页数:74页文件大小:1.70 MB来源: 有机化学(甲)ppt课件
本课件讲解氨基酸、多肽、蛋白质及核酸,说明氨基酸结构与等电点,梳理多肽与蛋白质的结构层次,并介绍核苷与核酸的组成。并通过等电点计算与结构分析的例题巩固本章重点内容。
第15章氨基酸、多肽、蛋白质及核酸Amino Acids,Peptides,Proteins, and Nucleic Acids
15.1氨基酸L-氨基酸L-甘油醛
Trp
氨基酸的酸性和碱性
有些氨基酸含有两个羧基或两个氨基,因此有三个pKa值。哪个羧基的酸性较强,为什么?
在滴定过程中,当碱的用量达到0.5 mol时,甘氨酸盐酸盐的一半被中和,这时甘氨酸盐酸盐与甘氨酸两性离子的浓度相等,溶液的pH值正好等于pK1
继续滴定,当碱的用量达到1 mol时,溶液中甘氨酸两性离子的浓度达到极大值,分子的净电荷为零,称为等电点,此时溶液的pH值相当于甘氨酸在纯水中的pH值,用pI表示。甘氨酸的pI = 5.97。氨基酸在等电点的溶解度达到极小值,可以结晶出来
当碱的量进一步增加到1.5 mol时,两性离子的一半被中和,此时两性离子与NH2CH2CO2-的浓度相等,溶液的pH值正好等于pK2。碱达到2 mol时,甘氨酸全部转化为NH2CH2CO2-
在pH = 5.5的水溶液中的形式存在:赖氨酸苯丙氨酸谷氨酸pI9.745.48 3.22pK12.18 1.83 2.19pK28.96 9.13 4.25pK310.35--9.67
氨基酸的反应
鉴定α-氨基酸最简便、最迅速的方法
氨基酸的合成(1)α-卤代酸的氨解(2)Gabriel法
(3)Strecker法
氨基酸的拆分
15.2肽(Peptides)
Arg-Pro-Pro-Gly-Phe-Ser-Pro-Phe-Arg舒缓激肽九肽:存在于血浆,与血压的调节有关.
九肽:
1958Nobel Prize in C:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
1958Nobel Prize in ChemistryFrederick Sanger(Great Britain, *13.8.1918)Great Britain, Cambridge University,"fo
r his work on the structure of proteins,especially that of insulin".牛胰岛素是一种51肽,它有两条肽链:A链为21肽,其中含4个半胱氨酸残基,B链为30
肽,有2个半胱氨酸残基,它们通过两个二硫键“桥”连接起来,分子量5700道尔顿,1953年确定全部化学结构.
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胰岛素是人和动物胰脏中分泌出来的一种激素,它能够增加肝、肌肉和脂肪细胞膜的通透性,促进葡萄糖等物质从细胞外向细胞内转运,加速了葡萄糖的代谢,使血糖水平降低,因此胰岛素已被用来治疗糖尿病。胰岛素的相对分子质量约为6 0000,应只是一个多肽,但也被认为是一个最小的蛋白质
15.3蛋白质(Proteins)(1)蛋白质的一级结构:肽链中氨基酸的连接顺序,它决定着蛋白质的高级结构及蛋白质的性质及生物功能。(2)蛋白质的二级结构:
(a)α-螺旋(b)β-折叠片常见的蛋白质二级结构
(3)蛋白质的三级结构:肌红蛋白的三级结构在血红素辅基的附近有一个组氨酸残基,其咪唑环的氮能与血红素中的亚铁配位,而血红素的卟啉环上的两个羧基侧链可与附近肽链上的官能团形成氢键
血红素的亚铁原子有6个配位的位置,其中5个与卟啉环和咪唑环上的氮配位,另一个位置则可与氧分子配位,这一结构特征赋予肌红蛋白储存氧的生理功能
Molecular channels l:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
Molecular channels let us enter the chemistry of the cellA side view of a pore (bluedots) in the water-channel
protein AQP1, whichpierces the cell membrane.Cell exterior is at top,interior at bottom. The poreis about 2.8
angstromsacross at its narrowest.From outside the cell, thefour units of the water-channel protein AQP1 arevis
ible, each with a pore thatpenetrates the cellmembrane.水通道蛋白
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离子通道
2003年诺贝尔化学奖获得者:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
2003年诺贝尔化学奖获得者(8 October 2003)Peter AgreJohns Hopkins University School ofMedicine,Baltimore, USA“for the disc
overy of water channels”Roderick MacKinnonHoward Hughes Medical Institute, The RockefellerUniversity, New York
, USA“for structural and mechanistic studies of ionchannels”.
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氨基酸序列测定(1)氨基酸分析测定氨基酸序列,首先需要知道肽链上含有那些氨基酸以及它们的含量。通常,将纯化后的多肽用6 mol/L HCl在110oC加热24小时,使其完全水解,生成各种游离氨基酸的混合物,然后用离子交换色谱分析氨基酸混合物中各氨基酸的品种及其相对含量
离子交换色谱的色谱柱中装有含羧酸根或磺酸根离子的离子交换树脂,将氨基酸混合物装在色谱柱上端,用不同pH的弱酸性缓冲溶液洗脱,不同结构的氨基酸以不同的速度从色谱柱下端流出,流出液经水合茚三酮显色后用分光光度计检测,自动记录得到色谱图,根据色谱图上各吸收峰的相对位置和面积可确定出氨基酸的品种和相对含量
目前使用的氨基酸自动分析仪就是根据这一原理设计的
(2)N-端氨基酸的测定——Edman降解法
(3)C-端氨基酸的测定C-端氨基酸可用羧肽酶选择性地从肽链上水解下来。羧肽酶只能切断与游离羧基相邻的肽键,因此,在多肽和羧肽酶的水溶液中,首先出现的游离氨基酸就是C-端的第一个氨基酸。去掉一个氨基酸后剩下的多肽可继续水解,依次产生出C-端的第二、第三和第四个氨基酸
这样根据氨基酸出现的时间,即可推断C-端氨基酸的顺序。实际上,此方法最多只能测定3~4个C-端氨基酸
(4)肽链的部分水解在酶催化下,肽链可在特定的位置断裂,生成部分水解产物,从而使一个长的肽链分解为许多小的短肽。例如,胰蛋白酶是胰岛分泌出的一种促进消化的酶,它能够选择性地水解肽链上赖氨酸和精氨酸的羧羰基处的肽键。糜蛋白酶则能够选择性地水解苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的羰基处的肽键
使用不同的酶,将长的肽链部分水解为不同的小肽,然后分离这些小肽,再进行上述的氨基酸分析、N-端分析和C-端分析,这样多次地重复分析,并对获得的结果进行“拼接”,可以得到整个肽链的氨基酸顺序
多肽的合成(1)氨基的保护苄氧羰基(Cbz或Z)
叔丁氧羰基Boc试剂(二碳酸双叔丁酯)
(2)羧基的保护
(3)肽键的生成——DCC法
(3)肽键的生成——活化酯法
牛胰岛素的人工合成1965年我国的上百位化学工作者在汪猷院士领导下,经过6年多坚持不懈的努力,获得了人工全合成牛胰岛素晶体。这是世界上第一个人工合成的蛋白质
多肽的固相合成Merrifield树脂
固相合成法的优点:①可以用过量的试剂,从而使反应能够更快和更有效地进行。②多余的试剂、副产物和溶剂容易洗涤除去,因此合成操作简便、省时。③可实现自动化合成
Merrifield树脂:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
Merrifield树脂1984Nobel Prize in ChemistryRobert Bruce MerrifieldRockefeller University, New York, USA"for his d
evelopment of methodology forchemical synthesis on a solid matrix".1962年Merrifield发明了固相多肽合成技术——
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1969年Merrifield用自动化的多肽合成仪合成了一种124肽——核糖核酸酶,整个过程含369个反应和11391步操作,只用了6周时间
AutoSpot多肽合成仪CS936S中试生产型多肽合成仪
SYMPHONY型12通道多肽合成仪
J. AM. CHEM. SOC.200:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
J. AM. CHEM. SOC.2004,126, 1377-1383.Total Chemical Synthesis of CrambinMolecular structure of crambin, a smal
l (46 amino acids)protein isolated from seeds of the plantCrambe abyssinica.Positions of the disulfides are sh
own in yellow.蛋白质合成实例
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Target crambin amino:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
Target crambin amino acid sequences: the "SI" form has Ser22and Ile25; the "PL"form has Pro22and Leu25. In the
latter case, a Val15-Ala substitution was made in thetarget sequence at the Val15-Cys16ligation site to preem
pt anticipated slow reactionarising from the-branched nature of the C-terminal residue in the Cram[1-15]thioes
ter segmentJ. AM. CHEM. SOC.2004,126, 1377-1383.
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Synthetic Strategy for the Preparation of Crambin byLigationofTwo Peptide SegmentsJ. AM. CHEM. SOC.2004,126, 1377-1383.
Synthetic Strategy for the Preparation of Crambin by Ligation ofThree Peptide SegmentsJ. AM. CHEM. SOC.2004,126, 1377-1383.
Semisynthesis and Fo:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
Semisynthesis and Folding of the Potassium Channel KcsAStructure of KcsA, a 160-amino acid protein.(A)Shown is
a side-on view of the tetrameric KcsA fragment (residues 1-125)used in these studies.(B)Two opposite subunits
of the KcsA tetramer are shown. Residues 75-79comprising the selectivity filter are shown in ball-and-stick r
epresentation.J. AM. CHEM. SOC.2002,124, 9113-9120
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The ligation of expressed protein :J. AM. CHEM. SOC.2002,124, 9113-9120
J. AM. CHEM. SOC.2002,124, 9113-9120
Synthesis of Peptide:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
Synthesis of Peptides and Proteins without Cysteine Residues byNative Chemical Ligation Combined with Desulfur
izationJ. Am. Chem. Soc.2001,123,526-533H2, Pd/Al2O3or H2, Raney Ni
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J. Am. Chem. Soc.2001,123,526-533Synthesis of Peptide Antibiotic Microcin J25, the 56-aminoacid streptococcal protein GB1 domain.
15.4核酸
尿嘧啶胞嘧啶胸腺嘧啶腺嘌呤鸟嘌呤Uracil (U) Cytosine (C) Thymine (T) Adenine (A) Guanine (G)核糖2-脱氧核糖Ribose 2-Deoxyribose
核苷胞嘧啶核苷腺嘌呤脱氧核苷
核酸的一级结构
核酸的二级结构
The Nobel Prize in P:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
The Nobel Prize in Physiology or Medicine 1962Francis Harry Compton Crick(1916-)United KingdomInstitute of Mol
ecular BiologyCambridge, United KingdomJames Dewey Watson(1928-)USAHarvard UniversityCambridge, MA, USA"for th
eir discoveries concerning the molecularstructure of nucleic acids.”
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(自下向上复制)DNA的半保留复制
中心法则转录翻译逆转录
第一位核苷酸第二位核苷酸第三位核苷酸UC:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
第一位核苷酸第二位核苷酸第三位核苷酸UCAGU苯丙氨酸苯丙氨酸亮氨酸亮氨酸丝氨酸丝氨酸丝氨酸丝氨酸酪氨酸酪氨酸终止号终止号半胱氨酸半胱氨酸终止号色氨酸UCAGC亮氨酸亮氨酸亮氨酸亮氨酸脯氨酸脯氨酸脯氨酸脯氨酸组氨酸组氨酸
谷氨酰胺谷氨酰胺精氨酸精氨酸精氨酸精氨酸UCAGA异亮氨酸异亮氨酸异亮氨酸甲硫氨酸苏氨酸苏氨酸苏氨酸苏氨酸天冬酰胺天冬酰胺赖氨酸赖氨酸丝氨酸丝氨酸精氨酸精氨酸UCAGG缬氨酸缬氨酸缬氨酸缬氨酸丙氨酸丙氨酸丙氨酸丙氨酸天冬
氨酸天冬氨酸谷氨酸谷氨酸甘氨酸甘氨酸甘氨酸甘氨酸UCAG遗传密码字典
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中心法则转录翻译逆转录先有核酸还是先有蛋白质?
1989Nobel Prize in C:本页以图示与数据为主,提取文字如下。
1989Nobel Prize in ChemistryThe Prize was awarded jointly to:Sidney Altman(Canada, *8.5.1939)USA, Yale Univers
ity, New Haven, CT,andThomas Robert Cech(USA, *8.12.1947)USA, University of Colorado, Boulder, CO,"for their d
iscovery of catalytic properties ofRNA".
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胸腺嘧啶脱氧核苷Zidovudine(AZT,ZDV,齐多夫定)核苷类逆转录酶抑制剂。阻止了磷酸二酯键形成
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