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02 第一章 核酸化学(改).ppt

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本课件讲解核酸化学,从核酸在细胞中的分布与分类讲起,逐级拆解碱基、核苷、核苷酸与稀有核苷酸的构成;随后展开 DNA 双螺旋的要点与稳定因素、DNA 三级结构与超螺旋、mRNA 与 tRNA 的结构特点,最后说明核酸的紫外吸收、Tm 值、变性复性与分子杂交。

第一章 核酸化学目录页,列出分布分类、化学组成、分子结构与性质四个主题
核酸的分布和分类示意图,指出 DNA 主要位于细胞核、RNA 多分布于细胞质
核酸的化学组成核酸磷酸核苷核糖碱基核苷酸内容页,重点在嘧啶(TCU)嘌呤(AG)脱氧
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第1页:第一章 核酸化学

第一章核酸化学一、核酸的分布与分类二、核酸的化学组成三、核酸的分子结构四、核酸的化学性质

第2页:核酸的分布和分类

一、核酸的分布和分类质质质DNARNA核酸主要在核中tRNArRNAmRNA

第3页:核酸的化学组成核酸磷酸核苷核糖碱基核苷酸

二、核酸的化学组成核酸磷酸核苷核糖碱基核苷酸嘧啶(TCU)嘌呤(AG)脱氧非脱氧

第4页:碱基

Py Pu碱基

第5页:碱基—嘌呤

碱基—嘌呤

第6页:碱基—嘧啶

碱基—嘧啶

第7页:核糖

核糖

第8页:核苷

核苷

第9页:核苷酸

核苷酸

第10页:三磷酸核苷酸

三磷酸核苷酸

第11页:c AM Pc GMP

cAMPcGMP

第12页:甲基化

  • 甲基化: 如甲基鸟嘌呤
  • 环化: 如cAMP
  • 假尿苷: 如ψ
  • 其它: 如二氢尿嘧啶
  • 次黄嘌呤等稀有核苷酸

第13页:核苷酸的作用组成核酸组成小分子活性物质

核苷酸的作用组成核酸组成小分子活性物质能量物质组成辅酶(基)

第14页:任意碱基)--NMP

AMP ADP ATP dAMP dADP dATPGMP GDP GTP d CMP CDP CTP d TMP TDP TTP d UMP UDP UTPN(任意碱基)--NMP,NDP,NTPdNMP, dNDP, dNTPI —次黄嘌呤X —黄嘌呤核苷酸的符号

第15页:核酸的分子结构

  • 三、核酸的分子结构
  • DNA 分子结构
  • RNA 分子结构

第16页:的分子结构

  • DNA的分子结构
  • DNA的碱基组成
  • DNA的空间结构

第17页:Chargaff规律

Chargaff规律
1. A=T G=C2. 有种的特异性3. 环境条件不改变碱基组成DNA的碱基组成

第18页:请注意图示

第19页:请注意示意图

第20页:请注意

请注意
键型: 3’, 5’ -磷酸二酯键方向: 3’ -末端和5’-末端简写:

第21页:简写时的方向

简写时的方向
TGCAGGTTAAAGG它的互补链:ACGTCCAATTTCC(误)CCTTTAACCTGCA(正)3’-ACGTCCAATTTCC-5’(正)

第22页:的空间结构

DNA的空间结构
DNA的二级结构(双螺旋)DNA的三级结构

第23页:的二级结构(双螺旋结

DNA的二级结构(双螺旋结构)

第24页:双螺旋结构要点结构图

第25页:双螺旋结构要点流程图

第26页:双螺旋结构要点模式图

第27页:双螺旋结构要点图解

第28页:双螺旋结构要点图谱

第29页:双螺旋结构要点

双螺旋结构要点
(1)两条反向平行的多核苷酸链围绕同一中心轴向右盘绕形成右手双螺旋(反向是指两条多核苷酸链的走向相反,一条链的磷酸二酯链连接相邻戊糖基是5—3’方向,另一条链则为3’—5’方向)。

第30页:由磷和脱氧核糖交替排列形成的

(2)由磷和脱氧核糖交替排列形成的主链在双螺旋的外侧,而嘌呤碱和嘧啶碱位于双螺旋的内侧。碱基平面与双螺旋中轴垂直,糖环平面与中轴平行。

第31页:双螺旋的平均

(3)双螺旋的平均直径为2 nm,螺距为3.4nm,沿中心轴每旋转上升一周包含10个碱基对,相邻碱基距离为0.34nm,之间旋转的角度为36°。

第32页:沿中心轴方向

(4)沿中心轴方向观察,双螺旋结构上有两条螺形凹槽,一条较宽深,称为大沟;一条较浅小,称为小沟。

第33页:双螺旋结构的稳定因素

双螺旋结构的稳定因素
碱基对间的氢键碱基堆积(主要的)环境中正离子

第34页:双螺旋结构的多态性双螺旋的

DNA双螺旋结构的多态性双螺旋的具体数据(螺距、直径等)随含水量的不同有一定的差异。可分为:ABZ型在特殊时间还有三股链的存在

第35页:双螺旋结构的类型

  • DNA双螺旋结构的类型
  • B-DNA
  • A-DNA
  • Z-DNAA-DNAMajor GrooveMinor Groove

第36页:的三级结构无法显构型图

第37页:的三级结构无法显示该

DNA的三级结构无法显示该图片。定义:DNA的三级结构是指在二级结构的基础上DNA双螺旋的进一步卷曲。

第38页:Supercoiling of关系图

第39页:Supercoiling of DNA

Supercoilingof DNARelaxedstate

第40页:超螺旋

超螺旋

第41页:DNA Supercoiling

DNA SupercoilingSupercoiling meansthe coiling of coiling

第42页:Supercoiling induced

Supercoiling induced by separating thestrands of a helical structure(duringreplication or transcription)

第43页:在DNA分子中Watson—Crick

连环数(L) 在DNA双螺旋中,一条链沿右手螺旋绕另一条链缠绕的次数。缠绕数(T) 在DNA分子中Watson—Crick螺旋数。超螺旋周数或扭曲数(W)L=T+W

第44页:Wr=-2 Wr=2 Tw=200

Wr=-2Wr=2Tw=200

第45页:核小体-染色体的基本单位病毒颗粒核酸

核小体-染色体的基本单位病毒颗粒核酸与蛋白质的复合物

第46页:染色质的电镜照片对照图

第47页:染色质的电镜照片

染色质的电镜照片

第48页:The 30 nm fiber

The 30 nm fiber, a higher-orderorganization of nucleosomes

第49页:染色体结构

染色体结构

第50页:chromosome

chromosome

第51页:HIV

HIV

第52页:SARS

SARS
Coronavirus

第53页:a)a bacterial简图

第54页:a)a bacterial virus

(a) a bacterial virus, bacteriophage T4; (b) an animal virus, adenovirus (inset at greater magnification); (c) a plant virus, tobacco mosaic virus.

第55页:的结构

mRNA tRNA rRNARNA的结构

第56页:编码区非编码区非编码区poly

mRNA编码区非编码区非编码区polyA帽子结构UTRUTRORF

第57页:m 7 G 5’ppp N

m7G5’pppN

第58页:的分离

mRNA的分离
TTTTTTTTTTTTAAAA

第59页:的二级结

tRNA的二级结构

第60页:氨基酸臂由7对原理图

第61页:氨基酸臂由7对结构式

第62页:氨基酸臂由7对碱基组成

①氨基酸臂由7对碱基组成,富含鸟嘌呤,3’末端为CCA,接受活化的氨基酸, 5’末端为pG或pC。②二氢尿嘧啶环由8~12个核苷酸组成,具有两个二氢故得名。通过由3—4对碱基组成的双螺旋区(也称二氢尿嘧啶臂)与tRNA分子的其他部分相连。

第63页:反密码环由7个核苷酸组成

③反密码环由7个核苷酸组成。环中部为反密码子,由3个核苷酸组成,次黄嘌呤核苷酸(也称肌苷酸,缩写成I )常出现于反密码子中。反密码环通过由5对的双螺旋区(反密码臂)与tRNA的其余部分相连。

第64页:额外环由3—18个核苷酸组成

④额外环由3—18个核苷酸组成。不同的tRNA具有不同大小的额外环,所以是tRNA分类的重要指标。

第65页:环由7个核苷酸组成

⑤T ψ C环由7个核苷酸组成,其中含有胸腺嘧啶核糖核苷酸(T)和假尿嘧啶核苷酸(ψ),通过由5对碱基组成的双螺旋区(T ψ C臂)与tRNA的其余部分相连。几乎所有tRNA在此环中都含有T ψ C。从以上可以看出,tRNA的三叶草形二级结构特征可概括为四环四臂,含有大量的稀有碱基。

第66页:的三级结

tRNA的三级结构

第67页:的二级结

rRNA的二级结构

第68页:Ribosomal RNA Ban et

Ribosomal RNABan et al., Science289 (905-920), 2000Secondary StructureOf large ribosomal RNATertiary StructureOf large ribosome subunit

第69页:其它类型的RNA

  • 其它类型的RNA
  • Catalytic RNA(催化RNA)
  • miRNA(microRNA)(小RNA)
  • siRNA(small interfere RNA)(小干扰RNA)
  • signal recognition particle,SRP 信号识别颗粒中的RNA
  • telemerase (端粒酶)中的RNA

第70页:Catalytic RNA

Catalytic RNASecondary StructureOf large ribosomal RNATertiary StructureOf large ribosome subunit

第71页:核酸的性质

四、核酸的性质

第72页:带电性

带电性
核酸、核苷酸可以在电场中泳动可溶性:溶于水。在乙醇中:大于50%的乙醇时DNA沉淀大于75%的乙醇时RNA沉淀。不溶于氯仿-异戊醇溶液,而蛋白可以溶解粘度:线形分子粘度大。DNA大于RNA不对称性:由于分子不对称,故有正旋光性。(一)、核酸的一般性质

第73页:吸光性

吸光性
由于碱基的存在使核酸对260nm的光有强烈的吸收。可根据此对核酸定量与检测。减色效应:核酸形成双链后对紫外吸收的能力减弱的现象。增色效应:核酸双链打开后对紫外吸收能力增加的现象。(二)、核酸的对紫外吸收

第74页:变性

变性
DNA双链分开变成单链的过程。只涉及H键的断裂,没有其它共价键的破坏。变性的因素:加热、强酸、强碱、溶剂、紫外线等。变性后核酸的性质变化:生物活性丧失;粘度下降;浮力密度增加;紫外吸收增加。(三)、核酸的变性、复性与分子杂交

第75页:的热变性(熔解)高温引起的变性

DNA的热变性(熔解)高温引起的变性称为热变性(熔解)解链温度(熔解温度、熔点,Tm):——增色效应达到一半时的温度

第76页:紫外吸收温度Tm

紫外吸收温度Tm

第77页:与Tm值有关的因素

与Tm值有关的因素
G-C含量: G-C含量越高Tm值越高(三个氢键的缘故)。介质中的离子强度:离子强度越高Tm值越高。在1mol/L的NaCl中稳定。DNA 的不均一性:影响到了温度范围,而不影响Tm值的大小。

第78页:的复性

DNA的复性
加热后缓慢冷却DNA恢复双链的过程

第79页:的大小

DNA的大小
小的分子比大的分子易复性。离子强度:离子强度增加复性就快。DNA的浓度:浓度大的比浓度小的易于复性。影响DNA的复性因素:

第80页:核酸的分子杂交

核酸的分子杂交
在DNA的复性的过程中,同源或异源的DNA,只要碱基互补就可以形成杂种分子,此过程称为分子杂交。分子杂交是一种极其有用的生物技术手段。

第81页:Nucleic Acids from

Nucleic Acids from Different Species Can Form Hybrids

第82页:Southern blot

Southern blot电泳酶切印迹杂交探针NC

第83页:Southern blot——DNA

Southern blot——DNANorthern blot——RNAWestern blot——Protein

第84页:Fingerprinting

Fingerprinting

第85页:DNA Microarray(Gene

DNA Microarray(Gene Chip)

第86页:核酸的结构示意页

第87页:核酸的结构图解页

第88页:核酸的结构

核酸的结构
DNA的二级结构,mRNA及tRNA的结构核酸的性质:变性与吸光性,Tm值。本章要点:

第89页:结束

第一章结束

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