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31 18.真核调控B.ppt

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本课件围绕染色质水平的调控展开,按课件原有章节顺序组织,逐页给出页面图示与对应的文字版内容,概念、术语与数据保留原始表述,便于对照原课件按章节检索、备课与复习。

第三节染色质水平调控,列出一、异染色质化、如水蜡虫、剂量补偿等5项概念与要点
莱昂假说,分列6项要点
无汗性外胚层发育不良,(anhidrotic ectodermal dysplasia)2.三色猫3.
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第1页:第三节染色质水平调控

第三节染色质水平调控

  • 第三节染色质水平调控
  • 一、异染色质化
  • 如水蜡虫(Pseudococcusnipae)
  • (2n=10)在体细胞里来自父本的5条染色体依次被异染色质化,在精子形成时丢失,只保留来自母本的5条染色体。
  • 剂量补偿(dosageconpensation)雌性哺乳动物X染色体的失活

第2页:莱昂假说

莱昂假说

  • 莱昂假说(Lyonhypothesiis)
  • (1)巴尔小体是一个失活的X染色体,失活的过程就称为莱昂化(lyonization);
  • (2)在哺乳动物中,雌性个体细胞中的两个X染色体中有一个X染色体在受精后的第16天(受精卵增殖到5000-6000,植入子宫壁时)失活;
  • (3)两条X染色体中哪一条失活是随机的;
  • (4)X染色体失活后,细胞继续分裂形成的克隆中,此条染色体都是失活的;
  • (5)生殖细胞形成时失活的X染色体可得到恢复。

第3页:无汗性外胚层发育不良

1.无汗性外胚层发育不良(anhidrotic ectodermal dysplasia)2.三色猫3. G-6-PDH二. 组蛋白与非组蛋白三.DNase的敏感性和基因的表达高泳动蛋白(high-mobility group,HMG)HMG14 和HMG17四. 座位控制区(locus control region ,LCR)特化染色质结构(specialized cromatin structures, SCSor SCS‘ )隔离子或绝缘子(insulator)

第4页:

第5页:

第6页:1染色质结构改变模型-组蛋白置换

  • 1染色质结构改变模型-组蛋白置换
  • (1) 占先模型(pre-emptive model)模型认为:决定的因素是转录因子和组蛋白谁先占据调控位点。DNA复制时,组蛋白8聚体解离,转录因子乘机结合到调控位点上,一直持续到下一个复制周期,抑制了组蛋白和DNA的结合。例1:当5S rRNA基因与组蛋白结合时TFⅢA不能激活此基因。而TFⅢA可与游离的5S rRNA基因结合,再加入组蛋白不能使此基因失活。例2:含腺病毒启动子的质粒能被TFⅡD结合,再被RNA pol Ⅱ转录,如先加入组蛋白,则不起始转录,如先加入TFⅡD则形成的染色质中,模板仍能转录

第7页:染色质的占先模型提出

染色质的占先模型提出:如在启动子上已形成了核小体,那么转录因子和RNA聚合酶是不能和启动子结合的;如转录因子和RNA聚合酶在启动子上已建立了稳定的起始复合体,那么组蛋白将被排除在外。

第8页:染色质的占先模型提出(续)

(2)动态模型(dynamic model)近来研究表明:组蛋白置换需输入能量。一些转录因子结合DNA时可裂解核小体,或建立一个可产生核小体定位结合位点的边界。如果蝇Hsp70启动子上的核小体在体外实行重建。GAGA(细胞核结合蛋白)转录因子与启动子中4个富含(CT)n位点结合,破坏了核小体,形成一高敏感区,而且导致邻接的核小体重排,这样它们就优先插入到随机位点。核小体打开的过程是需要水解ATP的耗能过程。

第9页:染色质的转录模型依赖于那些通过水解AT

染色质的转录模型依赖于那些通过水解ATP提供能量,从特异DNA序列取代核小体的因子

第10页:组蛋白的乙酰化和去乙酰化控制染色活

组蛋白的乙酰化和去乙酰化控制染色活

  • 3.组蛋白的乙酰化和去乙酰化控制染色活性
  • 组蛋白的乙酰化和基因表达的状态相关。
  • 组蛋白H4的去乙酰化是雌性哺乳动物一条X染色体失活的原因之一。
  • HATs (histone acetytransferases)组蛋白乙酰化酶
  • HDACs(histone deacetylases)
  • HATs有两组,一组为A组,和转录有关;另一组是B组,和核小体装配有关。

第11页:辅激活因子可能有HAT乙酰化核小体组蛋

辅激活因子可能有HAT乙酰化核小体组蛋白尾巴的活性

第12页:去乙酰化和基因活性的阻遏有关

  • 去乙酰化和基因活性的阻遏有关。
  • 在酵母中SIN3和Rpd3的突变将阻遏基因转变。SIN3和Rpd3与DNA-结合蛋白Ume6形成复合物,而此复合物阻遏具有由Ume6结合的URS1(上游阻遏序列)元件的启动子转录。Rpd3具有HDACs活性。

第13页:阻遏复合体含有3个成分

阻遏复合体含有3个成分
DNA结合亚基,辅阻遏物和组蛋白的去乙酰化酶

第14页:Pc-G蛋白不起始阻遏

Pc-G蛋白不起始阻遏,但可维持阻遏

第15页:用DNAaseI来鉴别基因的活性

用DNAaseI来鉴别基因的活性

第16页:在成体的红细胞

在成体的红细胞

  • 在成体的红细胞中,成体
  • -球蛋白基因对DNAaseI的降解是高度敏感的,对胚胎
  • -球蛋白基因是部分敏感的(可能是由于扩散效应),但对卵清蛋白基因是不敏感的。胚胎
  • -球蛋白基因成体
  • -球蛋白基因卵清蛋白基因

第17页:大范围调节与功能区的隔离LCR

五.大范围调节与功能区的隔离LCR(locus control region)5’端调控位点,起初级调控作用,它即是一簇超敏感位点。HS4

第18页:大范围调节与功能区的隔离LCR(续)

(specialized chromatinsructures)

第19页:. 核基质蛋白核基质

. 核基质蛋白核基质(nuclear matrix)骨架蛋白(scaffolding protein)核基质结合区(matrix association,MAR)骨架附着区(scaffold attached region,SAR)限定子(delimiter)绝缘体(insulators)

第20页:. 核基质蛋白核基质(续)

(Matrix attachment site)

第21页:

第22页:第四节DNA水平的调控

第四节DNA水平的调控一. DNA的甲基化与去甲基化

第23页:

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第27页:亲本印记

亲本印记

  • 二.亲本印记(imprinting)
  • 印记:来源于父母本的一对等位基因表达不同。如源于父本的IGF-Ⅱ(胰岛素样生长因子Ⅱ)基因可表达,而源于母本的则不能表达。此是由于卵母细胞中的IGF-Ⅱ已被甲基化,而精子中的IGF-Ⅱ未被甲基化,所以这一对等位基因在合子中表现不同。
  • 目前在人类和鼠身上已辨明了20种印迹基因。大多数人类的印迹基因集中在三个簇中。在每个基因簇上都存在着特异的印记盒(imprinting box),能顺式调节印迹基因的亲本特异性表达,这些位点表现出亲本特异性的甲基化作用和去甲基化作用。

第28页:亲本的IGF-Ⅱ等位基因在早期胚中被差

亲本的IGF-Ⅱ等位基因在早期胚中被差异甲基化,在成体形成配子时仍保留原甲基化的模式。

第29页:第五节转录水平的调控一.顺式作用元件

第五节转录水平的调控一.顺式作用元件和反式作用因式元件:(1) 核心启动子成分,如TATA 框;(2) 上游启动子分,如CAAT框,GC框;(3) 远上游顺序:如增强子,减弱子、静息子,酵母的UAS (upstreamactivator sequences)等。(4) 特殊细胞中的启动子成分:如淋巴细胞中的Oct (octamer)和κB。

第30页:反式作用因子可以分

反式作用因子可以分为3类;(1)通用反式作用因子,,主要识别启动子的核心启动成分,如TBP;(2)特殊组织与细胞中的反式作用因子,如淋巴细胞中的Oct-2;(3)和反应性元件(responseelenents)相结合的反式作用因子。如HSE(热休克反应元件,heatshockresponseelement),GRE(糖皮质激素反应元件glucocorticoidresponseelement);MRE(金属反应元件,metalresponseelement);TRE(肿瘤诱导剂反应元件,tumorgenicagentresponseelement);

第31页:反式作用因子可以分(续)

(一)蛋白质直接和DNA结合1.螺旋转角螺旋(Helix-turn-helix,HTH):如LacO的R蛋白,λ的CI,Cro蛋白,涉及酵母交配型的a1和a2蛋白。真核生物中的Oct-1和Oct-2;2.锌指结构(zinc fimger)单个的锌指保守序列是:Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X2-His Ⅰ型:2Cys/2His:TFIIIA,SP1Ⅱ型:2cys/2cys:GAL4

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第34页:亮氨酸拉链

3. 亮氨酸拉链(Leucine ziipper)同二聚体(honwdimers)异二聚体(hefercdimers)C-Jun,C-Fos,Myc ,4. 螺旋一环一螺旋(HLH)在HLH中带有碱性区的肽链
称为碱性HLH(bHLH,protein)。bHLH又分为两类。A类是可以广泛表达的蛋白,包括哺乳动物的E12/E47(可和免疫球蛋基因增强子中的元件结合)和果蝇da(daughterless,性别控制的总开关基因)的产物;B类是组织特异性表达的蛋白,包括哺乳动物的MyoD(肌浆蛋白(myogen)基因的转录因子果蝇的AC-S(achaete-scute 无刚毛基因的产物)

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第36页:同源异形结构域

5.同源异形结构域(Homeodomains,HD)是一种编码60aa的序列,长180bp,它存在于很多控制果蝇早期发育基因中,在高等生物中也发现了相关基序。HD的C-端区域和原核阻遏蛋白的HTH同源,但也有几点不同:(1)HD的C端由3个α-螺旋构成,螺旋3结合于大沟,长17aa;而阻遏蛋白由5个α-螺旋构成,螺旋3长仅9个aa;(2)原核的HTH的以二聚体形式与DNA结合,靶序列是回文结构,而HD是以单体形式与DNA结合,靶序列不是回文结构;(3)HDN-端的臂位于小沟,而HTH螺旋1的末端与DNA的背面接触。

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第38页:蛋白质和配基的结合甾类受体蛋白

(二)蛋白质和配基的结合甾类受体蛋白一般都具有3个不同的功能区:(1)N-端区是激活转录所需的区域,不同受体之间此区的同一性仅小于15%;(2)DNA结合及转录活化区,同一性较高为94-42%;(3)C-端的激素结合和二聚体形成区,同一性为57-15%。

第39页:

第40页:

第41页:第41页内容要点

(二) 蛋白质之间的相互作用酵母半乳糖代谢中GAL80和GAL4的相互作用:酵母半乳糖代谢调控和gal操纵中的调控形式是完全不同的:(1)被调节的基因多位于不同的染色体上;(2)负调节蛋白GAL80不直接和DNA结合,而是和GAL4结合,占据其功能域来阻遏转录的;(3)作为正调节因子不仅需要半乳糖作为诱导物,还需要GAL4蛋白作为转录因子,它不是像原核中的正调节蛋白仅和操纵子中的操纵基因结合,使整个基因簇得以转录,而是分别和各个被调节基因上游元件UAS结合,促进转录。

第42页:

第43页:

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第47页:第六节转录起始和加工的调节

第六节转录起始和加工的调节

  • 第六节转录起始和加工的调节
  • 一. 转录起始的选择
  • 酵母蔗糖酶基因,有6个基因(Suc1~5,7)位于不同的染色体上。每一个基因都可以转录合成蔗糖酶,但有胞内酶和胞外酶两种不同形式。
  • 前者的合成不受葡萄糖存在的影响,但含量低;
  • 后者的合成受到葡萄糖的抑制。

第48页:两种酶的结构相似

两种酶的结构相似

  • 两种酶的结构相似,
  • 胞外酶仅多了信号序列,经切除后胞外酶比胞内酶在N-端仅多了一个Ser
  • 经分析发现Suc-2基因有3个TATA框,但尚不清楚和2种酶的关系,也没有确定是否存在cAMP-CAP位点。

第49页:

第50页:选择性加工

二.选择性加工(一) 不同5′端的选择(二) 选择不同的3′端(三) 选择不同外显子

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第54页:第七节翻译的调控

第七节翻译的调控

  • 第七节翻译的调控
  • 一.mRNA运输控制(transportcontrol)是对转录本从细胞核运送到细胞质中的数量进行调节;
  • 二.mRNA翻译的控制
  • 三.mRNA的结构和翻译的效率
  • 四.翻译的起始调节
  • 五.选择性翻译
  • 六.反义RNA调控
  • 七.翻译的自我调节

第55页:

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第57页:α和β珠蛋白的合成

α和β珠蛋白的合成。(P221)在二倍体细胞中都有4个α-珠蛋白基因,它们之间的浓度比应是α:β=2:1,而实际上是1:1在无细胞系统中加入等量的αmRNA和βmRNA和少量的起始因子,结果合成的α-珠蛋白仅占3%。当加入过量的起始因子时α珠蛋白和β珠蛋白之比为1.4:1,接近1:1,表明翻译起始因子和两种mRNA的亲和性不同。

第58页:第八节细胞周期的调控

  • 第八节细胞周期的调控
  • 真核生物细胞有丝分裂周期有两个关键的过程:一.细胞周期与调节“起点”(start),M期进入限制点(commitment to M phase)成熟促进因子。(muturior promoting factor,MPF)。后又称为M期促发因子(M-phase puomoting factor,MPF)。周期蛋白(cyclin)

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第61页:在M期活化的p34-cycinB可以使

在M期活化的p34-cycinB可以使下面一组蛋白磷酸化(1)使层连蛋白(Lamins)磷酸化,使得细胞在分裂期核模解体;(2)使组蛋白H1磷酸化,导致染色体的凝聚;(3)使微管蛋白磷酸化,导致细胞骨架的重新组合,为细胞分裂做好准备;(4)使泛蛋白连接酶体系(Ubiquitinligasesystem)磷酸化,此即是依赖泛素的蛋白水解酶,它们经磷酸化激活后可使Cyclin-B的降解,促进细胞进入G0/G1。

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第65页:p34的Ser217被磷酸化

p34的Ser217被磷酸化

  • p34的Ser217被磷酸化,p34-cyclinA活化,具有丝/苏氨酸蛋白激活性,能激活某些转录因子,使这些因子能与细胞周期盒序列(ACGCGTNA)相结合,起动与DNA复制有关的基因群:
  • cdc6编码DNA合成酶
  • cdc8编码胸苷激酶
  • cdc9编码DNA连接酶
  • cdc21编码胸苷酸合成酶。
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