页数:118页文件大小:7.87 MB来源: 生物化学ppt课件
本课件系统讲解核酸的生物合成,以遗传学中心法则为主线,先介绍DNA的半保留复制、复制起点与方向、参与复制的酶和蛋白因子及冈崎片段,再说明逆转录与DNA的损伤修复机制,随后展开RNA的转录过程、RNA聚合酶、启动子与终止子,以及真核生物RNA的转录后加工。
第十三章 核酸的生物合成
DNA的生物合成
遗传学的中心法则
通过转录和翻译,将遗传信息传递给蛋白质分子,从而决定生物的表现型。
DNA的复制、转录和翻译过程就构成了遗传学的中心法则。
反中心法则
信息分子的复制
复制:指以亲代DNA分子为模板合成
复制(replication):指以亲代DNA分子为模板合成出子代DNA分子的过程。
转录(transcription):以DNA分子为模板合成出与其核苷酸顺序相对应的RNA的过程。
反转录
以RNA为模板将遗传信息传给DNA的过程。
艾滋病—“现代瘟疫”
艾滋病的英文缩写AIDS的全称为获得性免疫缺陷综合症(acquiredimmunedeficiencysyndrome)。
引起艾滋病的元凶是一种人类免疫缺陷病毒(humanimmune-deficiencyvirus,HIV)
HIV基因组进入人体后
HIV基因组(RNA)进入人体后,专门识别T淋巴细胞(主要免疫细胞,具有抗感染作用),在逆转录酶的作用下,以HIV的RNA为模板,产生了与RNA互补的DNA链。
它们以出芽的方式从宿主细胞中释放出来,又去攻击其他的T淋巴细胞。
DNA的生物合成
半保留复制假说的提出:1953年,Watson & Crick在DNA双螺旋基础上提出。
DNA复制的假设
混合式。
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实验证明:方法:将E.Coli培养
进行氯化铯密度梯度离心。
再移至14N培养基中生长、提取DNA、离心分析。
结果:证实了DNA复制时
亲代分子分为二个亚单位(两条链),分别构成子代分子的一半,且经过多代仍保持完整性。
DNA的概念
DNA是处于不断变异和发展之中。
DNA复制的起点和方向
放射自显影。
细菌染色体DNA的概念
细菌染色体DNA是双向复制,大多是一个起点。
复制起点
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复制叉:细菌为环状DNA
复制起始于单个位点,双向,半保留,每个复制泡(眼)包括2个复制叉(DNA 的两条链在起始点分开形成)。
复制叉
(本页内容以图示为主,文字要点较少)
大肠杆菌E.Coli
以复制叉形式完成复制。
原核细胞DNA的复制
有外切酶活性。
COLiDNA聚合酶Ⅰ
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DNA聚合酶Ⅰ功能
催化dNTP加到DNA链的3’-OH末端(方向5’→3’)。
DNA聚合酶Ⅱ
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DNA聚合酶Ⅰ
DNA聚合酶Ⅱ DNA聚合酶Ⅲ亚基数目1(单体酶)>1(多亚基酶)>1(多亚基酶)5’3’聚合活性+ 中+ 很低+ 很高3‘5’外切活性+ + +(保护DNA复制的忠实性fidelity)5‘3’外切活性+ --主要是对DNA损伤的修复;
以及在DNA复制时切除RNA引物并填补其留下的空隙。
修复紫外光引起的DNA损伤DNA 复制的主要聚合酶,还具有3’-5‘外切酶的校对功能,提高DNA复制的保真性
COLi的DNA
E.聚合酶功能Ⅰ Ⅱ Ⅲ5’→3’聚合作用+ + +5’→3’外切酶作用+ --3’→5’外切酶作用+ + +聚合核苷酸数/min 600 30 9000分子数/细胞400 100 10
DNApolⅢ主要负责DNA链延伸。
双链DNA复制的分子
5’→ 3’走向的DNA是由许多5’→3’方向合成的DNA片段连接而成的。
②实验
电子显微镜观察。
冈崎片段:以5’→ 3 ’走向DNA为模板合成的小片段。
约1000-2000bp。
DNA的概念
DNA是半不连续合成的。
前导链(leading strand):以3’→5’链为模板,新生链以5’→3’方向连续合成;
后随链(lagging strand):冈崎片段:以5’→3’链为模板链,DNApol以5’→3’方向合成小片段DNA即。
由冈崎片段连接成的DNA链为后随链。
RNA引物①问题提出
RNA酶水解证明。
③RNA引物酶
催化引物合成:在DNA一定部位合成并与其互补,合成方向5’→3’。
④RNA引物(RNA primer)
引物酶合成的引物为十几个核苷酸。
冈崎片段引物的合成不需要特异的起始部位。
⑤过程:A、引物酶沿复制
叉反方向合成后随链引物。
B、DNApol Ⅲ在引物上延伸(前导链和后随链)。
C、完成DNA合成后,DNApol Ⅰ用其5’→3’外切酶活性除去引物。
D、DNA连接酶将两个冈崎片段连接起来。
DNA连接酶:作用:催化相邻的二个
②两片段需与同一互补链结合;③反应耗能。
后随链生成包括
终止:切除RNA引物,连接各片段。
模板DNA前导链模板解旋酶引物后滞链
模板DNpolymerase连接酶冈崎片段已连接的冈崎片段单链结合蛋白新合成的前导链DNA聚合酶4)母本DNA双链的分离
与此相关的酶
DNA解链酶(DNAhelicase):使复制叉前方DNA双螺旋解开一小段。
每解1个bp需耗2个ATP。
单链结合蛋白(Single Strand Bindingprotein,SSB):几分子的SSB与已分开的DNA链紧密结合,以防两链重新结合。
此时,复制酶系统结合在模板链上,进行半不连续复制。
DNA旋转酶
兼内切酶和连接酶活力。
DNA拓扑异构酶Ⅱ,可引入负超螺旋,消除复制叉前进时带来的扭曲张力。
DNA聚合酶的校对作用
依赖于3个聚合酶的3’末端外切酶活性,进行校对和纠错。
多种蛋白质参与,从而保证了复制的准确性。
总结:原核细胞DNA的复制
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合成步骤:解旋:由拓扑异构酶Ⅱ解除超螺旋
DNA链延长:在引物3’-OH基上
按碱基互补原则经DNA聚合酶(主要是酶Ⅲ)催化DNA链从5’→3’延伸。
后滞链为不连续的冈崎片段。
按碱基互补原则
按碱基互补原则,沿5’→3’方向,补齐缺口。
连接封口:由DNA连接酶催化
将补齐缺口的3’-OH基与下一个冈崎片段的5’-P以磷酸二酯键连接起来(消耗NAD+),最终形成完整的、与模板互补的DNA新链。
校正并修复DNA:由DNA
聚合酶校正并切除错配,再按5’→3’方向加上正确核苷酸。
至此,原核细胞DNA合成完毕。
DNA聚合酶具有模板依赖性
①、DNA聚合酶具有模板依赖性,复制时dNTP按A-T、G-C碱基配对规律对号入座,使子代DNA与亲代DNA核苷酸顺序相同,但有大约10-4的错配。
②、DNA聚合酶I、Ⅱ、Ⅲ均有3’→5’的外切酶活性,有纠正错配的校正作用,使错配减至10-6。
③、再经错配修复机制,使错配减至10-9以下。
真核细胞DNA的复制
DNA模板上有多个起点,即真核细胞DNA复制由多个复制子共同完成。
复制DNA:α→后滞链
引物合成:α。
真核细胞内有五种DNA
在聚合酶(与细菌DNA聚合酶的性质基本相同:底物、模板、引物、方向)αβγδ ε定位细胞核细胞核线粒体细胞核细胞核3‘-5’外切--+ + +酶活性功能引物合成修复作用线粒体DNA的复制核DNA的复制修复作用
反转录作用:反转录:以RNA为模板
反转录作用:(RNA指导的DNA合成)反转录(逆转录revers transcription):以RNA为模板,4种dNTP为底物,合成与模板互补的DNA的过程。
这与通常转录过程中遗传信息从DNA到RNA的方向相反,故称~。
反转录酶:RNA指导的DNA聚合酶(RNA-directed DNApolymerase),催化逆转录反应的酶。
HIV的复制
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反转录作用的生物
反转录病毒可改建成理想的信息载体
用于分子生物学的研究:合成基因、测序。
DNA的损伤与修复概念
DNA的损伤:一些理化因素:UV(紫外线)、电离辐射和化学诱变剂可使细胞DNA受到损伤而引起生物突变或致死。
细胞的修复机制:1)光复活修复
:可见光激活了光复活酶,它能分开由于UV照射形成的嘧啶二聚体,而恢复原来状态。
暗修复:在一系列酶作用下
暗修复(切除修复):在一系列酶作用下,将DNA受损部分切掉,并以完整链为模板,合成被切部分,从而使DNA恢复正常。
细菌的限制-修饰系统
细菌碱基修饰:概念:在DNA
特定短碱基序列上产生某专一性修饰,在整个细胞周期中保持完整,使得内切酶可识别而不能断裂。
如:修饰甲基化酶。
被修饰的碱基可逃避宿主限制酶作用
被修饰的碱基可逃避宿主限制酶作用。
用于基因重组。
利用限制酶进行基因重组
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基因重组与DNA“克隆”1
、基因重组:将不同DNA片段按设计方案定向地连接起来,并在特定受体细胞中与载体一起复制表达,使受体细胞得到新性状。
DNA克隆:将目的DNA
插入基因载体后,在细菌细胞中生长而扩增百万倍以上.这种以单一DNA片段复制成许多相同DNA片段的过程称~。
聚合酶链式反应
(PCR)技术与DNA扩增概念:1985年Mullis发明的一种体外模拟自然DNA复制的核酸扩增技术。
1993年获得诺贝尔奖原理:提供两个寡核苷酸引物能与互补DNA链上的侧翼序列杂交,利用PCR即能合成某一序列的大量拷贝。
PCR技术就的概念
PCR技术就是在体外中通过酶促反应有选择地大量扩增(包括分离)一段目的基因的技术。
dNTP(dATP, dTTP, dGTP和dCTP)。
聚合酶链式反应
聚合酶链式反应
广泛用于克隆、测序、产生特异
RNA的生物合成
RNA(ribonucleic acid)的生物合成储存于DNA中的遗传信息需通过转录和翻译而得到表达。
转录的产物有:信使RNA(messenger RNA, mRNA)核糖体RNA(ribosome RNA, rRNA)转移RNA(transfer RNA, tRNA)
转录方式
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转录(DNA指导下的RNA合成)
遵从碱基配对规律。
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模板链:DNA双链中只一条链可做转录
模板链:(大多数情况)DNA双链中只一条链可做转录模板(拷贝),此链称~或反义(-)链。
编码链:无转录功能的DNA链称为~或正义(+)链。
转录的不对
即转录的可选择性。
③按细胞需要“开放或关闭”。
RNA聚合酶
反应方向:5’→3’。
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催化的反应:不需引物
在单核苷酸的3’-OH上逐个加核苷酸。
原核细胞的RNA聚合酶
同一种酶催化3种RNA的合成。
亚基每分子酶所含数目分子量(KD)功能大肠杆菌RNA聚合酶组分α 2 37 结合调控序列,决定特定基因的转录β 1 151 结合底物,形成磷酸二酯键β’ 1 155 结合DNA模板σ 1 70 识别起始点启动子,发动合成
原核生物
的RNApol全酶与DNA的结合全酶:具有α2ββ’σ亚基的RNApol。
核心酶:没有σ亚基的RNApol。
真核细胞的RNA聚合酶
3种酶,亚基复杂。
真核生物RNA聚合酶类型部位转录产物对鹅膏蕈碱的敏感度Ⅰ 核仁28S,18S,5.8S rRNA 不敏感Ⅱ 核质mRNA, 病毒RNA, hnRNA 高度敏感Ⅲ 核质tRNA, 5SrRNA 中度敏感
转录产物结构特点:5’端
原核细胞的转录包括:起始、延伸、终止
起始:A、启动子:DNA上的一段序列
,为转录开始的位点。
包括:上游的-35序列和-10(Pribnow box)序列。
图中+1为DNA模板上被转录成RNA的第一个核苷酸,即转录起始位点。
起始过程:三步:A、全酶与启动子结合
形成磷酸二酯键
RNA链从5’端开始,在全酶作用下ATP或GTP与第2个NTP间形成磷酸二酯键。
延伸:a、合成开始后
,σ亚基释放,然后都由核心酶催化。
b、核心酶沿模板移动,选择NTP,暂时形成DNA-RNA杂交链。
RNpol向前移动
c、,DNA解链酶向前推进,RNA链延长。
方向:RNpol沿模板链
d、3’→ 5’,RNA合成方向5’→ 3’。
速度:25-50b/s。
终止信号:富含GC
终止信号:富含GC的回文序列和随后一段富含AT的结构。
RNpol到达终止位点,聚合反应停止。
不需ρ因子的终止a 、发夹结构
A、的形成:DNA上的回文序列使RNA产物3’端自身碱基互补,形成发夹结构,杂合链趋于解体。
b 、产物的寡聚U片段促进RNA 从DNA上脱落:杂交链中A-U间氢键相对较弱,新生RNA易从模板上脱落,不需ρ因子即可终止。
不需ρ因子的终止
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需ρ因子终止ρ因子是一个6聚体蛋白
NTPase活性:3)解旋酶活性。
解旋酶活性使RNA:DNA杂合链拆开,释放RNA,酶和ρ因子一起从DNA上脱落下来。
需ρ因子终止
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蛋白质编码基因多的概念
其基因家族是多拷贝的基因重复组成,故一个基因上可同时进行多个转录过程,产生多条RNA链。
蛋白质编码基因多是不连续的,编码部分(外显子)被不编码基因(内含子)隔断。
多起点转录南非爪蟾的卵母细胞
转录过程:A、起始
有些无TATA框,以看家基因(housekeeping genes)起始转录。
转录因子(transcription factor Ⅱ ,TFⅡ):由多种蛋白质组成,与启动子装配成复合物,协助聚合酶Ⅱ结合,起始转录。
与RNpolⅡ结合,形成起始前复合物
与RNpolⅡ结合,形成起始前复合物(PIC)。
与原核类似
RNApolⅡ催化RNA3’-OH对新进入的NTP的α磷酸基进行亲核攻击,RNA以5 ’→3’合成。
终止
转录终止与转录后修饰密切相关。
转录过程的抑制剂:1)放线菌素D
:插入DNA的dG-dC间,与G形成氢键,使DNA变形、失去模板功能,从而阻止RNpol沿模板链移动而抑制RNA延长。
此为原核和真核生物RNpol的专一抑制剂。
口丫啶acridine
:为具扁平芳香族发色团的染料,可插入双链DNA相邻bp间,使DNA复制时缺失或增添一个核苷酸,从而导致移码突变,也可抑制RNA的起始和质粒DNA的复制。
利福平
与RNpol的β亚基结合,抑制原核细胞RNA的合成。
α-鹅膏蕈碱
分离自鬼笔鹅膏的一种八肽化合物,通过RNpol Ⅱ抑制真核生物RNA合成。
转录产物的加工
在专一酶作用下,切除多余部分或修饰,才成为“成熟的”RNA。
此过程称为转录后加工。
涉及:帽化、聚腺苷酸化、RNA剪接、碱基修饰等过程。
mRNA的加工:原核生物
的mRNA转录后一般不需要加工,转录的同时即进行翻译(半寿期短)。
亦有少数多顺反子的mRNA需要核酸酶切成小单位,然后再翻译。
多顺反子:为多条多肽链编码
真核mRNA的加工
5’端加上甲基化的鸟嘌呤帽。
pr合成起始中发挥作用。
聚腺苷酸化:过程:切去转录
由多聚腺苷酸聚合酶以ATP为前体,在3 ’端加上约100-200个腺苷酸尾巴(polyA)。
增加翻译效率。
剪接
即精确切除内含子序列的过程。
snRNA:富含u,部分序列与剪接点处序列互补,可识别剪接点。
这些为催化性RNA,称核酶。
snRNP:snRNA与几种辅助蛋白组成。
剪接体:snRNP与hnRNA组成。
2’,5’磷酸二酯键形成,释放外显子1
2’,5’磷酸二酯键形成,释放外显子1。
外显子1的3’-OH亲核攻击外显子2的5’-P,形成磷酸二酯键,释放套索。
核糖体RNA前体的加工
RNA酶剪切形成16S、23S rRNA。
本页源文件为图片化表格,文字抽取后列结构已粘连,暂按原文罗列,建议对照原图还原为表格。
真核rRNA加工
线性rRNA具有许多反向互补序列
线性rRNA具有许多反向互补序列,可形成局部双螺旋。
意义:对研究生命起源和进化有重大
可人工设计酶。
破坏对人类不利的基因
破坏对人类不利的基因。
tRNA前体的加工
RNA复制在某些生物
RNA复制(RNA指导的RNA合成)在某些生物中,RNA还可是遗传信息的携带者,并可通过复制合成与自身相同的RNA分子。
以病毒RNA为模板的RNA合成:RNA→RNA在依赖于RNA的RNA聚合酶(RNA复制酶)催化下完成。
多核苷酸磷酸化酶:以一种NDP或4
多核苷酸磷酸化酶(无模板的RNA合成):以一种NDP或4种NDP为底物,在多核苷酸磷酸化酶(与RNA合成有关的酶系)作用下,合成类似RNA的聚合物,同时放出磷酸的过程。
在细胞内的功能可能是分解RNA。
核酸的应用
应用:在实验室制备各种RNA聚合物。
设计核酶。
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