页数:22页文件大小:369.5 KB来源: 现代生物学实验ppt课件
本课件为《现代生物学实验》的实验八SDS-聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳分离蛋白质部分,依次展开实验八SDS-聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳分、图5不连续系统浓缩效应示意图等内容,并说明目的要求、原理与操作步骤,便于课前预习和实验现
实验八SDS-聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳分离蛋白质
一、目的要求1.学习电泳原理和技术2.学习和掌握SDS-聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳分离蛋白质技术
二、原理聚丙烯酰胺凝胶是由单体丙烯酰胺(acrylamide,简称Acr)和交联剂N,N-甲叉双丙烯酰胺(N,N—methylene-bisacylamide,简称Bis)在加速剂N,N,N,N—四甲基乙二胺(N,N,N,N—tetramethylethylenediamine,简称TEMED)和催化剂过硫酸铵(ammoniumpersulfate(NH4)2S2O8,简称AP)或核黄素(ribofavin即vitaminB2,C17H20O6N4)的作用下聚合交联成三维网状结构的凝胶,以此凝胶为支持物的电泳称为聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamidegelelectrophoresis,简称PAGE)。
聚丙烯酰胺凝胶有下列特性:(1)在一定浓度时,凝胶透明,有弹性,机械性能好;(2)化学性能稳定,与被分离物不起化学反应,在很多溶剂中不溶;(3)对pH和温度变化较稳定;(4)几乎无吸附和电渗作用,只要Acr纯度高,操作条件一致,则样品分离重复性好;(5)样品不易扩散,且用量少,其灵敏度可达10-6g(6)凝胶孔径可调节,根据被分离物的分子量选择合适的浓度,通过改变单体及交联剂的浓度调节凝胶的孔径;(7)分辨率高,尤其在不连续凝胶电泳中,集浓缩、分子筛和电荷效应为一体。因而较醋酸纤维薄膜电泳、琼脂糖电泳等有更高的分辨率。
分子量与凝胶浓度关系表:下表依据源文件文字按原课件列序还原,供对照操作与记录结果使用。
| 物质 | 分子量范围 | 适用的凝胶浓度(%) |
|---|---|---|
| 蛋白质 | <10⁴ | 20-30 |
| 蛋白质 | 1-4×10⁴ | 15-20 |
| 蛋白质 | 1-5×10⁴—1×10⁵ | 10-15 |
| 蛋白质 | 1×10⁵ | 5-10 |
| 蛋白质 | >5×10⁵ | 2-5 |
| 核酸(RNA) | <10⁴ | 15-20 |
| 核酸(RNA) | 10⁴—10⁵ | 5-10 |
| 核酸(RNA) | 10⁵—2×10⁶ | 2-2.6 |
说明:源文件此表为压平文本,上表按原课件列序推断还原;其中「1-5×10⁴—1×10⁵」区间原文粘连较严重,建议对照原课件图片核对。
图1聚丙烯酰胺凝胶圆盘电泳示意图(A为正面,B为剖面)(1)样品胶pH6.7 (2)浓缩胶pH6.7(3)分离胶pH8.9 (4)电极缓冲液pH8.3
图2夹心垂直板电泳槽示意图图3凝胶模示意图1.样品槽模板2.长玻璃板1.导线接头2.下贮槽3.凹形橡胶框4.样品槽模板5.固定螺丝6.上贮槽7.冷凝系统返回
不连续体系由电极缓冲液、浓缩胶及分离胶所组成。浓缩胶是由AP催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为pH6.7的Tris-HC1。分离胶是由AP催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为pH8.9 Tris-HC1。电极缓冲液是pH8.3 Tris-甘氨酸缓冲液。2种孔径的凝胶、2种缓冲体系、3种pH值使不连续体系形成了凝胶孔径、pH值、缓冲液离子成分的不连续性,这是样品浓缩的主要因素。
图4电泳过程示意图A为电泳前3层凝胶排列顺序,3层胶中均有快离子,慢离子B显示电泳开始后,蛋白质样品夹在快、慢离子之间被浓缩成极窄的区带。C显示蛋白质样品分离成数个区带。
图5不连续系统浓缩效应示意图
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE):蛋白质在聚丙烯酰胺凝胶电泳时,它的迁移率取决于它所带净电荷以及分子的大小和形状等因素。如果在丙烯酰胺凝胶系统中加入阴离子去污剂十二烷基磺酸钠(sodiumdodecylsulfate,简称SDS),则蛋白质分子的电泳迁移率主要取决于它的分子量,而与所带电荷和形状无关。因此可以利用SDS-PAGE测定蛋白质分子量。
三、试剂与器材试剂:10%SDS、凝胶贮液(30%ACr-0.8%Bis)、分离胶缓冲液(3.0 mol/L pH8.9Tris-HCl缓冲液)、浓缩胶缓冲液(0.5 mol/L pH6.7Tris-HCl缓冲液)、10%过硫酸铵、10%TEMED、pH8.3Tris-Gly电极缓冲液、1%琼脂糖溶液、0.05%考马斯亮兰R250、7%醋酸器材:垂直板电泳槽、稳压稳流电泳仪、脱色摇床
五、操作方法1.安装夹心式垂直板电泳槽(1)装上贮槽和固定螺丝销钉,仰放在桌面上。(2)将长、短玻璃板分别插到凵形硅橡框的凹形槽中,注意勿用手接触灌胶面的玻璃。(3)将已插好玻璃板的凝胶模平放在上贮槽上,短玻璃板应面对上贮槽。(4)将下贮槽的销孔对准已装好螺丝销钉的上贮槽,双手以对角线的方式旋紧螺丝帽。(5)竖直电泳槽,在长玻璃板下端与硅胶模框交界的缝隙内加入已融化的1%琼脂(糖)。其目的是封住空隙,凝固后的琼脂(糖)中应避免有气泡。
3.制备凝胶板将混合后的分离胶溶液,用细长头的滴管加至长、短玻璃板间的窄缝内,加胶高度距样品模板梳齿下缘约1 cm。用1 mL注射器在凝胶表面沿短玻璃板边缘轻轻加一层重蒸水(约3–4 mm),用于隔绝空气,使胶面平整。约30-60 min凝胶完全聚合,则可看到水与凝固的胶面有折射率不同的界线。将上、下贮槽的蒸馏水倒去,将混合均匀后的浓缩胶溶液,用细长头的滴管加到长、短玻璃板的窄缝内(即分离胶上方),距短玻璃上缘0.5 cm处,轻轻加入样品槽模板.在上、下贮槽中加入蒸馏水,但不能超过短玻璃板上缘。静置电泳槽,10 min左右,上胶即可聚合,再放置10-20 min,加入电极缓冲液,使液面没过短玻璃板约0.5 cm,轻轻取出样品槽模板,即可加样。
5 .电泳将电泳仪的正极与下槽连接,负极与上槽连接,接通冷却水,打开电泳仪开关,开始时电流为10 mA,待样品进入分离胶后,将电流调至20-30 mA,当溴酚蓝染料距硅胶框1 cm时,停止电泳,关闭电源及冷却水。6.染色与脱色电泳结束后,取下凝胶模,卸下硅胶框,用不锈钢药铲或镊子撬开短玻璃板,从凝胶板上切下一角作为加样标记,在两侧溴酚蓝染料区带中心,插入细铜丝作为前沿标记。加入染色液染色1-2h,再用脱色液脱色,直至蛋白质区带清晰,即可计算相对迁移率。
7.结果处理量出加样端距细铜丝间的距离(cm)以及各蛋白质样品区带中心与加样端的距离(cm),按下式计算相对迁移率mR:相对迁移率mR=蛋白质样品距加样端迁移距离(cm)溴酚蓝区带中心距加样端距离(cm)
六、注意事项(1)安装电泳槽时要注意均匀用力旋紧固定螺丝,避免缓冲液渗漏。(2)用琼脂(糖)封底及灌胶时不能有气泡,以免电泳时影响电流的通过。(3)样品中应含一定浓度的蔗糖溶液,目的是用以防止样品因对流而被稀释。(4)加样时样品不能超出凹形样品槽。加样槽中不能有气泡,如有气泡,可用注射器针头挑除。
七、思考题(1)为什么要在样品中加少许溴酚兰和一定浓度的蔗糖溶液?蔗糖及溴酚兰的作用分别是什么?
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