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本课件讲解微生物代谢,从分解代谢与合成代谢的关系出发,介绍生物氧化、呼吸与发酵等能量代谢途径,讲解固氮、肽聚糖合成等微生物特有的合成代谢,并说明次级代谢产物的类型及其在生产实践中的应用。
第七章微生物的代谢第一节微生物的能量代谢第二节微生物特有的合成代谢途径第三节微生物次级代谢与次级代谢产物第四节微生物代谢与生产实践
代谢概论代谢(metabolism):细胞内发生的各种化学反应的总称代谢分解代谢(catabolism)合成代谢(anabolism)复杂分子(有机物)分解代谢合成代谢简单小分子ATP[H]
生物氧化的形式:某物质与氧结合、脱氢或脱电子三种生物氧化的功能为:产能(ATP)、产还原力[H]和产小分子中间代谢物自养微生物利用无机物异养微生物利用有机物生物氧化能量微生物直接利用储存在高能化合物(如ATP)中以热的形式被释放到环境中
2、化能自养微生物的生物氧化与产能通常是化能自养型细菌,一般是好氧菌。利用卡尔文循环固定C02作为它们的碳源。其产能的途径主要也是借助于无机电子供体(能源物质)的氧化,从无机物脱下的氢(电子)直接进入呼吸链通过氧化磷酸化产生ATP。
代谢特点1)无机底物脱下的氢(电子)从相应位置直接进入呼吸链2)存在多种呼吸链3)产能效率低;4)生长缓慢,产细胞率低。
3、光能自养或异氧微生物的产能代谢指具有捕捉光能并将它用于合成ATP和产生NADH或NADPH的微生物。分为不产氧光合微生物和产氧光合微生物。前者利用还原态无机物H2S,H2或有机物作还原C02的氢供体以生成NADH和NADPH。
后者由H2O分子光解产物H’和电子形成还原力(NADPH+H’)
分为两个阶段:1、3个分子6-磷酸葡萄糖在6-磷酸葡萄糖脱氢酶和6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶等催化下经氧化脱羧生成6个分子NADPH+H+,3个分子CO2和3个分子5-磷酸核酮糖2、5-磷酸核酮糖在转酮酶和转醛酶催化下使部分碳链进行相互转换,经三碳、四碳、七碳和磷酸酯等,最终生成2分子6-磷酸果糖和1分子3-磷酸甘油醛。
2)HMP 途径(磷酸戊糖途径、旁路途径)
6-磷酸果糖出路:可被转变重新形成6-磷酸葡糖,回到磷酸戊糖途径。甘油醛-3-磷酸出路:a、经EMP途径,转化成丙酮酸,进入TCA途径b、变成己糖磷酸,回到磷酸戊糖途径。总反应式:6 6-磷酸葡萄糖+12NADP++3H2O
3)ED途径——2-酮-3-脱氧-6-磷酸-葡萄糖酸裂解途径1952年Entner-Doudoroff :嗜糖假单胞过程:(4步反应)1 葡萄糖6-磷酸-葡萄糖6-磷酸-葡糖酸KDPG6-磷酸-葡萄糖-脱水酶3--磷酸--甘油醛+ 丙酮酸KDPG醛缩酶特点:a、步骤简单b、产能效率低:1 ATPc、关键中间产物KDPG,特征酶:KDPG醛缩酶细菌:铜绿、荧光假单胞菌,根瘤菌,固氮菌,农杆菌,运动发酵单胞菌等。
2、发酵类型1)乙醇发酵a、酵母型乙醇发酵1 G 2丙酮酸
4)丙酮-丁醇发酵——严格厌氧菌进行的唯一能大规模生产的发酵产品。(丙酮、丁醇、乙醇混合物,其比例3:6:1)——丙酮丁醇梭菌(Clostridium acetobutyricum)2丙酮酸2乙酰-CoA乙酰-乙酰CoA丙酮+CO2(CoA转移酶)丁醇缩合
5)氨基酸的发酵产能(stickland反应)发酵菌体:生孢梭菌、肉毒梭菌、斯氏梭菌、双酶梭菌等。特点:氨基酸的氧化与另一些氨基酸还原相偶联;产能效率低(1ATP)氢供体(氧化)氨基酸:Ala、Leu、Ile、Val、His、Ser、Phe、Tyr、Try等。
氢受体(还原)氨基酸:Gly、Pro、Arg、Met、Leo、羟脯氨酸等。
氧化丙氨酸丙酮酸-NH3NAD+NADH乙酰-CoANAD+NADH乙酸+ ATP甘氨酸乙酸甘氨酸-NH3还原
四、呼吸(respiration)——从葡萄糖或其他有机物质脱下的电子或氢经过系列载体最终传递给外源O2或其他氧化型化合物并产生较多ATP的生物氧化过程。有氧呼吸(aerobic respiration)无氧呼吸(anaerobic respiration)1 有氧呼吸原核微生物:胞质中,仅琥珀酸脱氢酶在膜上真核微生物:线粒体内膜上2 个产能的环节:Kreb 循环、电子传递。
TCA循环的生理意义:(1)为细胞提供能量。(2)三羧酸循环是微生物细胞内各种能源物质彻底氧化的共同代谢途径。(3)三羧酸循环是物质转化的枢纽。(1)TCA循环柠檬酸循环或Krebs循环
TCA 的补充途径I 乙醛酸循环(TCA 循环支路)(异柠檬酸裂合酶)(乙酰--CoA合成酶)(苹果酸合成酶)乙酰-CoA异柠檬酸琥珀酸+ 乙醛酸乙酸苹果酸Ii 丙酮酸、PEP等化合物固定CO2的方法Iii 厌氧、兼性厌氧微生物获得TCA 中间产物方式
(2)电子传递链1)电子传递链载体:NADH脱氢酶黄素蛋白辅酶Q(CoQ)铁-硫蛋白及细胞色素类蛋白在线粒体内膜中以4个载体复合物的形式从低氧化还原势的化合物到高氧化还原势的分子氧或其他无机、有机氧化物逐级排列。
3)氧化磷酸化产能机制——化学偶联假说、构象偶联假说、化学渗透假说化学渗透学说---英国生物化学家Peter.Mitchell于1961年提出的。该假说认为电子传递链的组成导致质子从线粒体的基质向外移动,电子向内传递。
质子传递可能是由于载体环或特定的质子泵的作用,驱动泵的能量来自电子传递。来自被氧化底物上的一对电子沿传递链转移时所产生的跨膜的电化学梯度(即质子动势Proton motiveforce,PMF)是ATP合成的原动力。
当质子动势驱动被转移至膜间空键的质子返回线粒体基质中时,所释放的能量推动ADP磷酸化生成ATP。质子推动力(Δp)取决于跨膜的质子浓度(ΔpH)和内膜两侧的电位差(Δψ)。
特点:a常规途径脱下的氢,经部分呼吸链传递;b氢受体:氧化态无机物(个别:延胡索酸)c产能效率低。硝酸盐呼吸(反硝化作用)即硝酸盐还原作用特点:a 有其完整的呼吸系统;b 只有在无氧条件下,才能诱导出反硝化作用所需的硝酸盐还原酶A亚硝酸还原酶等c 兼性厌氧细菌:铜绿假单胞、地衣芽孢杆菌等。
2 无氧呼吸(厌氧呼吸)
硝酸盐作用同化性硝酸盐作用:NO3-
硫呼吸(硫还原)——以元素S作为唯一的末端电子受体。电子供体:乙酸、小肽、葡萄糖等碳酸盐呼吸(碳酸盐还原)——以CO2、HCO3-为末端电子受体产甲烷菌—利用H2作电子供体(能源)、CO2为受体,产物CH4;产乙酸细菌—H2/ CO2进行无氧呼吸,产物为乙酸。
第二节微生物特有的合成代谢途径
紫色非硫细菌(红螺菌科):旧认为不能利用硫化物作为电子供体;现知大多数亦能利用硫化物,但浓度不能高。b、绿色细菌(绿硫细菌)含较多的菌绿素c、d 或e ,少量a 。电子供体:硫化物或元素硫,S沉积胞外(类似紫色非硫细菌);暗环境中不进行呼吸代谢,还可同化乙酸、丙酸、乳酸等简单有机物。
2、细菌光合色素1)叶绿素(chlorophyll):680、440nm2)菌绿素——a、b、c、d、e、g。a :与叶绿素a 基本相似;850nm处。b:最大吸收波长840~1030。
3)辅助色素:提高光利用率类胡萝卜素:藻胆素:篮细菌独有藻红素(550nm)、藻蓝素(620~ 640 nm)藻胆蛋白:与蛋白质共价结合的藻胆素。
3、细菌光合作用1)循环光合磷酸化细菌叶绿素将捕获的光能传输给其反应中心叶绿素P870,P870吸收光能并被激发,使它的还原电势变得很负,被逐出的电子经过由脱镁菌绿素(bacteriopheophytin,Bph)、CoQ、细胞色素b和c组成的电子传递链传递返回到细菌叶绿素P870,同时造成了质子的跨膜移动,提供能量用于合成ATP。
特点:a、光驱使下,电子自菌绿素上逐出后,经过类似呼吸链的循环,又回到菌绿素;b、产ATP和还原力[H]分别进行,还原力来自H2S等无机物;c、不产氧(O2)。
光驱使下,电子自菌绿素上逐出后,经过类似呼吸链的循环,又回到菌绿素产ATP和还原力分别进行.紫色细菌循环光合磷酸化过程
外源电子供体——H2S等无机物氧化放出电子,最终传至失电子的光合色素时与ADP磷酸化偶联产生ATP。特点:只有一个光合系统,光合作用释放的电子仅用于NAD+还原NADH,但电子传递不形成环式回路。
绿硫细菌和绿色细菌
2)非循环光合磷酸化特点:a、电子传递非循环式;b、在有氧的条件下进行;c、存在两个光合系统d、ATP、还原力、O2同时产生当光反应中心I的叶绿素P700吸收光量子能量后释放的电子,经过黄素蛋白和铁氧还蛋白(Fd)传递给NAD+(NADP’)生成NADH(NADPH)+H’(还原力),而不是返回氧化型P700
蓝细菌等的产氧光合作用——非循环光合磷酸化过程
3)依靠菌视紫红质的光合作用无叶绿素或菌绿素参与的独特的光合作用,是迄今为止最简单的光合磷酸化反应。——极端嗜盐古细菌菌视紫红质:以“视黄醛”(紫色)为辅基。与叶绿素相似,具质子泵作用。
与膜脂共同构成紫膜;埋于红色细胞膜(类胡萝卜素)内。
ATP合成机理:视黄醛吸收光,构型改变,质子泵到膜外,膜内外形成质子梯度差和电位梯度差,是ATP合成的原动力,驱动ATP酶合成ATP。
二、细菌化能自养作用化能无机营养型细菌:通常是化能自养型细菌,一般是好氧菌。产能的途径主要是借助于无机电子供体(能源物质)的氧化,从无机物脱下-的氢(电子)直接进入呼吸链通过氧化磷酸化产生ATP。
最普通的电子供体是氢、还原型氮化合物、还原型硫化合物和亚铁离子(Fe2+)。利用卡尔文循环固定C02作为它们的碳源。最重要反应:CO2 还原成[CH20]水平的简单有机物,进一步合成复杂细胞成分——大量耗能、耗还原力的过程。
化能自养细菌的能量代谢特点:
2氢细菌(氧化氢细菌)能利用氢作为能源的细菌组成的生理类群称氢细菌或氢氧化细菌(hydrogen oxidizing bacteria)。兼性化能自养菌主要有假单胞菌属、产碱杆菌属(Alcaligenes)、副球菌属、芽孢杆菌属、黄杆菌属(Flavobacterium)、水螺菌属
氢细菌的自氧作用第一步:产能反应,氧化4分子H。产生1分子ATP;第二步:合成代谢反应,用所产生的ATP还原C02构成细胞物质[CH2O]和生长。在Ralstonia eutropha中存在两种氢酶,一种膜结合氢酶涉及质子动势而细胞质中的氢酶为Calvin cycle提供还原力NADH。
3硫细菌(硫氧化细菌)——利用H2S、S02、S2O32-等无机硫化物进行自养生长,主要指化能自氧型硫细菌大多数硫杆菌,脱下的H+(e-)经cyt.c部位进入呼吸链;
4铁细菌和细菌沥滤(1)铁细菌(多数为化能自养,少数兼性厌氧,产能低。)定义:能氧化Fe2+成为Fe3+并产能的细菌被称为铁细菌(iron bacteria)或铁氧化细菌(
铁氧化细菌呼吸链的氧化磷酸化的产能途径
2、固氮机制1)固氮反应的条件aATP的供应:1 mol N2—10 ~ 15 ATPb还原力[H]及其载体氢供体:H2、丙酮酸、甲酸、异柠檬酸等。电子载体:铁氧还蛋白(Fd)或黄素氧还蛋白(Fld)。
c固氮酶组分I:真正“固氮酶”,又称钼铁蛋白(MF)、钼铁氧还蛋白(MoFd)
N2+ 2e + 6H+ +(18 ~24)ATP —
固氮生化途径
3、好氧性固氮菌的防氧机制固N酶遇氧不可逆失活(组分I,半衰期10’;组分II,45”丧失一半活性)(1)自身固N菌a呼吸保护固N菌科的固N菌以极强的呼吸作用消耗掉环境中的氧。b构象保护高氧分压环境,固氮酶能形成一无固N活性但能防止氧损伤的特殊构象。
构象保护的蛋白质——Fe-
(2)蓝细菌保护固N酶机制a分化出特殊的还原性异形胞(——适宜固氮作用的细胞)I、厚壁,物理屏障;II、缺乏氧光合系统II,脱氧酶、氢酶活性高;III、SOD活性很高;IV、呼吸强度高b非异形胞蓝细菌固N酶的保护——缺乏独特的防止氧对固N酶的损伤机制。
I、固N、光合作用在
I、豆科植物的共生菌——以类菌体形式存在于根瘤中类菌体周膜:豆血红蛋白,可与氧可逆结合(高时结合,低时释放)豆血红蛋白:蛋白部分由植物基因编码;血红素有根瘤菌基因编码。II、非豆科植物共生菌——含植物血红蛋白(功能相似豆血红蛋白)Frankin放线菌:营养菌丝末端膨大的泡囊类似异形胞。
c 根瘤菌保护固N酶机制
四、肽聚糖的合成1在细胞质中的合成——UDP-胞壁酸5肽a G—
N-乙酰胞壁酸合成“Park”核苷酸亲水性化合物
——肽聚糖单体亚单位的合成载体:细菌萜醇(类脂载体)——C55类异戊二烯醇(含11个异戊二烯单位)穿膜的同时与G结合,接上肽桥,此外,类脂载体还参与胞外多糖、脂多糖的合成(磷壁酸、纤维素、几丁质、甘露聚糖等)万古霉素,杆菌肽所抑制这些反应2 细胞膜中的合成
“Park”核苷酸合成肽聚糖单体细胞膜上细胞质双糖肽位于细胞膜外细胞壁生长点处
转糖基作用和转肽作用
第三节微生物次级代谢与次级代谢产物一、次级代谢与次级代谢产物一般将微生物通过代谢活动所产生的自身繁殖所必需的物质和能量的过程,称为初级代谢,该过程所产生的产物即为初级代谢产物,如氨基酸、核苷类,以及酶或辅酶等。
次级代谢
次级代谢与初级代谢关系密切,初级代谢的关键性中间产物往往是次级代谢的前体,比如糖降解过程中的乙酰-CoA是合成四环素、红霉素的前体;一般菌体的次级代谢在对数生长后期或稳定期间进行,受环境条件的影响;次级代谢产物的合成,因菌株不同而异,但与分类地位无关;
二、次级代谢的调节
一、微生物代谢产物的利用利用微生物代谢过程中产生的众多代谢产物生产各种发酵产品。按照积累产物类型:初级代谢产物,如氨基酸、核苷类,以及酶或辅酶;次级代谢产物,抗生素、激素、生物碱、毒素及维生素等。
按照发酵类型:自然发酵:酒精、乳酸等,代谢控制发酵:终端产物,赖氨酸、鸟苷酸、腺苷酸等;中间产物,柠檬酸、α-酮戊二酸、琥珀酸、高丝氨酸、肌苷酸、黄苷酸等;第四节微生物代谢与生产实践
1.发酵条件的控制人们通过对微生物菌种营养和培养条件的控制生产所要的目的产品:1)培养条件:温度、pH值、渗透压的控制;2)营养成分的控制:葡萄糖浓度、碳氮比、生长因子、无机离子等;3)溶解氧的控制:通气量,搅拌等。
2.代谢调节的控制(1)应用营养缺陷型菌株以解除正常的反馈调节赖氨酸发酵——(高丝氨酸缺陷型菌株)在这个代谢工程的设计中,是利用阻断分支途径的高丝氨酸的合成,来解除(Lys+Thr)的反馈调节。
即造成高丝氨酸缺陷型(Hser一),就可解除末端产物对限速酶的反馈抑制。
选育细胞膜缺损突变株——油酸缺陷型、甘油缺陷型,或生物素缺陷型利用油酸缺陷型菌株,限量添加油酸,限制细胞膜磷脂中不饱和脂肪酸的合成而使细胞膜缺损,利于代谢产物渗漏而提高谷氨酸的产量。
生物素缺陷型原理在脂肪酸生物合成途径中,由乙酰辅酶A羧化成丙二酸单酰辅酶A的反应是一个限速步骤,该反应由乙酰辅酶A羧化酶系催化,包括生物素羧化酶,羧基转移酶和生物素羧基载体蛋白CCP,并且需要生物素作辅酶。
选育生物素营养缺陷型菌株,使细胞中的饱和脂肪酸和不饱和脂肪酸的合成受阻,从而影响到磷脂的合成。在培养时限量添加生物素或含生物素的原料,可以控制膜的厚度来调节透性。
(2)应用抗反馈调节的突变株解除反馈调节抗反馈调节突变菌株,就是指一种对反馈抑制不敏感或对阻遏有抗性的组成型菌株,或兼而有之的菌株。在这类菌株中,因其反馈抑制或阻遏已解除,或是反馈抑制和阻遏已同时解除,所以能分泌大量的末端代谢产物。
如Corynebacteriumcrenatum(钝齿棒杆菌)的抗α-氨基-β-羟基戊酸(AHV)菌株能积累积苏氨酸。
3.微生物代谢与代谢工程近年来,基因工程的不断发展,也为微生物代谢在发酵生产的应用提供了新的方法。人们通过分子生物学技术和DNA重组技术,可以定向地对细胞代谢途径进行修饰或引入新的反应,以改进产物的生成或改变细胞的代谢特性。
但这些改进都是与微生物的基
1)克隆来自细菌的木糖异构酶基因,2)克隆来自柄状毕赤酵母(Pichiastipitis)的木糖还原酶和木糖醇脱氢酶基因。引入木糖代谢途径(戊糖代谢生产乙醇的代谢工程)—酵母菌Saccharomyces的代谢工程
二、微生物代谢活性的利用1.生物转化生物转化是指利用生物体代谢过程中产生的酶使底物进行有机反应。生物转化一般采用微生物细胞或微生物酶作催化剂,故又称作微生物转化。微生物转化的一个重要领域是手性化合物的合成与拆分。
2.微生物降解秸杆秸秆成分中的纤维素和半纤维素能够被草食动物的瘤胃微生物充分降解利用,但由于木质素和纤维素之间镶嵌在一起形成坚固的酯键,阻碍了瘤胃微生物对纤维素的降解,导致秸秆消化率低。
3.微生物冶金、采油人类利用具有氧化硫化物矿中的硫和硫化物能力的微生物将硫化矿中的重金属通过转化成高度水溶性的重金属硫酸盐而从低品位矿中浸出来生产黄金。如,氧化亚铁硫杆菌(Thiobacillus ferooxidans)的氧化作用可从金矿石中除去硫、砷,浸提黄金,如果用化学方法浸提金的话,其得率不到70%;
4.生物降解迄今为止,已知的环境污染物达数十万种之多,其中大量的是有机物。由于微生物的代谢类型极其多样,作为一个整体,微生物分解有机物的能力是惊人的。可以说,凡自然界存在的有机物,几乎都能被微生物所分解。
我们可从中筛选出一些污染物的高效降解菌。
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