页数:65页文件大小:849.5 KB来源: 现代遗传学ppt课件
本课件围绕染色质水平的调控展开,按课件原有章节顺序组织,逐页给出页面图示与对应的文字版内容,概念、术语与数据保留原始表述,便于对照原课件按章节检索、备课与复习。
第三节染色质水平调控
莱昂假说
1.无汗性外胚层发育不良(anhidrotic ectodermal dysplasia)2.三色猫3. G-6-PDH二. 组蛋白与非组蛋白三.DNase的敏感性和基因的表达高泳动蛋白(high-mobility group,HMG)HMG14 和HMG17四. 座位控制区(locus control region ,LCR)特化染色质结构(specialized cromatin structures, SCSor SCS‘ )隔离子或绝缘子(insulator)
染色质的占先模型提出:如在启动子上已形成了核小体,那么转录因子和RNA聚合酶是不能和启动子结合的;如转录因子和RNA聚合酶在启动子上已建立了稳定的起始复合体,那么组蛋白将被排除在外。
(2)动态模型(dynamic model)近来研究表明:组蛋白置换需输入能量。一些转录因子结合DNA时可裂解核小体,或建立一个可产生核小体定位结合位点的边界。如果蝇Hsp70启动子上的核小体在体外实行重建。GAGA(细胞核结合蛋白)转录因子与启动子中4个富含(CT)n位点结合,破坏了核小体,形成一高敏感区,而且导致邻接的核小体重排,这样它们就优先插入到随机位点。核小体打开的过程是需要水解ATP的耗能过程。
染色质的转录模型依赖于那些通过水解ATP提供能量,从特异DNA序列取代核小体的因子
组蛋白的乙酰化和去乙酰化控制染色活
辅激活因子可能有HAT乙酰化核小体组蛋白尾巴的活性
Pc-G蛋白不起始阻遏,但可维持阻遏
用DNAaseI来鉴别基因的活性
在成体的红细胞
五.大范围调节与功能区的隔离LCR(locus control region)5’端调控位点,起初级调控作用,它即是一簇超敏感位点。HS4
(specialized chromatinsructures)
. 核基质蛋白核基质(nuclear matrix)骨架蛋白(scaffolding protein)核基质结合区(matrix association,MAR)骨架附着区(scaffold attached region,SAR)限定子(delimiter)绝缘体(insulators)
(Matrix attachment site)
第四节DNA水平的调控一. DNA的甲基化与去甲基化
亲本印记
亲本的IGF-Ⅱ等位基因在早期胚中被差异甲基化,在成体形成配子时仍保留原甲基化的模式。
第五节转录水平的调控一.顺式作用元件和反式作用因式元件:(1) 核心启动子成分,如TATA 框;(2) 上游启动子分,如CAAT框,GC框;(3) 远上游顺序:如增强子,减弱子、静息子,酵母的UAS (upstreamactivator sequences)等。(4) 特殊细胞中的启动子成分:如淋巴细胞中的Oct (octamer)和κB。
反式作用因子可以分为3类;(1)通用反式作用因子,,主要识别启动子的核心启动成分,如TBP;(2)特殊组织与细胞中的反式作用因子,如淋巴细胞中的Oct-2;(3)和反应性元件(responseelenents)相结合的反式作用因子。如HSE(热休克反应元件,heatshockresponseelement),GRE(糖皮质激素反应元件glucocorticoidresponseelement);MRE(金属反应元件,metalresponseelement);TRE(肿瘤诱导剂反应元件,tumorgenicagentresponseelement);
(一)蛋白质直接和DNA结合1.螺旋转角螺旋(Helix-turn-helix,HTH):如LacO的R蛋白,λ的CI,Cro蛋白,涉及酵母交配型的a1和a2蛋白。真核生物中的Oct-1和Oct-2;2.锌指结构(zinc fimger)单个的锌指保守序列是:Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X2-His Ⅰ型:2Cys/2His:TFIIIA,SP1Ⅱ型:2cys/2cys:GAL4
5.同源异形结构域(Homeodomains,HD)是一种编码60aa的序列,长180bp,它存在于很多控制果蝇早期发育基因中,在高等生物中也发现了相关基序。HD的C-端区域和原核阻遏蛋白的HTH同源,但也有几点不同:(1)HD的C端由3个α-螺旋构成,螺旋3结合于大沟,长17aa;而阻遏蛋白由5个α-螺旋构成,螺旋3长仅9个aa;(2)原核的HTH的以二聚体形式与DNA结合,靶序列是回文结构,而HD是以单体形式与DNA结合,靶序列不是回文结构;(3)HDN-端的臂位于小沟,而HTH螺旋1的末端与DNA的背面接触。
(二)蛋白质和配基的结合甾类受体蛋白一般都具有3个不同的功能区:(1)N-端区是激活转录所需的区域,不同受体之间此区的同一性仅小于15%;(2)DNA结合及转录活化区,同一性较高为94-42%;(3)C-端的激素结合和二聚体形成区,同一性为57-15%。
(二) 蛋白质之间的相互作用酵母半乳糖代谢中GAL80和GAL4的相互作用:酵母半乳糖代谢调控和gal操纵中的调控形式是完全不同的:(1)被调节的基因多位于不同的染色体上;(2)负调节蛋白GAL80不直接和DNA结合,而是和GAL4结合,占据其功能域来阻遏转录的;(3)作为正调节因子不仅需要半乳糖作为诱导物,还需要GAL4蛋白作为转录因子,它不是像原核中的正调节蛋白仅和操纵子中的操纵基因结合,使整个基因簇得以转录,而是分别和各个被调节基因上游元件UAS结合,促进转录。
第六节转录起始和加工的调节
两种酶的结构相似
二.选择性加工(一) 不同5′端的选择(二) 选择不同的3′端(三) 选择不同外显子
第七节翻译的调控
α和β珠蛋白的合成。(P221)在二倍体细胞中都有4个α-珠蛋白基因,它们之间的浓度比应是α:β=2:1,而实际上是1:1在无细胞系统中加入等量的αmRNA和βmRNA和少量的起始因子,结果合成的α-珠蛋白仅占3%。当加入过量的起始因子时α珠蛋白和β珠蛋白之比为1.4:1,接近1:1,表明翻译起始因子和两种mRNA的亲和性不同。
在M期活化的p34-cycinB可以使下面一组蛋白磷酸化(1)使层连蛋白(Lamins)磷酸化,使得细胞在分裂期核模解体;(2)使组蛋白H1磷酸化,导致染色体的凝聚;(3)使微管蛋白磷酸化,导致细胞骨架的重新组合,为细胞分裂做好准备;(4)使泛蛋白连接酶体系(Ubiquitinligasesystem)磷酸化,此即是依赖泛素的蛋白水解酶,它们经磷酸化激活后可使Cyclin-B的降解,促进细胞进入G0/G1。
p34的Ser217被磷酸化
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