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05-1 实验五 DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳.pptx

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本课件介绍限制性内切酶识别双链DNA特异位点并切开的原理,列出EcoR I与Hind III的识别序列与37℃、pH7.5~8.0反应条件;说明琼脂糖浓度与DNA分离范围对应关系,并给出酶切体系、制胶、点样、150V电泳、EB染色与紫外观察的完整流程。

实验五DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳章节封面,标示本实验含酶切与电泳鉴定两项内容
限制性内切酶标题页,引出EcoR I与Hind III两种酶的识别序列与切割位点
EcoR I识别序列图,显示GAATTC六碱基回文序列及其在G与A之间的 staggered 切割位点
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第1页:实验五 DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳

实验五 DNA限制性酶切和琼脂糖凝胶电泳

第2页:限制性内切酶

限制性内切酶:能够识别双链DNA上的特定位点并切开DNA,是基因操作不可缺少的工具酶。

第3页:EcoR I 识别序列

EcoR I Restriction Enzyme:识别序列为

------G↓AATT C------
------C TTAA↓G------

即在G与A之间切开,产生互补的黏性末端。

第4页:Hind III 识别序列

Hind III Restriction Enzyme:识别序列为

------A↓AGCT T------
------T TCGA↓A------

即在第一个A与第二个A之间切开,产生互补的黏性末端。

第5页:酶切反应条件

每一种限制性内切酶都有特定的反应条件:

pH范围
7.5~8.0。
缓冲液组份
Tris(三羟甲基氨基甲烷)、NaCl、MgCl2、巯基乙醇。
温度
37℃。

第6页:琼脂糖凝胶电泳

琼脂糖凝胶电泳是一种简便、快速的分离纯化和鉴定核酸的方法。琼脂糖是一种线性多糖聚合物,琼脂糖粉末加热到熔点后冷却凝固,会形成良好的电泳介质。

第7页:电泳的定义

电泳:在电场的作用下,在某种支持介质上,将一个混合物分离成若干条区带的过程。

第8页:琼脂糖浓度与分离范围

琼脂糖凝胶的浓度与DNA分离范围
琼脂糖浓度(%)线型DNA分离范围(Kb)
0.35~60
0.61~20
0.70.8~10
0.90.5~7
1.20.9~6
1.50.2~3
2.00.1~2

原文浓度数值与分离范围分行排列,此处已按浓度由低到高的对应关系还原为两列。

第9页:电泳试剂

TBE电泳缓冲液
45mmol/L Tris-硼酸,1mmol/L EDTA,pH8.0。
加样缓冲液
0.25%溴酚蓝(深蓝色,300bp)、0.25% xylene cyanol FF(天蓝色,2000bp)、40%蔗糖。
EB(溴化乙锭)染色液(有毒)
0.5μg/mL,用水配制。

第10页:溴化乙锭染色

  • 溴化乙锭(ethidium bromide,EB)是一种扁平分子荧光染料,可嵌入核酸的碱基对之间,在紫外线激发下发出桔红色荧光。
  • 电泳结束后,将凝胶浸入0.5μg/mL的EB溶液中染色10min,在紫外光照射下可见核酸电泳带,DNA量一般>5ng。

第11页:操作步骤

操作步骤:酶切反应→制胶→点样→电泳→染色和观察。

第12页:酶切反应体系

酶切反应体系
组分体积
λ-DNA5μL
10×Buffer2μL
Hind III3μL
H2O10μL
Total20μL
反应条件混匀,37℃保温30分钟

第13页:制胶操作

  1. 用电极缓冲液(0.5×TBE)配制0.7%的琼脂糖胶20mL。
  2. 称取0.14g琼脂糖,加20mL 0.5×TBE。
  3. 微波炉加热至沸腾,确定琼脂糖完全溶解。
  4. 冷却至60℃左右。
  5. 准备好梳子和胶槽,倒入琼脂糖溶液,冷却凝固。

第14页:点样安排

点样安排
样品组成点样量
Sample 1自提DNA 5μL+2μL Loading Dye7μL
Sample 2自提DNA酶切液 20μL+4μL Loading Dye10μL
Sample 3λ-DNA 5μL+2μL Loading Dye7μL
Sample 4λ-DNA酶切液 20μL+4μL Loading Dye10μL

第15页:电泳条件

电泳:接通电源,150V电泳0.5小时。

第16页:染色与观察

  1. 切断电源,取出胶模,将凝胶放入EB染色液中,染色10分钟。
  2. 取出凝胶,紫外灯下观察DNA电泳带型。

第17页:EB安全警告

警告

  • EB诱变。
  • 染色和观察时一定要戴手套!

第18页:电泳结果示意图

电泳结果示意(泳道1→4):1 自提DNA;2 自提DNA/Hind III;3 λ-DNA/Hind III;4 λ-DNA。凝胶前方可见RNA条带,提示样品中残留RNA。

第19页:结果记录与分析

结果记录与分析:绘制电泳图谱,记录各泳道DNA条带的位置与数目。

第20页:λ-DNA/HindⅢ标准

  • λ-DNA/Hind III Marker用Hind III彻底降解λ-DNA制得。
  • 贮藏缓冲液:10mmol/L Tris-HCl(pH7.5),10mol/L NaCl,1mol/L EDTA。

第21页:Marker片段大小与带型

λ-DNA/Hind III Markers片段大小
片段序号片段大小(bp)
123130
29416
36557
44361
52322
62027

原文片段数值连写为「23130 9416 6557 4361 2322 2027」,此处按λ-DNA/Hind Ⅲ标准片段大小拆分并按由大到小排列。

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