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08 第八章 生物反应工程领域的拓展.ppt

页数:209页文件大小:43.25 MB来源: 生物反应工程ppt课件

本课件展示生物反应工程的前沿拓展领域:质粒复制与基因表达动力学、温和压力下的变压生物转化与应激代谢产物、发状念珠藻单体细胞培养及其在荒漠化治理中的作用、细菌纤维素的生物合成与多领域应用,以及聚赖氨酸发酵过程的神经网络建模与优化控制。

第八章章节标题页,本章涵盖质粒动力学、温和压力生物催化、发状念珠藻培养与界面微生物生长模型
主要内容页,列出质粒复制动力学、超临界相态生物反应、菌体形态变化与界面生长模型五部分
小节目录页,列出 λdv 质粒概述、模型假设、复制动力学与基因表达动力学
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第1页:第八章生物反应工程领域的拓展

第八章生物反应工程领域的拓展

第2页:第八章主要内容

主要内容

  1. 质粒复制与表达的动力学
  2. 超临界相态下的生物反应
  3. 菌体形态在发酵过程中的变化
  4. 界面微生物生长模型
  5. 双液相生物生长进展

第3页:8.1 质粒复制与表达的动力学

8.1 质粒复制与表达的动力学8.1.1 λdv质粒的概述8.1.2 动力学模型的几点假设8.1.3 质粒复制动力学8.1.4 基因表达动力学

第4页:8.2 温和压力提高生物催化效率

8.2 温和压力提高生物催化效率一、研究背景二、变压生物转化三、加压提高生物应激代谢物的合成四、几点思考

第5页:生物催化与压力的定义

一、研究背景

  • 生物催化(biocatalysis)是指利用酶或有机体(细胞、细胞器)作为催化剂对底物进行催化反应,该反应过程又被称为生物转化。
  • 压力是除温度、化学组分外,影响化学反应的重要热力学参量。

第6页:压力生物技术的分类

压力生物技术的分类

  • 超高压生物技术(>100 MPa)
  • 超临界生物反应(10~100 MPa)
  • 温和压力(Mild pressure)下的生物催化反应——变压生物转化(0.1~1.0 MPa)

第7页:压力影响生物反应的几个方面

研究背景(2)压力影响生物反应的几个方面

  • 反应速率和平衡常数
  • 酶的蛋白结构,影响其底物专一性和催化活性
  • 影响微生物的细胞形态、生理乃至遗传特性的产生

第8页:压力对化学反应的影响法则

压力对化学反应的影响遵循Le Chatelie法则

  • 如果一个反应的活化体积为——300ml/mol,100Mpa压力下反应速率提高了约200,000倍。
  • α胰凝乳蛋白酶研究背景(3)

第9页:反应的活化体积

研究背景(4)反应的活化体积一些生物化学Abe F. et al. (1999)

第10页:利用压力提高催化效率的实例

利用压力提高生物催化效率的部分实例

  • 温和压力下的酶促反应合成药物(酯化布洛芬、某些多肽等)
  • 加压生物氧化法处理有机废水(加速 BOD 降解)
  • 加压原位发酵分离技术(酒精发酵等)
  • 加压发酵提高产品品质(啤酒发酵等)

第11页:超临界流体中的生物催化反应

部分压力下的生物催化反应:原表按「底物—酶—反应介质」三列列出菜籽油、油酸、胆固醇、木聚糖、甲基丙烯酸甲酯等底物在脂肪酶、多酚氧化酶、胆固醇氧化酶、角质酶、木聚糖酶与枯草杆菌蛋白酶催化下的反应。

注:原表为多列长表,源文件中各列文字严重粘连,无法安全切分还原为表格,建议对照原课件图片核对后补充。

第12页:变压生物转化的定义

变压生物转化
根据微生物本身特性,在生物反应的一定阶段施加温和压力,使细胞代谢通量沿目的产物方向加强,或使酶活力提高的一种生物催化方法。

第13页:高压试验装置流程图(一)

变压生物转化(1)图1高压试验装置流程图(1)

第14页:高压试验装置流程图(二)

变压生物转化(2)图1高压试验装置流程图(2)

第15页:微生物 β-11 位羟基化转化反应

变压生物转化(3)图2 微生物β-11位羟基化转化反应O2

第16页:加压生物转化的试验设计

表 1 试验设计(小时):原表对比常压与 0.5 MPa 加压条件下的培养时间安排。

注:原表数值在源文件中数字粘连严重,无法安全切分还原,建议对照原课件图片核对。

第17页:氮气加压对生物转化的影响

图3 N2为加压介质对生物转化的影响■, 0; ▲,1; ●,2; □,3; △,4; ○,5变压生物转化(5)

第18页:高纯空气加压对生物转化的影响

图4 高纯空气为加压介质对生物转化的影响■, 0; ▲,1; ●,2; □,3; △,4; ○,5变压生物转化(6)

第19页:添加氧载体的加压生物转化

图5 高纯空气为加压介质,同时添加氧载体对生物转化的影响■,0; ▲,1; ●,2; □, 3; △,4 ○, 5变压生物转化(7)

第20页:压力对菌丝球形态的影响

变压生物转化(8)图6 压力对蓝色梨头霉菌丝球形态变化的影响A: 常压下的菌丝球形体B: 加压后菌丝球形体

第21页:氮气加压与常压的电镜照片

AB图7 电镜照片A 氮气0.5MPa;B 常压变压生物转化(9)

第22页:高纯空气加压的电镜照片

变压生物转化(10)BA图8 电镜照片A高纯空气0.5MPa;B 常压

第23页:加压对脱氢酶活力的影响

图9 加压对蓝色梨头霉脱氢酶活力的影响■:脱氢酶活力□:氢可转化率变压生物转化(11)

第24页:压力对菌丝球通透性的影响

变压生物转化(12)图10 压力对犁头霉菌丝球通透性的影响■▲◆分别为0.1MPa下电导率,A280和A260 ; □△◇分别为空气0.5MPa下电导率,A280和A260 A260A280

第25页:

第26页:加压提高氢化可的松转化的原因

加压提高甾体药物(氢化可的松)生物转化(10~15%)的原因

  • 提高底物的溶解速率
  • 改善了菌丝团结构
  • 增加生产菌株的细胞膜通透性
  • 提高了脱氢酶活力和强化了相关途径

第27页:加压提高氨基酸与核苷酸的合成

三、加压提高生物应激代谢物质的合成

  • 氨基酸或核苷酸:鸟嘌呤核苷、谷氨酸、脯氨酸和精氨酸–转化期和产酸期发酵液中充分供氧–罐压的改变提高细胞膜通透性–加强了特定的代谢途径,有利于产物合成,例如较高浓度的氧有利于加强生产菌HMP途径,利于鸟苷的生成。

第28页:压力促进应激代谢产物的生成

压力作为胁迫因子,可改变细胞正常生理状态下的代谢通量,刺激细胞发生应激反应:

  • 海藻糖(1.0 MPa 处理 3h 提高 27%)
  • 谷胱甘肽(0.5 MPa 处理 3h 提高 42.6%)
  • 麦角固醇(0.5 MPa 处理 3h 提高 20.1%)

第29页:保压时间对胞内海藻糖的影响

图11保压时间对面包酵母胞内海藻糖和存活率的影响左图: CICC1339; 右图: CICC1447; □, , ○, 为0.1 MPa, 1 MPa CO2和1 MPa N2的细胞存活率■, ▲, ●,为0.1 MPa, 1 MPa CO2和1 MPa N2的胞内海藻糖含量AB加压提高生物应激代谢物质的合成(2)

第30页:保压时间对海藻糖合成酶活力的影响

图12 保压时间对面包酵母胞内海藻糖合成酶活力的影响左图: CICC1339; 右图: CICC1447■, 0.1 MPa ;▲, 1 MPa CO2;●, 1 MPa N2加压提高生物应激代谢物质的合成(3)

第31页:压力对细胞膜通透性的影响

加压提高生物应激代谢物质的合成(4)图13压力对面包酵母细胞膜通透性的影响左图: CICC1339; 右图: CICC1447■:电导率;▲:A280 ;◆:A260

第32页:面包酵母环境扫描电镜照片

加压提高生物应激代谢物质的合成(5)图14 面包酵母CICC1339(左)和CICC1447(右)环境扫描电镜照片(1.0Mpa )

第33页:温和压力研究的几点体会

四、几点体会1、应用领域可以有效提高两相生物催化反应效率;提高微生物应激产物的发酵得率2、基础理论研究温和压力对酶活力影响的基础数据;温和压力对特定微生物细胞形态、代谢途径与通量的变化、基因表达以及活力变化的影响

第34页:发状念珠藻单体细胞培养

8.3 发状念珠藻单体细胞培养--与其在治理荒漠化中的作用?

第35页:发状念珠藻研究内容目录

发状念珠藻研究内容

  1. 发状念珠藻概述
  2. 悬浮培养条件下发状念珠藻形态及生长过程
  3. 开放式悬浮培养
  4. 发状念珠藻培养物成分分析及功能试验
  5. 发状念珠藻细胞固态培养的初步研究
  6. 发状念珠藻细胞野外放大试验
  7. 不同营养模式下发状念珠藻细胞生长的比较
  8. 小结

第36页:发状念珠藻概述

一、发状念珠藻概述荒漠-半荒漠地区陆生蓝细菌荒漠草原唯一优势生长的固氮生物生长于极端环境中的特种生物资源天然发状念珠藻(发菜)

第37页:发状念珠藻资源现状

发状念珠藻资源现状分布具有很强的地域局限性生长极为缓慢,生物量加倍时间需10多年发菜采收

第38页:我国发菜资源与产地状况

我国发菜主产地之一宁夏回族自治区:60 年代发菜生长地面积较大,至 80 年代中期与 90 年代末持续减少;同期商品发菜价格从 70 年代的低位持续上涨,至 2000 年时高达上千元一公斤。内蒙古自治区因采收发菜而遭破坏的草场面积巨大,其中部分已完全退化为荒漠。

注:原页具体的面积(万公顷)与价格(元/公斤)数值在源文件中粘连,无法安全切分还原,此处仅保留趋势描述,建议对照原课件图片核对。

第39页:商品发菜的食用价值

商品发菜发状念珠藻食用价值

第40页:发状念珠藻的药用价值

原材料
念珠藻(マイクロアルジェ)/ヒメマツタケ(岩出101株)/イチョウ葉エキス/クコの実末/エシャロット末/サイクロデキストリン/セルロース特許番号298953390包入¥54,000(税別)抗疲劳抗病毒抗肿瘤图片资料来源于日本MAC网站www.mac-bio.co.jp发状念珠藻药用价值

第41页:发状念珠藻的生态学特征

生态学特征

  • 耐旱性
  • 耐温差
  • 嗜阳性
  • 耐贫瘠性
  • 耐盐性

第42页:发状念珠藻显微结构

BA发状念珠藻显微结构结构A
纵切;B:横切

第43页:天然聚合体与人工培养

发状念珠藻(天然聚合体)培养发状念珠藻培养

第44页:发状念珠藻解决方案

单体细胞细胞开放式培养多糖废液细胞培养封闭式培养成分分析功能实验藻体重建生态修复回流到培养装置保健药品食品开发发状念珠藻解决方案

第45页:液体悬浮培养与光反应器培养

液体悬浮培养光反应器培养开放式培养

第46页:单体细胞类型及形态

液体培养条件下单体发状念珠藻细胞类型及形态

  • A:藻殖段
  • B:营养细胞(横分裂)
  • C:营养细胞(纵分裂)
  • D:异形胞
  • E:细胞团
  • F:厚壁孢子
  • G:繁殖体

第47页:发状念珠藻细胞聚合体的形成

发状念珠藻细胞聚合体的形成液体培养发状念珠藻细胞聚合体

第48页:光照对细胞生长的影响

光照对细胞生长和多糖积累的影响不同光照强度(μmol

  • m-2s-1)下发状念珠藻细胞生长曲线

第49页:光照强度与多糖产量

不同光照强度下发状念珠藻细胞胞外多糖产量

光照强度对发状念珠藻胞外多糖产量的影响
光照强度(μmol·m-2·s-1)多糖产量(mg·L-1)细胞多糖产量(mg·g-1·DW)
2050.283.9
4063.879.2
6073.780.6

第50页:温度对细胞生长的影响

温度对细胞生长和多糖积累的影响不同温度下发状念珠藻细胞生长曲线

第51页:温度与胞外多糖产量

不同温度培养 20 d 发状念珠藻细胞胞外多糖产量

培养温度对发状念珠藻胞外多糖产量的影响
培养温度(℃)多糖产量(mg·L-1)细胞多糖产量(mg·g-1·DW)
2043.158.6
2573.780.6
3067.276.1

第52页:初始 pH 对细胞生长的影响

初始pH值对细胞生长和多糖积累的影响不同初始pH值下发状念珠藻细胞生长曲线

第53页:初始 pH 与多糖产量

初始 pH 值对发状念珠藻细胞胞外多糖产量的影响

初始 pH 对发状念珠藻胞外多糖产量的影响
初始 pH 值多糖产量(mg·L-1)细胞多糖产量(mg·g-1·DW)
6.037.054.2
7.076.287.5
8.088.4106.9

第54页:氮源对细胞生长与多糖的影响

氮源对细胞生长和胞外多糖产量的影响不同氮源下发状念珠藻细胞生长曲线

第55页:不同硝酸钠浓度的生长曲线

不同初始硝酸钠浓度下发状念珠藻细胞生长曲线

第56页:硝酸钠浓度与多糖产量

不同初始硝酸钠浓度下培养 20 d 发状念珠藻细胞胞外多糖产量

硝酸钠浓度对发状念珠藻胞外多糖产量的影响
硝酸钠浓度(g·L-1)多糖产量(mg·L-1)细胞多糖产量(mg·g-1·DW)
035.647.9
1.573.885.0
3.062.462.8
4.544.555.6

第57页:磷酸盐对细胞生长的影响

磷酸盐对细胞生长和多糖积累的影响不同初始磷酸盐浓度下发状念珠藻细胞生长曲线

第58页:磷酸盐浓度与多糖产量

初始磷酸盐浓度对发状念珠藻细胞胞外多糖产量的影响

磷酸盐浓度对发状念珠藻胞外多糖产量的影响
磷酸盐浓度(mmol·L-1)多糖产量(mg·L-1)多糖产量(mg·g-1·DW)
022.871.8
0.17571.181.4
1.7576.383.3
8.7597.681.1
17.593.782.3

第59页:20L 光反应器中的培养过程

光反应器中发状念珠藻细胞培养过程特性发状念珠藻细胞20L光反应器中培养过程曲线

第60页:通气量对细胞生长的影响

通气量对藻细胞生长和多糖积累的影响不同通气量下发状念珠藻细胞生长曲线

第61页:通气量与多糖产量

通气量对发状念珠藻细胞胞外多糖生成的影响

通气量对发状念珠藻胞外多糖产量的影响
通气量(vvm)多糖产量(mg·L-1)细胞多糖产量(mg·g-1·DW)
0.428.238.2
0.637.746.2
0.862.661.1
1.163.463.3

第62页:搅拌桨叶尖速率对生长的影响

搅拌桨叶尖速率对细胞生长和多糖积累的影响不同叶尖速率下发状念珠藻细胞生长曲线

第63页:叶尖速率与生长速率及干重

不同叶尖速率下发状念珠藻细胞生长速率及培养 16 d 细胞干重

搅拌桨叶尖速率对细胞生长与干重的影响
叶尖速率(m·s-1)细胞生长速率(OD750·d-1)细胞干重(g·L-1)
0.30.0270.906
0.50.0351.024
0.80.0431.133
1.00.0401.062
1.50.0390.612

第64页:不同叶尖速率下的细胞形态

20μmABCDEA
0.3 m
  • s-1B, C: 0.5 m
  • s-1D: 0.8 m
  • s-1, 1.0 m
  • s-1E: 1.5 m
  • s-1不同搅拌桨叶尖速率下培养16 d发状念珠藻细胞形态

第65页:叶尖速率与多糖产量

不同叶尖速率下培养 16 d 发状念珠藻细胞多糖产量

搅拌桨叶尖速率对胞外与胞内多糖产量的影响
叶尖速率(m·s-1)EPS 产量(mg·L-1)CPS 产量(mg·g-1)TPS 产量(mg·L-1)细胞 TPS 产量(mg·g-1)
0.338.7147.2172.6189.7
0.562.6136.4201.7197.7
0.8205.149.6261.1231.1
1.0203.843.2249.6235.5
1.5121.418.7132.8217.7

第66页:光照周期对开放式培养的影响

光照周期对于发菜细胞开放式悬浮培养的影响

光照周期对发状念珠藻开放式悬浮培养的影响
光照周期细胞产量(g/L)平均生长速率(μg chla·L-1·d-1)
周期光照(12:12)0.3970.146
全光照0.4550.201

第67页:通气量对开放式培养的影响

通气量对于发菜细胞开放式悬浮培养的影响

第68页:初始液位对开放式培养的影响

初始液位对于发菜细胞开放式悬浮培养的影响

第69页:多糖离子交换层析洗脱曲线

四、发状念珠藻培养物成分分析及功能试验发状念珠藻多糖离子交换层析洗脱曲线

第70页:多糖凝胶层析洗脱曲线

发状念珠藻多糖凝胶层析洗脱曲线

第71页:培养物与天然样品 HPLC 图

发状念珠藻细胞培养物和天然发状念珠藻HPLC图

第72页:细胞与野生样品氨基酸含量

发状念珠藻细胞与天然发状念珠藻氨基酸含量(mg·g-1)

发状念珠藻细胞与野生发状念珠藻氨基酸组成对比
氨基酸种类发状念珠藻细胞野生发状念珠藻
天门冬氨酸51.037.4
苏氨酸23.7—
丝氨酸26.314.0
甘氨酸14.99.8
丙氨酸32.016.3
缬氨酸22.014.8
蛋氨酸3.915.6
异亮氨酸29.314.7
酪氨酸17.89.3
赖氨酸18.712.3
组氨酸11.811.2
精氨酸15.09.2
总量266.4164.6

第73页:培养物抗 HSV-I 试验

发状念珠藻细胞培养物抗 HSV-I 试验

发状念珠藻细胞培养物抗 HSV-I 活性与选择指数
样品细胞毒性 CC50(μg·mL-1)抗 HSV-I 活性 IC50(μg·mL-1)选择指数(CC50/IC50)
培养液上清液 A31002.91100
培养液上清液 B31008.0390
细胞 A13000.9711300
细胞 B1300718

注:A 为样品在病毒侵染 1h 后加入,B 为样品在病毒侵染同时加入;原表数字粘连,细胞样品的选择指数与细胞毒性、IC50 之间不自洽,建议对照原课件图片核对。

第74页:固态培养研究的意义

发状念珠藻细胞培养以游离的藻丝或细胞群体的状态存在,不形成具有完整结构的发状念珠藻体,其如果能在接近自然生长的固态培养条件下进行生长,将对于了解细胞生长过程中的形态变化以及与液体培养的差异,实现从发状念珠藻细胞到发状念珠藻体的生长过程,有重要意义。在荒漠化地区进行发状念珠藻细胞培养,不仅是低成本获取发状念珠藻生物量的一种手段,也将对该地区的生态环境具有一定的改善作用。培养过程中一些人工管理手段的实施及发状念珠藻细胞的生长活动,都将促使其生长地的生态环境向良性化方向演替。五、发状念珠藻细胞固态培养的初步研究

第75页:细胞的耐旱性

  • 发状念珠藻细胞耐旱性FECDAB干燥前后不同时间发状念珠藻细胞荧光染色结果A, B: 干燥前; C, D: 干燥24 h; E, F: 复水24 h

第76页:复水后的光合和呼吸作用

干燥发状念珠藻细胞复水不同时间后光合和呼吸作用

第77页:细胞的耐热性(50℃)

发状念珠藻细胞耐热性A, B
对照; C, D: 50℃处理ABCD干燥发状念珠藻细胞不同温度处理2 h复水后荧光染色结果

第78页:细胞的耐热性(60℃与70℃)

HGEF干燥发状念珠藻细胞不同温度处理2 h复水后荧光染色结果E, F: 60℃处理;G, H: 70℃处理

第79页:温度处理后的光合与呼吸速率

干燥发状念珠藻细胞不同温度处理2 h复水后光合和呼吸速率

第80页:沙粒上细胞的生长过程

沙粒上发状念珠藻细胞的生长图中a为初始接种的情况,b-i分别代表发状念珠藻细胞在同一培养皿上培养5、10、15、20、40、60、80、100d的生长情况

第81页:藻落面积的计算机视觉测定

利用计算机视觉技术,将沙粒上发状念珠藻藻落的形态图片转化为二值图以计算藻落面积。

第82页:沙粒上细胞的生长曲线

沙粒上发状念珠藻细胞的生长曲线

第83页:沙粒表面的细胞生长状态

沙粒上发状念珠藻细胞分泌出的胶质物湿润状态下干燥状态下发状念珠藻细胞在沙粒表面的生长

第84页:干燥状态与复水后的对比

沙粒上发状念珠藻细胞干燥状态与复水后的对比

第85页:沙粒颗粒大小对生长的影响

沙粒颗粒大小对发状念珠藻细胞生长的影响图a、b、c中的培养皿上的沙粒大小分别为<0.44mm,0.44-0.95mm,>0.95mm

第86页:沙培培养基底部的生长

沙培培养基底部发状念珠藻细胞生长情况

第87页:氮源对沙粒上生长的影响

氮源对发状念珠藻细胞生长的影响无氮含氮

第88页:光照对沙粒上生长的影响

光照对发状念珠藻细胞在沙粒上生长的影响高光强20~45 μmol/m2/s 低光强10~20 μmol/m2/s

第89页:接种量对沙粒上生长的影响

不同接种量对发状念珠藻细胞在沙粒上生长的影响(图a、b、c依次代表接种量为4ml、8ml和12ml固体沙培至50d的情况,图d、e、f依次代表接种量为4ml、8ml和12ml固体沙培至70d的情况)

第90页:液体培养细胞与干发菜沙培比较

液体培养发状念珠藻细胞与干发菜细胞沙培比较1mm液体培养发菜细胞干发菜细胞

第91页:固态与液态培养复水恢复比较

固态与液态培养发状念珠藻细胞干燥后复水呼吸作用与光合作用恢复比较

第92页:固态与液态培养耐热性比较

固态与液态培养发状念珠藻细胞的耐热性比较

第93页:细胞对沙粒渗水性与持水性的影响

发状念珠藻细胞及培养液对于沙粒渗水性及持水性的影响渗水性持水性

第94页:沙粒基质上形成的结皮

发状念珠藻细胞在沙粒基质上形成的结皮

第95页:野外扩大培养的时空安排

五、发状念珠藻细胞野外扩大培养时间:2005年6月20日至2005年11月30日地点:宁夏银川市贺兰山东麓

第96页:野外培养不同时期的生长

A:6月20日,B:7月29日,C:8月21日,D:9月24日,E:10月18日,F:11月30日ABCEFDABCDEF

第97页:不同营养模式对生长的影响

七、不同营养模式对发状念珠藻细胞生长的影响

第98页:光合自养与混养的生长曲线

发状念珠藻细胞的光合自养、混合营养的生长曲线

第99页:不同营养模式的细胞形态

细胞的形态和大小A光合自养培养48h的发菜细胞B混养培养48h的发菜细胞C光合自养培养120h的发菜细胞D混养培养120h的发菜细胞ABCD

第100页:室温吸收光谱

室温吸收光谱

第101页:营养模式对生长与多糖的影响

营养模式对发状念珠藻细胞生长与累积多糖的影响25℃45μmol

  • m-2
  • s-1 培养7d□多糖■细胞

第102页:培养基对胞外多糖的影响

培养基对发状念珠藻细胞生成胞外多糖的影响(mg/L)

不同培养基对发状念珠藻胞外多糖生成的影响
培养基5 d10 d15 d20 d
基础培养基11.0240.3164.7768.47
无氮基础培养基68.3159.5481.10161.2
含糖无氮基础培养基182.6276.5879.62447

第103页:发状念珠藻研究小结

小结

  1. 可以进行单体发状念珠藻细胞的悬浮培养,其胞外多糖与天然发状念珠藻水提多糖具有相似生理活性与相同抗病毒活性
  2. 发状念珠藻细胞可以在开放式(深层或固态)环境下单种培养
  3. 细胞可在沙粒基质上生长形成肉眼可见群落并形成约 1 mm 厚结皮,5 个月培养周期生物量增加约 3~4 倍
  4. 比较不同生长模式,混养培养可有效提高发状念珠藻细胞及其多糖产量

第104页:8.4 界面微生物生长模型

8.4 界面微生物生长模型8.4.1 界面的概念8.4.2 界面与微生物8.4.3 界面上丝状真菌的生长8.4.4 界面微生物生长动力学模型

第105页:细菌纤维素的生物合成与应用

细菌纤维素的生物合成及其应用网址http://www.tust.edu.cnhttp://www.tuli.edu.cn

第106页:细菌纤维素研究内容目录

细菌纤维素研究内容

  1. 基本概念
  2. 细菌纤维素的性质
  3. 细菌纤维素的生物合成机制
  4. 细菌纤维素发酵
  5. 细菌纤维素的应用
  6. 有待研究的问题

第107页:细菌纤维素的发现与概念

细菌合成纤维素是在1886年由Brown首次报道。他发现木醋杆菌(Acetobacterxylinum)在静止培养时于培养基表面形成一层白色纤维状物质,经化学与物理方法分析确定此类物质具有纤维素的结构与化学性质,因其属细菌合成而命名为细菌纤维素。一、基本概念

第108页:细菌纤维素与东方传统发酵食品

细菌纤维素与东方传统发酵食品

第109页:可合成纤维素的九个属

在不同条件下,常见以下九个属中的某些种的微生物合成纤维素,统称为细菌纤维素:

  • 醋酸菌属(Acetobacter):如木醋杆菌 Acetobacter xylinum、氧化葡糖杆菌 Gluconobacter oxydans
  • 土壤杆菌属(Agrobacterium)
  • 假单胞杆菌属(Pseudomonas)
  • 无色杆菌属(Achromobacter)
  • 产碱杆菌属(Alcaligenes)
  • 气杆菌属(Aerobacter)
  • 固氮菌属(Azotobacter)
  • 根瘤菌属(Rhizobium)
  • 八叠球菌属(Sarcina)

第110页:细菌纤维素生产菌的特点

细菌纤维素生产菌的特点

不同细菌纤维素生产菌的纤维特点与作用
菌种名称产生纤维特点纤维素分析作用
Acetobacter胞外膜,纤维束X-射线衍射;碱不溶;荧光分析;可被纤维素酶降解保持有氧环境,可利用天然底物
Agrobacterium胞外微纤维X-射线衍射;碱不溶;荧光分析;可被纤维素酶降解吸附于植物组织
Rhizobium胞外微纤维X-射线衍射;碱不溶;荧光分析;可被纤维素酶降解吸附于寄主植物
Pseudomonas无明显微纤维碱不溶;可被纤维素酶降解废水中絮凝物
Sarcina无定形纤维素碱不溶不明确

第111页:细菌纤维素的性质

细菌纤维素的独特性质

  1. 高结晶度、高化学纯度
  2. 高抗张强度和弹性模量
  3. 很强的水结合性
  4. 极佳的形状维持能力
  5. 较高的生物适应性

第112页:细菌纤维素膜的形态

细菌纤维素膜的形态

  • 静态培养法:在发酵液表面形成乳白色半透明液膜。
  • 动态培养法:(1)机械搅拌罐通风培养:细菌纤维素呈丝状、微团状或星状;(2)气升式生化反应器培养:细菌纤维素呈微小椭圆状。

第113页:静置培养产生的纤维素膜

A. Xylinum X-2静置培养产生的细菌纤维素膜

第114页:细菌纤维素的网状结构

细菌纤维素的网状结构

  • 纤维素分子链间通过氢键交联形成的网状
  • 细菌纤维素微纤维或细纤维交织成特殊的空间网状结构

第115页:细菌纤维素的红外光谱

细菌纤维素与其他纤维素的红外光谱1、细菌纤维素;2、棉纤维;3、桑皮纤维;4、羧基纤维素

第116页:细菌纤维素的 X-射线衍射结果

X-射线衍射结果:原表给出 2Theta、d-value 与相对强度等数据,并与 Fontana 的文献值比较;样品预处理为蒸馏水洗涤后再经 0.1N NaOH 80℃ 处理 1 小时。

注:原表衍射数据列在源文件中数字粘连严重,无法安全切分还原,建议对照原课件图片核对。

第117页:固体 CP/MAS 13C NMR 谱

细菌纤维素的固体CP/MAS 13C NMR谱

第118页:X-射线衍射与 NMR 互补研究

X-射线衍射和CP/MAS 13C NMR 互补研究大分子聚合物的微观结构

第119页:细菌纤维素干膜的渗透性能

细菌纤维素干膜的渗透性能

细菌纤维素干膜与 PVC、PE 膜渗透性能比较
渗透性细菌纤维素干膜PVC 膜PE 膜
GTR(O2),ml/(atm·day·m2)49918202900
VTR(H2O),g/(m2·24h)180159.447.6

非极性气体 O2 难于透过干膜,而极性水蒸气易于透过;干膜结构致密且含大量极性基团。

第120页:细菌纤维素膜的持水性

细菌纤维素膜的持水性

第121页:细菌纤维素的生物合成过程

A. xylinum 细菌纤维素的生物合成

  1. 葡萄糖的胞内聚合
  2. 分泌
  3. 组装
  4. 结晶化

这四个过程高度耦合,并与细胞膜上的特定位点密切相关。

第122页:木醋杆菌的糖类代谢途径

木醋杆菌的糖类代谢途径

第123页:细菌纤维素合成的关键调控因子

细菌纤维素合成的关键调控因子C-Di-GMP(cyclic di-GMP,环状二鸟苷酸)纤维素合成酶的变构效应物

第124页:细菌纤维素合成的代谢调控

细菌纤维素合成的代谢调控

第125页:细菌纤维素合成酶

细菌纤维素合成酶

第126页:细菌纤维素合成酶(续一)

细菌纤维素合成酶

第127页:细菌纤维素合成酶(续二)

细菌纤维素合成酶

第128页:分泌、组装和结晶化过程

细菌纤维素的分泌、组装和结晶化纤维素分子链原细纤维微纤维细纤维

第129页:微纤维分叉的可能机制

微纤维分叉形成的可能机制

第130页:细菌纤维素膜表面菌体

细菌纤维素膜表面菌体

第131页:M12 菌株的显微照片

四、细菌纤维素发酵

  • M12菌株显微镜细胞照片

第132页:M12 菌株的形态特征

Gram阴性,杆状或椭圆形,专性好氧。菌落外观成圆形,不透明,突起,淡棕色及表面粗糙。

第133页:网状结构的纤维素丝束和菌体

网状结构的纤维素丝束和菌体

第134页:菌体表面特征性皱纹

菌体表面特征性皱纹沿菌体纵轴多股微纤丝汇集成一根纤维素丝束

第135页:静态发酵实验装置

细菌纤维素流加发酵培养实验装置细菌纤维素的静态发酵

第136页:分批与分批补料发酵的比较

分批补料发酵与分批发酵的比较

分批发酵与分批补料发酵生产细菌纤维素的比较
指标分批发酵分批补料发酵
细菌纤维素产量(g/L)3.4011.7
糖转化率(g·g-1)0.1240.138
发酵时间(d)820
发酵液残糖(g/L)3.703.81
反应器效率(g·L-1·d-1)0.4250.585

第137页:气升罐发酵生产装置

装置主要部件:

  1. 转子流量计
  2. 空气过滤器
  3. 膜过滤器
  4. 支架
  5. 恒温水浴
  6. 空气分布器
  7. 水夹套
  8. 升气筒

第138页:静态与气升罐发酵的结构比较

细菌纤维素扫描照片I 静态培养II气升罐培养The SEM photo of bacterial celluloseI Static culture II ALR culture静态(左)和气升罐(右)发酵生产的细菌纤维素微观结构比较I II

第139页:不同形式发酵的结果

不同形式发酵的结果

第140页:细菌纤维素合成的代谢流分析

细菌纤维素生物合成的代谢流分析

  • 代谢工程力图从细胞代谢网络的整个系统着手来研究代谢状况。其要解决的主要问题是改变某些途径中的碳架物质流量或者改变碳架物质流在不同途径中的流量分布。其目标是修饰初级代谢,将碳架物质流导入目的产物的载流途径以获得产物的最大转化率。因此建立完整的细胞代谢“球形”网络,有助于从整体上研究菌体的发酵过程。

第141页:基于物流平衡的 MFA

基于物流平衡的MFA及其理论基础

  • 基于物流平衡的MFA,不需要复杂的设备,相对比较简单,根据代谢路径中各生化反应的计量关系,通过测定细胞外代谢物及菌体组成来计算整个代谢网络的代谢流分布。该方法的基础是拟稳态假设:假设细胞内的中间代谢物均处于拟稳态,即其浓度变化速率为0。
  • 本文采用JosephJ.Vallino的方法[5],根据物流平衡计算代谢物的积累速率,有:

第142页:代谢网络的构建与简化

Acetobacter xylinum M12合成细菌纤维素的代谢网络的构建

  • 为了降低代谢网络的复杂性和减少代谢流量平衡方程,构建Acetabacterxylinum代谢网络时作了以下假设和简化:
  • (1)HMP途径和TCA循环中的异柠檬酸脱氢酶反应是产生NADPH的主要途径。产生的NADPH主要用于生物合成,而没有进入线粒体氧化;
  • (2)为减少代谢网络中的反应数目,将直线性反应(无代谢分支的反应)归为一个代谢库(Metabolicpool),例如:反应T3PPGP3PGPEP,可简化为T3PPEP,这样几个反应就简化为一个反应,从而减少了模型的复杂程度;
  • (3)对于相互转化的两种物质A和B(没有第三种物质参与)模型中用一种物质C表示,例如DHAP和G3P用T3P表示。
  • 由于6-磷酸果糖激酶(PFK)缺乏或PFK的活性很低,在构建代谢网络时忽略了F6P T3P的反应。

第143页:计量系数的确定原则

  • 确定计量系数时遵循以下原则:
  • (1)“反应为负,生成为正”的原则。以5-磷酸核糖为例(见图5-1),反应方程中5-磷酸核糖若作为反应物,则其系数为负;若5-磷酸核糖作为生成物,则其系数为正;若无5-磷酸核糖则其系数为零。
  • (2)“1 C-mol为基准”的原则。含碳化合物计量系数的代数值是以1 C-mol通量为基准确定的。例如在r8中,虽然1mol F6P生成2mol T3P,但碳通量未变,因此在该反应中F6P的系数为-1,T3P的系数则为+1。

第144页:拟稳态假设与自由度分析

  • 采用MFA计算代谢通量,必须对系统作拟稳态假设,即假设胞内中间代谢产物均处于拟稳态,考虑到中间代谢物的过渡态相对于菌体生长速率和宏观操作条件的变化更为迅速,相对于菌体生长和发酵过程的过渡态而言,胞内中间物质的量相对不变,其累积速率为零。即
  • Ar=0 5-5
  • 可以看出,矩阵中未知数为28,方程数为24,方程自由度为4,即需测定4个速率方程可确定代谢网络中的流量分布。在发酵过程中,底物和产物这些与环境有交换的物质,它们的消耗或积累速率可以通过胞外在线或离线方法测量得到,将其对时间微分即可求得各物质的代谢速率。将该速率作为已知参量,代入上述代谢流平衡模型即可求得代谢流分布。

第145页:细菌纤维素的代谢流分布

细菌纤维素生物合成的代谢流分布

第146页:发酵前期的代谢流分析

代谢流分析

  • 第一阶段,发酵前期(0-4天)菌体和细菌纤维素的大量合成时期,菌体的代谢流r28为15.60,生成细菌纤维素的代谢流r20为18.30,菌体生长需要大量核酸、蛋白质、脂肪、一些小分子中间代谢物、还原力NADPH和主要由TCA循环提供的NADH及FADH2,此时的细菌纤维素的生物合成的速度也较快。表明细菌纤维素的生物合成与菌体的生长密切相关,但菌体的生长也是以消耗葡萄糖为前提的。因此,提高细菌纤维素产率的同时必须考虑菌株的生长。此结论与AtsushiIshikawa[6]的研究报道相同。如何控制r2和r20的比值,即既能满足菌体大量生长所需要的能量、还原力、核酸、蛋白质、脂肪和一些小分子中间代谢物,又能有较多的G6P流向细菌纤维素的合成是今后要探讨的重要问题。

第147页:发酵后期的代谢流迁移

  • 第二阶段,发酵后期(4-8天)菌体生长减慢,同时细菌纤维素的合成速度也减慢。菌体的代谢流r28为1.90,生成细菌纤维素的代谢流r20为7.50。此时已发生代谢流迁移现象即代谢流重新分配,碳架被逐渐导向一些副产物的合成,例如AC的代谢流r11前期是0.73,后期是7.50。因此如能从遗传角度和发酵控制方面使副产物的生成减少,就能达到代谢流迁移的目的,从而增大合成细菌纤维素的代谢流。HMP循环r2(208.09)也大于发酵前期代谢流分配(183.55),有关TCA循环的代谢流r13~r18都大于发酵前期的代谢流,这样通过HMP循环和TCA循环产生的能量可能有大量的无效循环,具体的能量产生途径通量分布有待进一步研究和探讨。

第148页:G6P 节点流量分析

BC发酵前期G6P节点流量分析

第149页:细菌纤维素的应用领域

细菌纤维素已商品化或广泛使用的领域

  • 音响振动材料(SONY、AJINOMOTO 等)
  • 生物肠衣和临时皮肤替代物(商品名 Cellulon)
  • 纺织品的强化纤维
  • 高级功能纸张的添加剂
  • 食品工业,如低卡路里膨胀剂、稳定剂与新型发酵饮料

第150页:在造纸工业中的应用

在造纸工业中的应用随着对细菌纤维素的深入研究,细菌纤维素在特种纸或功能纸中应用成为研究热点。从已开展的应用工作来看,不必采用特殊的添加方法,就可开发出简单的细菌纤维素添料纸。

第151页:纸张强度性能测定项目

造纸实验纸张强度性能测定

  • 定量
  • 抗张强度,裂断长
  • 撕裂度
  • 耐破度
  • 透气度

第152页:细菌纤维素湿膜的打浆分散

细菌纤维素湿膜的打浆分散打浆使细菌纤维受到切断,吸水润胀和细纤维化等作用

第153页:分散的单根细菌纤维

分散的单根细菌纤维细菌纤维的显微照片细菌纤维断裂状态的显微照片

第154页:苇浆配加细菌纤维素抄纸

苇浆配加细菌纤维素,抄纸苇浆配加细菌纤维素,抄纸

第155页:苇浆配加对纸张强度的影响

苇浆配加细菌纤维素对纸张强度的影响

苇浆配加细菌纤维素后的纸张强度性能
纸样BC 添加比例(%)定量(g/m2)裂断长(m)耐破指数(kPa·m2/g)撕裂指数(mN·m2/g)透气度(ml/min)
A0036.643701.23.8—
A2237.951001.33.9177
A101038.548501.34.0111
A404042.656301.94.265

第156页:苇木混合浆配加细菌纤维素

苇木混合浆(9
1)配加细菌纤维素,抄纸

第157页:苇木混合浆配加对强度的影响

苇木混合浆(9:1)配加细菌纤维素对强度的影响

苇木混合浆配加细菌纤维素后的纸张强度性能
纸样BC 添加比例(%)定量(g/m2)裂断长(m)耐破指数(kPa·m2/g)撕裂指数(mN·m2/g)透气度(ml/min)
B0043.545401.44.7—
B5544.643901.35.2—
B101043.948901.44.7364
B151543.642001.44.6273
B202045.148801.64.9240

第158页:苇浆中配加木浆与细菌纤维

苇浆中分别配加(10%)木浆和细菌纤维对纸张强度的影响

第159页:细菌纤维对苇浆强度的影响

细菌纤维对苇浆纸张强度的影响

  • 细菌纤维素的微纤维交织成特殊网状结构,表面积大,增加氢键作用位点,增大纤维间结合力
  • 细菌纤维本身有较大的强度

第160页:纤维内与纤维间的氢键

纤维内与纤维间的氢键纸张强度首先取决于纤维相互间的结合力和纤维本身的强度。细菌纤维素的微纤维交织成特殊的网状结构,有较大表面积,增加氢键作用位点,增大纤维间的结合力,提高纸张的抗张强度。

第161页:在医学材料中的应用

在医学材料中的应用改良细菌纤维素物理化学性质、机械性能和生物医学的测试结果表明它具有一些良好的独特性质,如生物活性(bioactivity)、生物可降解性、生物适应性和无过敏反应,尤其是良好的机械韧性,有可能作为新型的生物医学材料。

第162页:实验动物 SD 大鼠

实验动物SD大鼠细菌纤维素对深Ⅱ度烧伤大鼠皮肤治疗作用的实验研究

第163页:烧伤大鼠伤口愈合率

大鼠伤后不同时间伤口愈合率(深Ⅱ度烧伤)

细菌纤维素对深Ⅱ度烧伤大鼠伤口愈合率的影响
组别4 d7 d14 d21 d28 d
对照组2.63±1.823.83±1.8415.28±6.3340.96±5.4294.67±2.02
治疗组2.32±1.734.17±2.2114.54±5.8550.60±4.3896.35±1.89

第164页:烧伤治疗作用的实验研究

细菌纤维素对大鼠皮肤创伤促愈作用的实验研究细菌纤维素膜对深Ⅱ度烧伤大鼠皮肤治疗作用的实验研究,发现其对深Ⅱ度烧伤促进愈合作用不显著,与文献报道不符,分析其原因,可能是所用烧伤动物模型更适于暴露疗法,创面局部有焦痂组织阻碍细菌纤维素与创面直接接触,影响发挥作用有关。为此,本实验拟采用缺损性皮肤创伤的动物模型做进一步的探讨。

第165页:创伤动物模型

创伤动物模型

第166页:创伤大鼠伤口愈合率

大鼠伤后不同时间伤口愈合率(皮肤缺损模型)

细菌纤维素对皮肤缺损大鼠伤口愈合率的影响
组别4 d7 d14 d21 d28 d
对照组5.63±1.6411.83±1.9455.28±6.6378.73±6.2493.67±6.33
治疗组5.32±1.8216.17±2.1470.54±6.3592.60±5.62100.00±0.00

第167页:皮下埋植实验研究

皮下埋植细菌纤维素膜的实验研究以上实验表明细菌纤维素膜能促进皮肤损伤的愈合,具有一定的治疗作用,有可能成为一种临时皮肤代用品和有应用潜力的生物敷料。随着组织工程学的逐渐兴起,有必要探讨细菌纤维素膜作为皮肤组织工程材料——人工真皮的可能性。

第168页:埋植细菌纤维素的动物模型

埋植细菌纤维素膜的动物模型

第169页:医学应用小结

小结

  • 细菌纤维素膜在一定程度上具有促进烧伤伤口愈合的作用,各观察时点病理损害与愈合程度无明显差异
  • 组织学切片显示细菌纤维素膜可允许成纤维细胞和毛细血管逐渐长入
  • 细菌纤维素膜异物反应差,有利于血管和细胞长入,有可能成为皮肤组织工程材料

第170页:在食品工业中的应用

在食品工业中的应用细菌纤维素具有很强的亲水性、持水性、凝胶特性、稳定性及完全不被人体消化的特点,使之成为一种很具吸引力的食品基料,可作为增稠剂应用于食品工业中,也可作为固体食品的成型剂、分散剂和结合剂等。红茶菌是以茶叶浸出液通过发酵制成的一种保健饮料。在培养红茶菌的过程中,在汁液的表面形成一层胶状液膜,其主要成分是细菌纤维素。纳塔是一种由微生物经液态发酵形成于液体表面的凝胶膜状物,主要成分是纤维素。

第171页:在音响振动膜上的应用

在高级音响设备振动膜上的应用细菌纤维素高纯度(100%)、高结晶度、高聚合度和优良的分子取向,高机械强度、经热压处理后,杨氏模数可达30Gpa,比有机合成纤维的强度高4倍,可满足当今顶级音响设备声音振动膜材料所需的对声音振动传递快和内耗高的特性要求。细菌纤维素振动膜的优异特性主要是其极细的高纯度纤维素组成的超密结构,经热压处理制成了具有层状结构的膜,使其杨氏模量和机械强度大幅度提高。

第172页:有待研究的问题(一)

有待研究的问题 1:基因改造与表型或产物分泌状态的研究

  • 通过基因改造,分析基因与表型或产物分泌状态之关系
  • 通过基因与代谢调控研究,建立细菌纤维素生物合成模型

第173页:有待研究的问题(二)

有待研究的问题 2:细胞水平的代谢调节特性研究

  • 采用恒化器培养技术,建立不同基质和条件的发酵动力学模型
  • 以恒化器培养方法和图像技术,研究基质与操作条件同菌体形态、产物形态的关系
  • 以代谢分布与产物分泌特征为主要内容的代谢特性研究

第174页:有待研究的问题(三)

有待研究的问题 3:生物反应器多水平参数的关联与优化

  • 静态与动态发酵过程及其产物性能比较
  • 宏观参数与微观参数的关联模型

第175页:8.5 双液相生物反应进展

8.5 双液相生物反应进展8.5.1 双液相酶促反应的进展8.5.2 双液相发酵的进展

第176页:神经网络实验内容目录

神经网络技术在发酵过程中的应用实验

  1. 实验目的
  2. 实验原理
  3. 实验装置与流程
  4. 实验步骤及方法

第177页:测控系统总貌

图3.1-5 测控系统总貌

第178页:神经网络实验目的

一实验目的学习神经网络的基本原理,学会MATLAB神经网络应用设计,掌握神经网络技术在发酵过程建模中的应用。

第179页:神经网络实验原理

二实验原理与经典的非结构动力学模型相比(1)神经网络的基本原理(2)MATLAB神经网络应用设计(3)建模过程中的几个关键问题

第180页:主监控界面

图3.1-5 主监控界面

第181页:聚赖氨酸发酵建模内容

研究内容之三3.3 聚赖氨酸发酵过程的建模与优化3.3.1聚赖氨酸发酵过程的建模方法3.3.2基于三底物限制的聚赖氨酸发酵过程解析式软测量模型3.3.3聚赖氨酸发酵过程的神经网络模型3.3.4聚赖氨酸发酵过程操作变量的优化控制3.3.5小结

第182页:聚赖氨酸发酵建模引论

引论

  • 研究5升发酵罐聚赖氨酸分批发酵过程建模和优化控制问题。建立了受基质糖浓度、浓氧浓度DO、pH三底物限制的解析式软测量模型,以及基于神经网络的软测量模型和预估模型,讨论了根据DO及其变化量以及生物参数的估计实时控制pH设定值的优化控制策略。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第183页:聚赖氨酸发酵的建模方法

3.3.1 聚赖氨酸发酵过程的建模方法

  • ①建模的目的
  • ②解析式软测量模型建模方法
  • ③BP神经网络模型建模方法聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第184页:建模的目的与数据来源

建模的目的

  • 聚赖氨酸发酵过程建模的目的:一是为了深入了解聚赖氨酸发酵机理,实现操作变量的实时优化控制,提高聚赖氨酸发酵水平;二是为了实现发酵状态预估,提高实验的成功率。
  • 数据来源5升发酵罐9批聚赖氨酸分批发酵实验数据,其中6批用于模型训练,3批用于模型验证。采用不同的方法建了两类模型即解析式软测量模型和神经网络模型,其中神经网络模型有3种即软测量、预估和混合预估模型。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第185页:解析式软测量模型建模方法

解析式软测量模型建模方法

  • 解析式软测量模型通过多元非线性回归分析方法,以实验现象、实验数据、发酵机理为基础,采用了三底物限制的Monod方程结构,建立了由在线可测参数DO、pH、搅拌速率以及初始糖浓度对残糖、菌体和产物浓度进行估计并受基质糖浓度DO、pH三底物限制的解析式方程。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第186页:BP 神经网络模型建模方法

BP神经网络模型建模方法

  • 人工神经网络(简称BP神经网络)模型是通过一组网络权值w和阀值b矩阵来描述输入与输出的关系。网络的计算输出为残糖、菌体和产物浓度K时刻的估计值,网络的输入是在线可测参数或K-1时刻的化验参数,根据输入是否包含化验参数分为神经网络软测量模型和预估模型。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第187页:BP 神经网络结构图

图3.3-1 BP神经网络结构图

第188页:BP 神经网络建模优点

BP神经网络模型建模优点

  • 一是模型容量大,在合理的选择隐层神经元个数前提下,参与训练的样本数可以到几十个批次甚至几百个批次的发酵数据;二是无需发酵机理知识,只要模型所含各种发酵条件下的样本数足够多,就能够达到较满意的验证效果。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第189页:BP 神经网络建模缺点

BP神经网络模型建模缺点

  • 发酵过程是一个时序过程有很强的滞后,K时刻的发酵状态不仅取决于K时刻的发酵条件,而且与K时刻之前的发酵条件有关,相比之下解析式模型较容易描述一个时序过程,而神经网络模型却难以描述。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第190页:混合神经网络模型建模

混合神经网络模型建模

  • 神经网络混合预估模型的输入不仅含有在线可测参数和K-1时刻的离线化验数据,而且运用了被解析式模型验证了的简单的且具有一般性的机理知识。比如DO的消耗量(100-DO)对时间的积分值是解析式软测量模型估计残糖浓度的重要多项式,可以把它作为一个输入数据用于神经网络混合预估模型。当训练样本数较少时可采用混合预估模型。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第191页:三底物限制软测量模型

3.3.2 基于三底物限制的聚赖氨酸发酵过程解析式软测量模型

  • ①发酵条件和实验数据
  • ②基于基质糖浓度DO、pH三底物限制的
  • 聚赖氨酸分批发酵解析式软测量模型
  • ③结果讨论聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第192页:解析式模型的发酵条件

发酵条件和实验数据

  • 发酵条件的相同部分是:5升罐装液量2500ml,通风量1.0VVM,温度30度,不流加。各批发酵整个发酵过程通风量和搅拌速率保持不变。
  • 在线测量数据有pH、DO,离线化验数据有残糖浓度S、菌体浓度X、产物浓度P,估计值包括残糖浓度估计值Sg、菌体浓度估计值Xg、产物浓度估计值Pg。发酵时间单位为小时。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第193页:残糖浓度估计软测量模型

基于基质糖浓度DO、pH三底物限制的聚赖氨酸分批发酵解析式软测量模型

  • 残糖浓度估计软测量模型:

第194页:菌体浓度估计软测量模型

基于基质糖浓度DO、pH三底物限制的聚赖氨酸分批发酵解析式软测量模型

  • 菌体浓度估计软测量模型:

第195页:产物浓度估计软测量模型

基于基质糖浓度DO、pH三底物限制的聚赖氨酸分批发酵解析式软测量模型

  • 产物浓度估计软测量模型:

第196页:聚赖氨酸神经网络模型

3.3.3 聚赖氨酸发酵过程的神经网络模型

  • ①发酵条件和样本数据
  • ②聚赖氨酸发酵过程的BP神经网
  • 络软测量模型
  • ③聚赖氨酸发酵过程的BP神经网
  • 络预估模型
  • ④聚赖氨酸发酵过程的BP神经网
  • 络混合预估模型聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第197页:神经网络模型的发酵条件

发酵条件和实验数据

  • 聚赖氨酸分批发酵条件的相同部分是:5升罐装液量2500ml,通风量1.0VVM,温度30度,不流加。各批发酵搅拌速率和pH控制方式不同,每批发酵整个发酵过程通风量和搅拌速率保持不变。在线测量数据有pH、DO,离线化验数据有残糖浓度S、菌体浓度X、产物浓度P。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第198页:BP 神经网络软测量模型

聚赖氨酸发酵过程的BP神经网络软测量模型

  • 输入层、隐层、输出层节点数:[7,12,1];学习次数:120万次;学习速率=0.1。
  • 模型输入:u=[t;pH;DO;pH_1;DO_1;DO_2;VV]T
  • 模型输出:残糖模型输出为K时刻的残糖估计值,菌体模型输出为K时刻的菌体估计值,产物模型输出为K时刻的产物估计值。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第199页:软测量模型训练结果

软测量模型训练结果图3.3-6聚发酵(1)200rpm、pH不控制,S、X估计值与化验值的比较图3.3-7聚发酵(5)350rpm、pH=3.0,S、P估计值与化验值的比较图3.3-8聚发酵(7)350rpm、pH=5.0,S、P估计值与化验值的比较训练误差以平均绝对误差表示,残糖模型训练误差:0.0894;菌体模型训练误差:0.1308;产物模型训练误差:0.0292 。

第200页:软测量模型验证结果

软测量模型验证结果图3.3-10验证样本聚发酵(9)350rpm、pH=4.3,S、X估计与化验值的比较图3.3-9验证样本聚发酵(3)400rpm、pH不控制,S、P估计与化验值的比较聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第201页:BP 神经网络预估模型

聚赖氨酸发酵过程的BP神经网络预估模型

  • 输入层、隐层、输出层节点数:[7,9,1];学习次数:40万次;学习速率=0.1。
  • 模型输入:u=[t;X;S;P]T,分别为K时刻的发酵时间/h、菌体/g/L、残糖/%、产物浓度/g/L的离线化验值。
  • 模型输出:残糖模型输出为K+1时刻的残糖预估值,菌体模型输出为K+1时刻的菌体预估值,产物模型输出为K+1时刻的产物预估值。聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第202页:产物预估模型的权值矩阵

产物预估模型网络权值w和阀值b矩阵:

  • w1=[15.4301-9.7348-9.6851-6.8395;
  • -12.131911.1584-3.318720.0512;
  • 2.15603.08676.3794-27.6267;
  • -1.01053.671214.4534-22.3611;
  • 14.51188.7028-2.9942-18.2467;
  • 8.666010.192612.3773-14.1977;
  • -1.21038.9406-18.15276.9004;]
  • b1=[3.8587-6.0954-0.7781-0.0070-2.7965-3.65671.5770]T
  • w2=[-0.75664.18240.01202.5747-2.21312.77142.9456;
  • 3.17570.0784-3.35461.14573.07724.0187-3.2244;
  • 0.45852.73462.33364.58531.15291.4877-4.7418;
  • -3.1666-1.1154-0.09282.9087-1.91954.61684.4771;
  • 2.6088-2.16184.6633-2.60381.5733-2.8485-2.4579;
  • 4.4859-2.81011.5424-2.58140.96744.0893-1.1927;]
  • -5.4354-2.95952.4507-1.9734-1.3888-2.58032.1266;
  • 3.04423.0284-0.02440.61043.2412-4.1049-3.6341;
  • -0.7520-2.24014.81332.31641.80144.89460.1972;]

第203页:产物预估模型的权值矩阵(续)

产物预估模型网络权值w和阀值b矩阵:

  • b2 =[ -9.8405 1.0416 -0.1276 -1.9416 2.5993 -3.9141 5.6993 -3.1275 3.5269 ]T
  • w3 =[ 2.1935 1.1953 0.6118 -2.5236 -2.8946 2.7429 1.3801 -0.4913 -1.4565 ]
  • b3 = -0.1557聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第204页:预估模型验证结果

预估模型验证结果图3.3-11验证样本聚发酵(3)400rpm、pH不控制,S、P预估与化验值的比较图3.3-12验证样本聚发酵(9)350rpm、pH=4.3,S、X预估与化验值的比较

第205页:BP 神经网络混合预估模型

聚赖氨酸发酵过程的BP神经网络混合预估模型

  • 输入层、隐层、输出层节点数:[11,15,1];学习次数:80万次;学习速率=0.1。
  • 模型输入:u=[ t;pH;DO;pH_1;DO_1;DO_2;VV;EDO;X;S;P]T,X、S、P分别为K时刻菌体/g/L、残糖/%、产物浓度/g/L的离线化验值。EDO=Σ(100-DOi);其中i=0,1,2 ...,K 。
  • 模型输出:残糖模型输出为K+1时刻的残糖预估值,菌体模型输出为K+1时刻的菌体预估值,产物模型输出为K+1时刻的产物预估值。

第206页:混合预估模型训练结果

混合预估模型训练结果图3.3-13训练样本聚发酵(6)350rpm、pH=4.0,S、X、P预估与化验值的比较

第207页:混合预估模型验证结果

混合预估模型验证结果图3.3-14训练样本聚发酵(9)350rpm、pH=4.3,S、X、P预估与化验值的比较

第208页:聚赖氨酸发酵的优化控制

3.3.4 聚赖氨酸发酵过程的优化控制

  • ①pH对聚赖氨酸发酵过程的影响
  • ②聚赖氨酸发酵过程pH的优化控制聚赖氨酸发酵过程的建模与优化

第209页:本章结束致谢页

谢谢大家

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