从正确起点开始至终止信号

⑶密码子的连续性从正确起点开始至终止信号

⑶密码子的连续性(读码)(无标点、无重叠)从正确起点开始至终止信号,密码子的排列是连续的。

既不存在间隔(无标点),也无重叠。

在mRNA分子上插入或删去一个碱基,会使该点以后的读码发生错误,称为移码,由这种情况引起的突变称为移码突变。

⑷密码子的基本通用性(近于完全通用)对于高等、低等生物都适用.有例外,一些原核生物中利用终止密码翻译AA(UGA-Trp(色)\硒代半胱氨酸)3‘起始密码子5‘

第16页:⑸起始密码子和终止密码子64种密码

⑸起始密码子和终止密码子64种密码

子中,AUG为甲硫氨酸的密码子,又是肽链合成的起始密码子,UAA,UAG,UGA为终止密码子,不编码任何氨基酸,而成为肽链合成的终止部位(无义密码子)。

⑹密码子的摆动性(变偶性)如丙氨酸:GCU,GCC,GCA,GCG,只第三位不同,显然密码子的专一性基本取决于前两位碱基,第三位碱基有较大灵活性。

发现tRNA上的反密码子与mRNA上的密码子配对时,密码子的第一位、第二位碱基配对是严格的,第三位碱基可以有一定变动,这种现象称为密码的摆动性或变偶性(wobble)。

  • I

A、U、C配对。

第17页:核糖体的概念

核糖体的概念

  • 核糖体

核糖体是蛋白质合成的工厂。

  • 核糖体的组成和结构:

组成:60-65%rRNA,30-35%蛋白质。

第18页:蛋白质的结构

蛋白质的结构

结构:球形颗粒,由大小二个亚基组成。

第19页:电镜下的核糖体大小亚基

电镜下的核糖体大小亚基

(本页内容以图示为主,文字要点较少)

第20页:原核与真核核糖

原核与真核核糖

体的主要区别原核真核直径大小18 nm,70S 20-22nm,80S细胞质中部位与mRNA结合与内质网结合、线粒体、叶绿体数量/细胞15000 106-107

第21页:核糖体的功能

核糖体的功能

:1、16S rRNA对识别mRNA上肽链起始位点起重要作用。

  • 参与肽链的启动、延长、终止、移动等核糖体大亚基X-衍射图

第22页:功能位点:1)mRNA结合位点

功能位点:1)mRNA结合位点

:大小亚基的结合面上,为蛋白质合成处。

P位点:肽酰-tRNA结合位点,起始-tRNA和肽酰基-tRNA结合位点。

A位点:氨酰-tRNA结合位点。

第23页:转移RNA的功能

转移RNA的功能

  • 结构:二级结构:三叶草;

三级结构:倒“L”。

第24页:与蛋白质合成有关的位点

与蛋白质合成有关的位点

反密码子位点:由密码子环下方的3个碱基组成,与mRNA上密码子的碱基互补。

3’末端的CCA序列:为aa接受位点,aa共价结合到A残基上。

  • 识别aa-tRNA合成酶的位点:

核糖体识别位点。

第25页:反密码子

反密码子

  • 反密码子环合成酶aa位点可变环D臂Tψ环Tψ臂

第26页:功能:有携带aa的功能

功能:有携带aa的功能

  • 功能
  • 有携带aa的功能;

具倒L型三级结构的tRNA在ATP和酶作用下,可与特定aa结合。

第27页:将aa带到肽链的一定位置

将aa带到肽链的一定位置

有接头作用:氨酰-tRNA凭借自身的反密码子,依靠核糖体的特定位点识别mRNA的密码子并以碱基配对方式与之结合的作用。

将aa带到肽链的一定位置。

第28页:第二遗传密码

第二遗传密码

近年的研究1)第二遗传密码系统的破译:第二遗传密码系统:①将tRNA分子上的某个碱基或bp可决定tRNA携带专一aa的作用;

②aa-tRNA合成酶和tRNA之间的相互作用称为~。

由此认为:tRNA也储存遗传密码,如:Lys-tRNA的aa接受臂上的G3·G70→ G3·U70取代时,可接受Ala(丙)

第29页:

第30页:tRNA中的识别碱基

tRNA中的识别碱基

(本页内容以图示为主,文字要点较少)

第31页:人工合成的小螺旋结构

人工合成的小螺旋结构

可携带aa由此说明:tRNA携带aa 并不一定需要完整的分子结构。

第32页:蛋白质生物合成的分子机制概念

蛋白质生物合成的分子机制概念

  • mRNA解读方向:5’→3’

肽链延伸方向:从N端向C端进行。

  • 5’3’N端C端

第33页:过程、aa的激活;、肽链延长;

过程、aa的激活;、肽链延长;

  • aa的激活;
  • 肽链合成的启动;
  • 肽链延长;
  • 肽链合成终止释放;

肽链折叠和加工。

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第34页:氨基酸的活化aa-tRNA合成

氨基酸的活化aa-tRNA合成

  • 氨基酸的活化(氨酰-tRNA的合成)aa-tRNA合成酶:具高度专一性,表现在:1)对aa;

对tRNA,从而保证了pr合成的忠实性。

  • aa-tRNA合成酶

第35页:反应过程:分两步

反应过程:分两步

  • 在细胞质中完成:1)aa-AMP-E 复合物形成:需Mg2+、Mn2+;
  • aa从aa-AMP-E 转移到相应的tRNA上:E +E--E

第36页:表示:如:用于起始的第一个aa

表示:如:用于起始的第一个aa

为N-甲酰甲硫氨酸(fMet),起始用的氨酰-tRNA表示为:fMet-tRNAfMet也可简写成:fMet-tRNA

第37页:氨酰-tRNA的合成

氨酰-tRNA的合成

(本页内容以图示为主,文字要点较少)

第38页:肽链合成的起始:1)起始所需材料

肽链合成的起始:1)起始所需材料

  • 在核糖体上合成肽链以E.coil为例
  • 肽链合成的起始(initiation):1)起始所需材料:核糖体30S亚基、50S亚基;
  • 带起始密码的mRNA;
  • fMet-tRNAfMet;
  • 起始因子(IF
  • IF
  • IF3);
  • 2个GTP;

Mg2+。

第39页:通常在起始密码

通常在起始密码

上游有SD序列(富含嘌呤),有利于与16S rRNA互补,有利于mRNA与rRNA的结合。

  • 故又称核蛋白结合位点(ribosomal binding site RBS)①SD序列:

第40页:②原核细胞合成pr都从fMet开始

②原核细胞合成pr都从fMet开始

  • 由细胞内甲酰化酶催化Metα-NH2甲酰化,

第41页:③起始因子:IF3:阻止30S亚基

③起始因子:IF3:阻止30S亚基

③起始因子(initiationfactors,IF):IF3:阻止30S亚基与50S亚基结合;

  • IF2:具GTP水解酶的作用;
  • IF1:协调IF

IF3离开小亚基。

第42页:30S·mRNA

30S·mRNA

  • 起始过程:①大小亚基分开;
  • ②形成复合物;

30S·mRNA·IF3③形成30S起始复合物④形成有生物学功能的70S起始复合物。

此时空着的A位点准备接受下一个aa-tRNA。

第43页:肽链延伸:所需组分

肽链延伸:所需组分

肽链延伸(elongation):所需组分:70S起始复合物aa2-tRNA2转肽酶(肽酰转移酶peptidyl transferase)延伸因子:EF-Tu、EF-Ts移位因子(移位酶,G因子)2个GTP Mg2+

第44页:反应分三步:1)进入A位点

反应分三步:1)进入A位点

  • Tu-GTP与aa2-tRNA2结合成复合物,
  • aa2-tRNA2与A位点上mRNA密码子结合,

重新生成Tu-GTP。

除fMet-tRNAfMet外,所有aa-tRNA进入A位点都需先与Tu-GTP结合。

第45页:延长因子的循环

延长因子的循环

  • 延长因子(elongation factor,EF-T)的循环

第46页:肽键形成

肽键形成

  • P位点上fMet与tRNA脱离,

在转肽酶作用下,其羧基与A位上的aa2-tRNA2的氨基形成肽键,成2肽。

此时,P位空出。

第47页:核糖体沿mRNA 5’→3’移动了1

核糖体沿mRNA 5’→3’移动了1

  • 移位:

在移位酶(G)作用下,肽酰-tRNA从A→P,消耗GTP。

核糖体沿mRNA 5’→3’移动了1个密码子的距离,使原来A位上的肽酰-tRNA到P位,原来P位上无负载的tRNA离开核糖体。

重复至肽链必需长度。

第48页:延长过程

延长过程

(本页内容以图示为主,文字要点较少)

第49页:所需材料:70S核糖体、带终止密码

所需材料:70S核糖体、带终止密码

  • 肽链合成的终止与释放1)所需材料:70S核糖体、带终止密码的mRNA、释放因子(RF
  • RF

RF3)。

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第50页:释放因子的功能:RF1:识别终止密码

释放因子的功能:RF1:识别终止密码

  • 释放因子(release factor,RF)的功能:RF1:识别终止密码UAA、UAG;
  • RF2:帮助识别终止密码UAA、UGA;

RF1 和RF2 还可使P位上的转肽酶活性转变成水解酶活性,使肽酰-tRNA进入水相而不去A位。

RF3:协助肽链从P位点释放。

第51页:终止包括两步:A、RF与mRNA

终止包括两步:A、RF与mRNA

  • 终止(termination)包括两步:A、RF与mRNA终止信号结合,激活转肽酶;

B、水解肽链和tRNA间的键,新合成肽链、tRNA、mRNA离开核糖体,后者即解离成大、小亚基,进入下一轮反应。

第52页:蛋白质的合成过程

蛋白质的合成过程

(本页内容以图示为主,文字要点较少)

第53页:真核生物与原核生物蛋白质合成的差异

真核生物与原核生物蛋白质合成的差异

合成机理类似,但真核生物的某些步骤更为复杂,涉及更多的蛋白因子。

  • mRNA:原核;
  • 多顺反子(为二条或多条多肽链编码的mRNA);

真核:单顺反子(为一条多肽链编码的mRNA),无富含嘌呤的起始序列。

第54页:起始复合物形成所需蛋白因子的差异:原核

起始复合物形成所需蛋白因子的差异:原核

  • ;
  • 3种(IF1、2、3);
  • 真核:9种;
  • 核糖体:原核:70S;
  • 真核:80S(60S、40S):

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第55页:起始复合物形成过程的差异

起始复合物形成过程的差异

  • 起始的tRNA:原核:fMet-tRNAfMet 真核:Met-tRNAMet
  • 起始密码:原核:多种;
  • 真核:AUG

第56页:真核:ATP

真核:ATP

  • 起始复合物形成所需能量:原核:GTP;
  • 真核:ATP:

第57页:形成过程的不同:真核起始过程

形成过程的不同:真核起始过程

  • 如下:43S起始复合物48 S起始复合物80S起始复合物

第58页:肽链延长和终止过程

肽链延长和终止过程

  • 肽链延伸因子不同;
  • 原核:Tu、Ts;
  • 真核:EF1α EF1βγ2、移位因子不同:原核:G因子;
  • 真核:EF2

第59页:真核:释放因子RF识别终止密码

真核:释放因子RF识别终止密码

  • 释放因子不同:原核:RF1.RF2 ;

真核:释放因子RF识别终止密码,终止消耗GTP。

第60页:肽链合成后处理

肽链合成后处理

肽链合成后,经若干加工后,才能使合成的肽链具一定的空间结构和生物学活性。

真核生物的加工部位在高尔基体。

  • 蛋白质的合成、分拣和成熟粗面内质网高尔基体细胞膜

第61页:后处理类型如下

后处理类型如下

切除氨基末端的fMet:去甲酰化酶、氨肽酶催化下,切去1或几个aa。

个别aa的修饰:羟基化、磷酸化、甲基化、乙酰化、糖化、酯化等。

二硫键的形成——胰岛素:。

第62页:蛋白质的功能

蛋白质的功能

在肽酶作用下,切除N端信号肽:信号肽:13-26个aa组成,中间有高度疏水aa组成的肽链。

功能:引导pr前往细胞固定位置。

  • 受体蛋白循环核糖体循环

第63页:切除一段肽链:酶原激活

切除一段肽链:酶原激活

  • 肽链与辅助成分的缔合:胶原蛋白的形成

第64页:分子伴侣、监护蛋白

分子伴侣、监护蛋白

在辅助蛋白参与下,新生肽折叠成有活性的构象。

分子伴侣、监护蛋白:参与生物体内多肽链折叠组装的辅助蛋白。

功能:通过与新生肽或部分折叠的pr结合,加速折叠和组装成天然构象的进程。

基质引导信号hsp70胞质溶胶线粒体外膜线粒体内膜受体蛋白蛋白酶切除信号肽线粒体hsp70接触位点跨双层膜的蛋白质通道

第65页:蛋白质合成

蛋白质合成

所需能量:在合成1个肽键的过程中:氨基酸活化:2个GTP肽链延长:1个GTP肽链移位:1个GTP 共计:4个GTP ×7.3=29.2Kcal/mol而1 mol肽键水解,释放-5 Kcal/mol;∴肽键合成标准自由能变化-24.2Kcal/mol。

反应不可逆。

能量的消耗保证了翻译的准确性。

第66页:活性肽合成的特征:活性肽:在生物

活性肽合成的特征:活性肽:在生物

体内具特殊生物学功能的多肽。

如:许多激素、催产素、加压素、舒缓激肽等。

合成:是从非活性的pr前体经特殊酶加工而成。

  • 步骤:

在内质网合成:由信号肽引入内质网腔,信号肽由信号肽酶水解,有特殊位点。

在高尔基体上进行选择性酶促加工:修饰或调整,将无活性的激素原前体加工成活性肽。

第67页:遗传密码破译的三个实验?2.什么是密码

遗传密码破译的三个实验?2.什么是密码

  • 遗传密码破译的三个实验?2.什么是密码子?遗传密码的特点?3.总结原核生物的蛋白质合成
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