页数:142页文件大小:8.82 MB来源: 食品生物化学ppt课件
本课件从酶的发现史与概念入手,说明酶催化高效、专一、需温和条件等特点及其化学本质,讲解活性中心、酶原激活与同工酶;随后进入酶促动力学,推导米氏方程并分析底物浓度、pH、温度、抑制剂的影响,介绍别构调节与共价修饰,最后把辅酶与水溶性维生素对应起来。
第三章酶
酶-enzyme希腊语原意:in yeast生命体内催化化学反应的物质细胞中大部分球蛋白为酶
| 年份 | 事件与成果 |
|---|---|
| 1783 | Spallamzan发现鸟的胃液能消化肉 |
| 1826 | Mitscherlich提倡水溶性酵素为"unorganizedferment" |
| 1830 | Kuhle开始使用Enzyme这一术语 |
| 1835 | Berzelius提出ferment起的是催化作用 |
| 年份 | 事件与成果 |
|---|---|
| 1857 | Pasteur认为发酵分几个阶段进行, 每一步都有特定的酶参与, 但酶只在活体细胞中才能起作用 |
| 1894 | Bertrand发现了水解酶以外的酶 |
| 1897 | Buchner兄弟以"没有酵母的酒精发酵" 证明了酶可以离开细胞起作用 |
| 1913 | 米氏方程建立 |
| 1936 | 微生素与辅酶的关系的解明】 |
| 1940 | F.Lipmann解明高能磷酸化合物的生理意义】 |
| 1959 | Sutherland cAMP的发现----→酶与激素的关系 |
| 1970 | Restriction enzyme的发现-----→基因工程 |
本章内容:Ⅰ、酶的导论Ⅱ 、酶促动力学Ⅲ、酶学发展及动向Ⅳ 、辅酶与水溶性维生素
Ⅰ、酶的导论一、酶的感念二、酶催化作用的特点三、酶的化学本质及组成四、酶的命名与分类五、酶的活性中心六、酶活性
一、酶的概念:酶是活细胞产生的,具有催化生化反应功能的蛋白质大分子及核酸。一、酶的概念
二、酶催化作用特点:与一般化学催化剂相比,其共性有:1、用量少而催化效率高;2、不改变化学反应的平衡点;3、可降低反应的活化能:
活化能在一定温度下1mol 底物全部进入活化态所需要的自由能。一、酶的概念
胰蛋白酶的基团专一性二、酶催化作用特点乳酸脱氢酶的光学
消化道几种蛋白酶的
三种Ser蛋白酶的专一性糜蛋白酶Phe、Tyr和Trp等有疏水侧链aa;弹性蛋白酶:Ala等小的有疏水侧链aa;胰蛋白酶:Lys或Arg。
键专一性相对专一性结构专一性基团专一性绝对专一性立体异构专一性专一性二、酶催化作用特点酶的
(五)、有些酶的活性与辅酶、辅基及金属离子有关。若除去,酶失活
三、酶的化学本质及分类(一)、酶的化学本质:1、大多数酶是蛋白质:有空间结构;两性性质;胶体性质;变性失活;可被蛋白酶分解;结晶;测序。2、某些RNA具有催化活性,将本质为RNA 的酶称核酶(ribozymes)。
(二)按酶的分子特点分类:1、单体酶:一条肽链构成。(水解酶:蛋白酶、淀粉酶)2、寡聚酶:几到几十个亚基(相同或不同)组成。(糖代谢酶)3、多酶体系:几种酶彼此嵌合的复合体,有利于一系列反应连续进行。(脂肪酸合成酶复合体)
(三)、根据酶的组成分类:1、单纯酶(简单蛋白质):其活性仅取决于其蛋白质结构。如:蛋白酶、淀粉酶等。
辅因子(按与酶的结合程度分)辅酶(coenzyme):结合较松,可透析去除;辅基(prosthetic grup):结合较紧,透析不易除去。酶蛋白——负责专一性;辅因子——负责电子、原子或基团转移。同一辅因子可与多种不同酶蛋白结合,显示不同催化活性。
甘油醛-3-磷酸脱氢酶的结构域和辅酶
惯用名系统名谷丙转氨酶丙氨酸 α-酮戊二酸氨基转移酶催化反应Ala+α-酮戊二酸→ Glu+丙酮酸
(二)酶的分类国际酶学委员会根据酶催化反应的类型分类:1 、氧化还原酶2、转移酶3、水解酶4、裂解酶5、异构酶6、合成酶
氧化还原酶转移酶水解酶裂解酶异构酶合成酶反应式AH2 +BA+BH2AR+BA+BRAB+H2OAH+BoHABA+BABA+B+ATPAB+ADP+Pi
(三)酶的编号EC 为Enzyme Commision 酶学委员会缩写四、酶的命名与分类乳酸脱氢酶的编号:EC 1.1.1.27
五、酶的活性中心(active center)(一)概念:活性中心:酶分子中能同底物结合并起催化作用的空间部位
活性中心的实质活性中心即酶分子中在三维结构上相互靠近的几个aa残基或其上的某些基团。活性中心以外的部分对酶催化次要,但对活性中心形成提供结构基础
(二)活性中心的功能部位:1、结合部位:酶分子上与底物结合的部位。2、催化部位:底物在此发生一定的化学变化。酶促反应机理羧肽酶的活性中心
(三)活性中心的特点:1、仅为酶体积的很小部分;2、具有一定的空间构象;3、S与E靠次级键结合;4、是由特定空间构象维持的一个裂隙。酶促反应机理溶菌酶活性中心
(四)研究酶活性中心的方法:1、通过研究专一性底物判断确定E活性中心的结构;2、用化学修饰法共价修饰E分子的一些功能基团,以查出哪些基团是活性必需的;3、X-衍射直接探明活性中心
六、酶活性(enzyme activity):(一)概念:酶活性(酶活力):指酶催化一定化学反应的能力。用酶所催化的某一化学反应速度的快慢来表示酶的含量和存在
(二)表示方法:1、酶活力单位(active unit, U,IU):特定条件下(25 ℃ ,最适底物浓度,最适缓冲液离子强度,最适PH),在1分钟内能转化1微摩尔底物的酶量。2、酶的转换数(katal,kat):在最适条件下(30 ℃ )每秒钟1个酶分子转换底物的分子数。1 kat = 6×107IU
(三)、测试酶活性的方法:化学滴定法比色法旋光率气体测定
一、酶与底物间的作用(一)问题提出:1、酶如何使反应活化能降低?
2、如何解释[S]与v曲线?
(二)中间产物学说:1、学说认为:当酶催化一化学反应时,首先E和S结合形成中间产物ES,然后它再分解成产物P并释放酶E。S + E→ ES → E + P
2、中间产物1)中间产物比底物需较少的活化能就可分解成产物并放出酶。2)[ES] 决定酶促反应速度。3)中间产物形成的实验依据:电镜直接观察;吸收光谱变化证明
羧肽酶A的结构由于结合了底物而改变A未结合底物B:E-S中间复合物酶促反应机理
(三)过渡态互补:Pauling提出过渡态理论认为:E与S的过渡态互补,亲和力最强,释放的结合能使反应活化能降低,有利于S 跨越能垒,使反应加速。证明:①人工合成了过渡态类似物;②用过渡态类似物制备出抗体酶
抗体酶中间产物类似物免疫动物抗体此抗体具1)加快反应速度102-105倍;2)具酶性质:专一性、催化活性、酶动力学行为均符合;抗体酶前景:可用于研究、肿瘤治疗。
二、米氏方程Michaelis & Menten根据中间产物学说推导出表示酶促反应中底物浓度与反应速度关系的公式称~。米氏方程:Km+ [S]V [S]υ=
(一)米氏方程的推导:根据中间产物学说:式中K1,K2,K3分别为各反应常数,可知:ES形成速度= K1 [E] [S]ES分解速度=(K2,+ K3) [ES]当反应达恒稳态时,二速度相等,即:K1 [E] [S] =(K2,+ K3) [ES]S + E→ ES → E + PK1K2K3①
整理并令由于[E] 与[ES]之和为总的酶浓度[Et] ,即:[Et]= [E] +[ES][E] = [Et]-[ES]将③代入②:[ES]K1==[E] (K2,+ K3)Km②③[ES]=([Et]-[ES])[S].Km
整理得∵酶促反应速度由[ES]决定,而υ= K3[ES]∴[ES]=将⑤代入④整理得:[ES]=[Et].[S]Km+[S]④υK3⑤=[Et].[S]Km+[S]υK3.⑥
此时达到最大反应速度VmaxVmax= K3 [Et] ⑦将⑦代入⑥,得米氏方程:⑧当[S]升高,所有E为S所饱和时,即:[Et] =[ES]=.[S]Km+[S]υVmax
(二)米氏方程的变化:1、Km>>[S] 时:υ=V[S]/Km初速度与[S]成正比的一级反应。2、若[S]>>Km时:υ=V 零级反应3、若[S] = Km时:υ=1/2V酶反应速度与[S]的关系Km+ [S]Vmax[S]υ=
(三)米氏常数Km的意义1、概念:反应速度为最大反应速度一半时的底物浓度。2、单位:mol/L 或mmol/L3、意义:①Km是酶的特征性物理常数。只与E性质有关,与[E]无关;测Km可鉴别酶。②在一定条件下某酶对某一底物有一定的Km值。因此,测某酶的Km数值,可鉴别酶。
③同一E有几个S就有几个Km,Km最小的为最适S或天然S。④Km大,E与S亲和力弱;Km小,E与S亲和力强。4、实际用途:1)可由所要求的V求[S];例:求反应速度达最大反应速度99%时的底物浓度:2)根据已知[S]求该反应V。99%V=V[S]Km+[S]=[S]99Km
(四)测米氏常数及Vmax的方法:将米氏方程两侧取倒数,以1/υ对1/[S]作图得直线,得Lineweaver-Burk方程:Lineweaver-Burk作图法(双倒数作图法)Km求法:量截距:1/ [S]轴的截距为-1/ Km ;1/v轴的截距为1/ Vmax。
三、影响酶促反应的各种因素除[E]、[S]外,外界因素:温度、pH、激活剂、抑制剂影响酶促反应的强度和方向。
2、酶促反应最适温度:酶促反应速度达到最大时的温度。因E种、E源、作用时间不同而异。3、温度影响酶促反应的机理:1)低于最适温度:反应速度随温度上升而加快;Q10(反应的温度系数)多为1~2。2)高于最适温度:E蛋白随温度上升而变性失活。
2、pH影响的机理:1)pH影响E活性中心及附近有关基团的解离,使之易或不易与S 结合;2)pH影响S的极性基团,从而影响这些基团与E的结合;3)过酸、过碱可使酶变性失活。
(三)激活剂1、概念:凡能提高酶活力的物质称激活剂。2、种类:1)无机离子的激活作用:作为活性部位的组分;作为辅助因子的组分;由无机离子与E、S或ES结合引起。如:Mg2+、Ca2+、Co2+、Mn2+、Cl-等
2)中等大小的有机分子:包括还原剂(使二硫键还原)、EDTA(去除重金属杂质)等。3)蛋白质类大分子物质:激活酶原、解除抑制剂的抑制作用。如:pr与重金属离子结合,解除抑制剂的抑制
酶的激活与抑制
①竞争性抑制:I 在分子结构上与S类似,I与S竞争性与E结合,使酶促反应速度下降。但,若[S]高,则此效应减小
反应通式特点:I与S结构类似;抑制程度取决于[I]和[S]以及与E的亲和力;可通过增加[S]来减轻或解除抑制。
Lineweaver-Burk作图Vmax不变,Km增加。
②非竞争性抑制:S与I可同时结合在酶的不同部位上,形成无活性的EI、ESI,因此酶活性降低。此类I 与E活性中心以外的基团结合,其结构可能与S无关
Vmax减小Km不变。Lineweaver-Burk作图
①反竞争性抑制:I不能与游离酶在活性中心结合,只与ES结合成ESI。I不与S竞争酶分子的活性中心,但形成的ESI不能转变为产物。反竞争抑制的通式
Lineweaver-Burk作图Vmax减小,Km减小。
四、酶作用机理(一)锁钥学说:1894年E.Fischer 提出:S分子或其一部分像钥匙一样楔入E活性中心部位。此学说强调E与S结构互相吻合(刚性模板)。酶作用机理
(二)诱导契合学说1958年Koshland 提出:当E与S接近时,E蛋白受S分子的诱导,其构象发生有利于S结合的变化,E与S在此基础上互补契合、进行反应。酶作用机理
(三)使酶具高催化效率的因素:①邻近定向效应:S分子向E活性中心靠近,且趋向E催化部位,使活性中心这一局部区域[S]增加,并使S分子发生扭曲,易于断裂,降低反应所需活化能。从而加快反应速度。
③酸碱催化:指E分子上某些基团作为质子供体和质子受体对S进行(广义的)酸碱催化。1、醛的水合作用2、肽的水解作用
④共价催化:E分子中的亲核基团提供电子,对S中亲电子的碳原子进行攻击,生成ES使反应活化能降低,S可越过较低的能垒而形成产物。⑤酶活性中心是低介电区域:可排除高极性的水分子,使S的敏感键与E的催化基团有高反应力,从而加速反应。
五、酶活性的调节(一)酶原激活(二)变构酶(三)酶的共价修饰
(一)酶原的激活:1、概念:酶原(proenzyme):没有催化活性的酶的前体(precursor)。酶原激活(活化):从不具活性的酶原转变为有活性的酶的过程。其实质是一个或一些专一的肽被裂解,使酶活性中心形成或暴露的过程。如:胃蛋白酶原胃蛋白酶+ 42肽HCl酶活性的调节
胰蛋白酶原激活胰蛋白酶原胰蛋白酶+ 6肽肠激酶酶活性的调节
糜蛋白酶原的激活酶活性的调节
(二)变构酶(allosteric enzymes):1、概念:亦称别构酶,是一类重要的调节酶。一般为寡聚酶(两个以上亚基组成),易发生构象改变。其上有二个重要部位:活性部位和别构部位Asp转氨甲酰酶
别构酶结构的部位1)活性部位:负责E对S的结合与催化;2)别构部位:可结合调节物,负责调节酶反应速度。这两部位可在不同亚基或同一亚基不同部位上
2、别构效应:1)概念:当S或S以外的物质与E的别构部位非共价结合后,通过E分子构象的变化影响E催化活性的效应称~
别构酶通常为代谢途径第一个酶或分支点上第一个酶。
3、别构酶动力学曲线:大多数别构酶不符合米氏方程。1、非调节酶曲线2、正协同别构酶3、负协同别构酶曲线2中[S]的变化所引起的速度变化的反应几乎是“全”或“无”
(三)诱导酶与结构酶结构酶:指细胞内固有酶类,无需S存在,含量稳定,受外界影响小。诱导酶:加入特定诱导物后细胞才能产生的酶。其含量受诱导物存在而提高。诱导物:多为S、P或其结构类似物。五、酶活性的调节
一、酶的分离纯化(一)目的:1、为了研究酶的理化性质或鉴定酶;2、作为生化试剂或药物。(二)根据酶在体内作用的部位分:胞外酶、胞内酶;(三)步骤:选材→破碎→抽提→分离纯化→保存
二、固定化酶概念:将分离纯化得到的水溶性酶用物理或化学的方法处理,使酶与载体(琼脂糖、聚丙烯酰胺等)连接,作成具催化活性的水不溶的酶。应用:此技术可提高酶的稳定性和使用寿命;使反应过程连续化、自动化,简化工艺;提高产品质量。此技术以广泛用于工农业生产、医药卫生、环境保护、生物化工等方面
三、酶工程酶工程:指酶制剂在工业上的大规模生产和应用。1、化学酶工程:由酶学与化学工程技术相结合而形成。通过化学修饰、固定化处理、甚至化学合成法等手段改善酶的性质,以提高催化效率及降低成本
2、生物酶工程:是在化学酶工程基础上发展起来的,是以酶学和DNA重组技术为主的现代分子生物学技术相结合的产物。包括:1)用DNA重组技术大量生产酶;2)对酶基因进行修饰,产生突变酶;3)设计新的酶基因,合成自然界不曾有过的、性能稳定、催化效率更高的新酶
3、分布及来源:新鲜果蔬中
2、功能——脱羧酶辅酶将底物移入(出)脱羧酶的活性中心。+丙酮酸脱羧酶
在酶催化反应中的作用举例丙酮酸脱羧酶的辅酶乙酰乳酸合成酶的辅酶乙酰乳酸
三、维生素B2和黄素辅酶(FMN、FAD)1、化学本质:为核糖醇与6,7-二甲基异咯嗪的缩合物,又称核黄素(riboflavin)。在酸性溶液中稳定、耐热;易被紫外、碱破坏
四、泛酸和辅酶A1、化学本质:泛酸(pantothenic acid)旧称VB3,亦称遍多酸。对热、还原剂极稳定。三、水溶性维生素
水合反应H2O来源何处?+-H+
3、分布及来源:生物界广泛存在,蔬菜、肝、蛋中丰富;肠道菌可合成。
五、维生素PP和辅酶Ⅰ、辅酶Ⅱ1、化学本质:VitPP又称抗癞皮病维生素,包括二种物质:尼克酸(nicotinic acid,又译烟酸)、尼克酰胺(nicotinamide, 又译烟酰胺),体内多以尼克酰胺形式存在,性质稳定。三、水溶性维生素
在脱氢酶的活性中心辅助H传递NAD(P)H脱氢酶活性中心底物NAD(P)+NAD(P)H来到其他酶活性中心将H传递出去。
六、维生素B6和磷酸吡哆醛1、化学本质:VB6是吡啶的衍生物。水溶性维生素三种物质在体内均以磷酸酯形式存在,可互相转变,参加代谢的主要是磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺。
2、生理功能:1)磷酸吡哆醛在aa代谢中作为辅酶:a、作为转氨酶的辅酶,作氨基载体;b、催化脱羧和消旋作用;水溶性维生素
o缺乏引起呕吐、中枢神经兴奋、惊厥、低色素性贫血。o治呕吐、动脉粥样硬化症、粒细胞减少症等。3、分布及来源:蛋黄、肝、酵母、肉、鱼、肾中丰富。2)作为药物:
七、生物素1、化学本质:生物素(biotin) 结构为带戊酸侧链的噻吩与尿素结合的骈环,又称VitH
2、生理功能:作为羧化酶的辅酶,在体内参与CO2的固定或脱羧反应。3、分布及来源:蔬菜、蛋、肝、肾中丰富,肠道菌可合成。
传递亚甲基谷氨酸谷氨酸传递甲基谷氨酸传递甲川基
缺乏:引起巨幼红细胞性贫血、白细胞减少症、3、叶酸与抗代谢药:1)结构中有与磺胺药结构相似的PABA ,故磺胺药在细菌合成叶酸中起竞争性抑制作用,从而抑制细菌生长繁殖。2)设计叶酸类抗代谢物作为抗肿瘤药物。
九、维生素B12及其辅酶1、化学本质:V B12又称钴胺素(cyanocobalamine), 由咕啉环围绕钴离子形成
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