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04-1 实验四 植物DNA的提取.pptx

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本课件讲解CTAB法提取植物基因组DNA:先以液氮研磨破碎细胞,用CTAB分离缓冲液溶解DNA,再经氯仿-异戊醇抽提去除蛋白质,异丙醇沉淀、70%乙醇洗涤后溶于TE缓冲液;并说明DNA降解的理化与酶学因素,以及A260/A280紫外吸收法纯度与浓度鉴定。

实验四植物DNA提取与鉴定章节封面,标示本实验采用CTAB法从植物叶片提取基因组DNA并进行鉴定
实验原理首页,说明真核生物DNA与蛋白质结合成核蛋白存在于细胞核内,研磨破坏细胞壁膜即可释放核蛋白
核蛋白溶解度对照图,比较浓氯化钠与稀氯化钠溶液中DNA核蛋白和RNA核蛋白溶解度的相反变化
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第1页:实验四 植物DNA的提取与鉴定

实验四 植物DNA的提取与鉴定

第2页:核蛋白与研磨释放

  • 真核生物DNA与蛋白质结合,以核蛋白的形式存在于细胞核内。
  • 在提取DNA时,通过研磨破坏细胞壁和细胞膜,释放出核蛋白。

第3页:氯化钠浓度分级抽提

  • 在浓氯化钠溶液(1~2mol/L)中,DNA核蛋白的溶解度很大,RNA核蛋白的溶解度很小。
  • 在稀氯化钠溶液(0.14mol/L)中,DNA核蛋白的溶解度很小,RNA核蛋白的溶解度很大。
  • 利用不同浓度氯化钠溶液可将DNA核蛋白或RNA核蛋白从样品中分别抽提出来。

第4页:去除蛋白质的方法

  1. 在核蛋白溶液中加入氯仿-异戊醇,振荡使蛋白质乳化变性,再离心除去变性蛋白质。
  2. 用十二烷基硫酸钠(SDS)等去污剂使蛋白质变性,与核酸分离,从材料中提取出DNA。
  3. 用苯酚处理,然后离心分层,蛋白变性后则停留在酚层内。

第5页:破坏DNA完整结构的因素

化学因素
核酸在pH4.0~11.0稳定,否则就变性降解。
物理因素
DNA是长链线状分子,强机械作用会使DNA分子断裂。
酶的作用
DNA酶会降解DNA分子。

第6页:紫外吸收法鉴定纯度与浓度

  • 核酸的紫外吸收峰为260nm,蛋白质为280nm。
  • DNA的A260/A280约1.8,RNA的约2.0。
  • 1μg/mL的DNA溶液吸光度A260=0.020;1μg/mL的RNA溶液A260=0.022~0.024。
  • 1.0个A260相当于50μg/mL的DNA、40μg/mL的RNA。

第7页:实验步骤

实验步骤:依次为CTAB缓冲液预热与液氮研磨、65℃保温、氯仿-异戊醇抽提离心、异丙醇沉淀与洗涤、DNA溶解与纯度鉴定。

第8页:细胞破碎与抽提

  1. 10mL CTAB分离缓冲液加入50mL离心管中,在65℃水浴中预热。
  2. 取剪碎的植物叶片适量,置于预冷的研钵中,倒入液氮,尽快将叶片研碎。
  3. 将约1g叶片粉末加入预热的CTAB分离缓冲液中,轻轻转动混匀,65℃保温30分钟。
  4. 加10mL氯仿-异戊醇(24︰1),轻轻混匀。
  5. 室温,4000rpm离心10分钟。

第9页:沉淀洗涤与溶解

  1. 用一开口较大的滴管将上层水相吸入另一干净的50mL离心管中,加入等体积的异丙醇,轻轻混匀,使核酸沉淀下来。
  2. 用玻璃棒将丝状DNA搅起,转移至10mL 70%乙醇中,浸泡洗涤10分钟。
  3. 用玻璃棒取出DNA沉淀,室温下干燥。
  4. 将DNA沉淀溶于0.5mL TE缓冲液中。

第10页:DNA纯度与浓度鉴定

  1. 取100μL DNA溶液(剩余DNA溶液放在-20℃保存)。
  2. 用TE缓冲液稀释20、50和100倍。
  3. 测定A260和A280。
  4. 根据A260/A280判断DNA纯度。
  5. 计算提取的DNA总量。

第11页:试剂

试剂:包括CTAB分离缓冲液、异丙醇、氯仿-异戊醇、液氮、70%乙醇与TE缓冲液。

第12页:CTAB分离缓冲液配方

  • 2% CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)。
  • 1.4mol/L NaCl。
  • 20mmol/L EDTA。
  • 100mmol/L Tris-HCl(pH8.0)。
  • 0.2%巯基乙醇。

第13页:CTAB的作用特点

  • CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是阳离子去污剂,不仅能使蛋白质变性,还能与核酸形成特异的核酸-CTAB复合物。
  • 核酸-CTAB复合物可溶于≥0.7mol/L NaCl的高盐缓冲液。

第14页:有机溶剂与洗涤液

  • 异丙醇:用于沉淀核酸。
  • 氯仿-异戊醇(24︰1):用于抽提去除蛋白质。
  • 液氮:用于冷冻研磨破碎植物细胞。
  • 70%乙醇:用于洗涤DNA沉淀。

第15页:TE缓冲液配方

  • 10mmol/L Tris-HCl(pH7.4)。
  • 1mmol/L EDTA。

用于溶解并保存提取得到的DNA。

第16页:思考题

  1. 本实验中CTAB、EDTA、巯基乙醇的作用是什么?
  2. 吸取样品、抽提应注意什么?为什么?
  3. 提取DNA时除去蛋白质的方法有哪些?
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